More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2677 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2677  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 106 aa  205  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.790603  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  74.04 
 
 		 105 aa  152  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  67.31 
 
 		 105 aa  148  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  70.19 
 
 		 105 aa  148  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  67.31 
 
 		 105 aa  147  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  69.61 
 
 		 104 aa  143  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  67.92 
 
 		 106 aa  142  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  69.23 
 
 		 105 aa  141  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  66.67 
 
 		 103 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  65.69 
 
 		 103 aa  134  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  64.71 
 
 		 103 aa  134  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0342  50S ribosomal protein L24  66.3 
 
 		 105 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  70.59 
 
 		 102 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  68.63 
 
 		 103 aa  132  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  61.54 
 
 		 104 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  68.63 
 
 		 102 aa  132  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  60.58 
 
 		 104 aa  131  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  69.61 
 
 		 102 aa  129  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  59.8 
 
 		 104 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  59.8 
 
 		 104 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1784  50S ribosomal protein L24P  75.73 
 
 		 104 aa  127  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0499077  normal  0.110496 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  59.62 
 
 		 104 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  59.62 
 
 		 104 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  63.46 
 
 		 106 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  59.41 
 
 		 103 aa  123  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  62.38 
 
 		 103 aa  123  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  62.38 
 
 		 103 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  62.38 
 
 		 103 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  62.38 
 
 		 103 aa  123  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  62.38 
 
 		 103 aa  123  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  62.38 
 
 		 103 aa  122  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  62.38 
 
 		 103 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  62.38 
 
 		 103 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  62.38 
 
 		 103 aa  123  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  62.38 
 
 		 103 aa  123  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  58.65 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  62.38 
 
 		 103 aa  123  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  59.05 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  61.54 
 
 		 104 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  59.41 
 
 		 103 aa  121  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  60.58 
 
 		 104 aa  120  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  60.58 
 
 		 104 aa  118  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  56.73 
 
 		 112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  57.14 
 
 		 106 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  59.62 
 
 		 104 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5059  50S ribosomal protein L24  59.62 
 
 		 104 aa  117  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.944884  normal  0.752652 
 
 
-
 
NC_002978  WD0670  50S ribosomal protein L24  60.95 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.077767  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2306  50S ribosomal protein L24  58.65 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0131397  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  57.69 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  62.86 
 
 		 104 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  60 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  60 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  57.43 
 
 		 107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  60.78 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  57 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 		 106 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  60.4 
 
 		 106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  59.05 
 
 		 105 aa  110  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  60.4 
 
 		 106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  61 
 
 		 105 aa  110  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 106 aa  110  8.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  56.73 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0770  50S ribosomal protein L24  58.82 
 
 		 101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal  0.799575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  52.38 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04510  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 105 aa  107  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0040022  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2313  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 105 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.103377  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0296  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 		 101 aa  107  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  57.43 
 
 		 104 aa  107  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 104 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2313  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 105 aa  105  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000126749  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  55.45 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  47.62 
 
 		 108 aa  105  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  56 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 109 aa  105  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0372  50S ribosomal protein L24  57.84 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1726  50S ribosomal protein L24  57.84 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267784  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  53 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  55.67 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  52.38 
 
 		 106 aa  104  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  56.07 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1351  ribosomal protein L24  51.43 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  50.93 
 
 		 109 aa  104  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 		 106 aa  103  6e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  56.07 
 
 		 105 aa  103  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2054  50S ribosomal protein L24  52.34 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00180393  normal  0.0527176 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0348  50S ribosomal protein L24  51.4 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000772359  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1843  50S ribosomal protein L24  51.4 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  59.41 
 
 		 101 aa  103  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  55.45 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 		 102 aa  103  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2523  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 		 101 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  55.45 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3327  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 105 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000922916  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0469  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0224  50S ribosomal protein L24  53.85 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000086996  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  53.77 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>