More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2009 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2009  glycerol kinase  100 
 
 		 495 aa  995    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.904533  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3345  glycerol kinase  60.9 
 
 		 495 aa  619  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1564  glycerol kinase  61.91 
 
 		 494 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18010  putative glycerol kinase  61.3 
 
 		 494 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00302845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2319  glycerol kinase  60.41 
 
 		 493 aa  599  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160007  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  58.82 
 
 		 520 aa  588  1e-166  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2104  glycerol kinase  57.17 
 
 		 501 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.235028  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  55.24 
 
 		 498 aa  572  1.0000000000000001e-162  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4386  glycerol kinase  59.51 
 
 		 496 aa  569  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.248951 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00242  probable carbohydrate kinase  55.94 
 
 		 494 aa  565  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7067  glycerol kinase  57.95 
 
 		 500 aa  567  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.417411 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0382  glycerol kinase  57.43 
 
 		 498 aa  566  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0281  glycerol kinase  58.1 
 
 		 519 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1239  glycerol kinase  59.88 
 
 		 502 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0476  glycerol kinase  56.68 
 
 		 497 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2618  glycerol kinase  59.3 
 
 		 495 aa  564  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  56.39 
 
 		 496 aa  558  1e-158  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1011  glycerol kinase  55.62 
 
 		 501 aa  559  1e-158  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00463589  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4501  glycerol kinase  55.71 
 
 		 497 aa  559  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.212836 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6463  glycerol kinase  58.7 
 
 		 500 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.977008  normal  0.690577 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3683  glycerol kinase  56.8 
 
 		 489 aa  561  1e-158  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.625574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0360  glycerol kinase  57.69 
 
 		 503 aa  560  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0373  glycerol kinase  57.03 
 
 		 498 aa  560  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.177298  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  53.59 
 
 		 496 aa  558  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1598  glycerol kinase  56.73 
 
 		 500 aa  561  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3533  glycerol kinase  57.49 
 
 		 499 aa  559  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.904687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1966  glycerol kinase  59.3 
 
 		 507 aa  559  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1141  glycerol kinase  55.83 
 
 		 514 aa  561  1e-158  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.125497  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  53.99 
 
 		 496 aa  560  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  53.17 
 
 		 496 aa  558  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3131  glycerol kinase  56.39 
 
 		 497 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259303  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0443  glycerol kinase  56.73 
 
 		 498 aa  555  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.59607  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0386  glycerol kinase  57.14 
 
 		 498 aa  557  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.791585  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2859  glycerol kinase  57.4 
 
 		 497 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2002  glycerol kinase  54.69 
 
 		 500 aa  556  1e-157  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3223  glycerol kinase  56.45 
 
 		 497 aa  556  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3953  glycerol kinase  55.74 
 
 		 494 aa  553  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5976  glycerol kinase  57.69 
 
 		 500 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2231  glycerol kinase  56.82 
 
 		 529 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.633532  normal  0.0750986 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3544  glycerol kinase  55.8 
 
 		 500 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  57.29 
 
 		 505 aa  551  1e-156  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3440  glycerol kinase  55.19 
 
 		 494 aa  551  1e-155  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3533  glycerol kinase  55.05 
 
 		 497 aa  550  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0328  glycerol kinase  55.87 
 
 		 497 aa  550  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426539  hitchhiker  0.00844444 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  54.62 
 
 		 496 aa  545  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  52.25 
 
 		 499 aa  546  1e-154  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  56.06 
 
 		 502 aa  545  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  56.44 
 
 		 496 aa  545  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1200  glycerol kinase  57.93 
 
 		 493 aa  547  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.279675  normal  0.769167 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  52.57 
 
 		 496 aa  546  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2704  glycerol kinase  55.69 
 
 		 497 aa  548  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  51.95 
 
 		 496 aa  542  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  54.3 
 
 		 513 aa  541  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2662  glycerol kinase  57.93 
 
 		 493 aa  541  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  51.95 
 
 		 496 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4226  glycerol kinase  57.43 
 
 		 500 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0545781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  51.95 
 
 		 496 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1320  glycerol kinase  58.13 
 
 		 493 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254425  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  51.75 
 
 		 496 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  51.95 
 
 		 496 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3420  glycerol kinase  55.1 
 
 		 519 aa  540  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  53.07 
 
 		 501 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  51.75 
 
 		 496 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  52.16 
 
 		 498 aa  541  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1763  glycerol kinase  56.82 
 
 		 501 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.197449  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  51.75 
 
 		 496 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  52.16 
 
 		 498 aa  541  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  51.75 
 
 		 496 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3525  glycerol kinase  56.58 
 
 		 499 aa  537  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413119  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  55.83 
 
 		 496 aa  535  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  53.37 
 
 		 494 aa  536  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  54.08 
 
 		 494 aa  535  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  53.77 
 
 		 498 aa  537  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2621  glycerol kinase  58.37 
 
 		 504 aa  537  1e-151  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  54.08 
 
 		 494 aa  535  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3665  putative ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  56.43 
 
 		 499 aa  535  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1389  glycerol kinase  52.77 
 
 		 499 aa  531  1e-150  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  52.16 
 
 		 496 aa  532  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  55.62 
 
 		 496 aa  533  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  54.29 
 
 		 494 aa  534  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3316  glycerol kinase  58.45 
 
 		 497 aa  535  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307354  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  50.92 
 
 		 497 aa  535  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  53.88 
 
 		 494 aa  532  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3399  glycerol kinase  54.77 
 
 		 497 aa  531  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  55.74 
 
 		 507 aa  535  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  56.44 
 
 		 501 aa  528  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0342  glycerol kinase  52.86 
 
 		 497 aa  530  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00293212  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1461  glycerol kinase  52.47 
 
 		 499 aa  529  1e-149  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  52.77 
 
 		 493 aa  531  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0273  glycerol kinase  50.92 
 
 		 502 aa  527  1e-148  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  52.67 
 
 		 505 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3678  glycerol kinase  54.36 
 
 		 496 aa  525  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  53.29 
 
 		 500 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2809  glycerol kinase  58.73 
 
 		 497 aa  527  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.507542 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  53.09 
 
 		 500 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  53.59 
 
 		 494 aa  526  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  53.29 
 
 		 500 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  53.39 
 
 		 494 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  53.8 
 
 		 494 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0602  glycerol kinase  56.13 
 
 		 506 aa  525  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>