More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3049 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_3049  glutamine synthetase, catalytic region  100 
 
 		 464 aa  951    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.486199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1568  L-glutamine synthetase  96.77 
 
 		 468 aa  922    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.719328  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0219  glutamine synthetase, catalytic region  96.77 
 
 		 464 aa  922    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0887  glutamine synthetase catalytic region  53.04 
 
 		 459 aa  467  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  47.56 
 
 		 455 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72850  putative glutamine synthetase  47.33 
 
 		 455 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  46.55 
 
 		 455 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  46.44 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  46.44 
 
 		 459 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  46.44 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1118  glutamate--ammonia ligase  43.93 
 
 		 463 aa  389  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.770456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  46.55 
 
 		 454 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  47.02 
 
 		 454 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3952  glutamine synthetase catalytic region  44.03 
 
 		 459 aa  381  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  46.55 
 
 		 454 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  44.44 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  45.25 
 
 		 454 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  45.45 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5184  glutamine synthetase, putative  41.92 
 
 		 458 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  42.14 
 
 		 458 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  41.48 
 
 		 458 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  41.92 
 
 		 458 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  41.7 
 
 		 458 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  41.27 
 
 		 458 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  41.27 
 
 		 458 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  42.6 
 
 		 458 aa  365  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  45.23 
 
 		 471 aa  364  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  41.19 
 
 		 458 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  41.3 
 
 		 460 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3247  glutamine synthetase  41.41 
 
 		 458 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0341  L-glutamine synthetase  40.87 
 
 		 459 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0727612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  40.97 
 
 		 458 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38140  putative glutamine synthetase  41.41 
 
 		 458 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  40.43 
 
 		 460 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  40.43 
 
 		 460 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  40.43 
 
 		 460 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  41.19 
 
 		 458 aa  347  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  38.31 
 
 		 456 aa  335  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  41.38 
 
 		 451 aa  332  6e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  38.79 
 
 		 461 aa  323  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  39.5 
 
 		 444 aa  320  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2336  glutamine synthetase catalytic region  39.55 
 
 		 466 aa  311  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  40.04 
 
 		 453 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2068  glutamate--putrescine ligase  38.39 
 
 		 472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1939  glutamate--putrescine ligase  37.56 
 
 		 472 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.23252 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2349  glutamine synthetase catalytic region  37.33 
 
 		 472 aa  300  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582872  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2328  glutamine synthetase catalytic region  37.33 
 
 		 472 aa  300  3e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1506  glutamate--putrescine ligase  37.33 
 
 		 472 aa  300  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1825  glutamate--putrescine ligase  37.33 
 
 		 472 aa  300  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546478 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3216  glutamine synthetase catalytic region  38.31 
 
 		 472 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0110604 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01274  gamma-Glu-putrescine synthase  37.33 
 
 		 472 aa  300  5e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.798701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01285  hypothetical protein  37.33 
 
 		 472 aa  300  5e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1412  glutamate--putrescine ligase  37.33 
 
 		 472 aa  299  6e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1533  glutamate--putrescine ligase  37.33 
 
 		 472 aa  298  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00464  gamma-glutamylputrescine synthetase  39.64 
 
 		 459 aa  296  5e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.446878  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  38.03 
 
 		 443 aa  289  7e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2416  glutamine synthetase catalytic region  36.97 
 
 		 455 aa  285  9e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175652 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0866  glutamate--putrescine ligase  39.06 
 
 		 445 aa  282  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0375  L-glutamine synthetase  38.62 
 
 		 445 aa  280  5e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2019  glutamate--ammonia ligase  38.62 
 
 		 445 aa  280  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0584  glutamine synthetase catalytic region  37.84 
 
 		 465 aa  273  5.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1127  L-glutamine synthetase  37.83 
 
 		 479 aa  270  5e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.278504  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1406  glutamine synthetase  35.98 
 
 		 451 aa  256  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.483277  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  36.96 
 
 		 439 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0951  glutamine synthetase catalytic region  37.01 
 
 		 450 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1100  Glutamate--putrescine ligase  36.55 
 
 		 458 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2027 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0777  glutamine synthetase  37.47 
 
 		 456 aa  241  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  36.36 
 
 		 445 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1901  L-glutamine synthetase  34.08 
 
 		 454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.643842  normal  0.247036 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2864  glutamate--ammonia ligase  33.18 
 
 		 459 aa  234  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.149371 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1739  glutamate--putrescine ligase  33.26 
 
 		 454 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000378796 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  35.45 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0350  glutamate--ammonia ligase  33.56 
 
 		 455 aa  231  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0380504  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  35.45 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  35.45 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2201  glutamate--ammonia ligase  35.6 
 
 		 445 aa  229  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2079  glutamate--putrescine ligase  35.6 
 
 		 445 aa  229  9e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5473  L-glutamine synthetase  35 
 
 		 445 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6419  glutamate--putrescine ligase  33.79 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5914  glutamate--ammonia ligase  34.02 
 
 		 444 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5549  glutamate--ammonia ligase  34.02 
 
 		 444 aa  226  9e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  32.05 
 
 		 456 aa  225  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0389  glutamine synthetase  33.48 
 
 		 452 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4867  glutamate--ammonia ligase  32.39 
 
 		 452 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0918007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03880  glutamine synthetase  33.26 
 
 		 452 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5407  L-glutamine synthetase  32.39 
 
 		 452 aa  224  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000279947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5309  glutamine synthetase  32.39 
 
 		 452 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2355  glutamine synthetase family protein  34.31 
 
 		 444 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3148  glutamine synthetase, putative  32.53 
 
 		 452 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0656  glutamine synthetase family protein  34.31 
 
 		 456 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2930  glutamine synthetase family protein  34.31 
 
 		 444 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1669  glutamine synthetase family protein  34.31 
 
 		 444 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0342  L-glutamine synthetase  33.03 
 
 		 452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2566  glutamate--putrescine ligase  32.53 
 
 		 452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2707  glutamate--putrescine ligase  32.09 
 
 		 452 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210959  normal  0.606055 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2711  glutamine synthetase catalytic domain  34.09 
 
 		 444 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0825  glutamate--ammonia ligase  32.41 
 
 		 456 aa  220  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.951182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3572  glutamate--putrescine ligase  33.26 
 
 		 444 aa  219  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.701465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2788  glutamine synthetase family protein  34.09 
 
 		 490 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289948  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5090  glutamate--putrescine ligase  32.17 
 
 		 452 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>