120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3015 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3015  FF domain protein  100 
 
 		 298 aa  613  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3362  FF domain protein  94.63 
 
 		 298 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3601  FF domain-containing protein  66.67 
 
 		 290 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1791  hypothetical protein  55.67 
 
 		 293 aa  318  7e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000624384 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4877  membrane protein  55.14 
 
 		 293 aa  317  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000561399  normal  0.621694 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2523  hypothetical protein  55.9 
 
 		 304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0560  hypothetical protein  55.9 
 
 		 304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259074  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1345  hypothetical protein  55.9 
 
 		 304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1007  metal-dependent hydrolase  55.9 
 
 		 304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.618942  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4070  metal-dependent hydrolase  54.86 
 
 		 301 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.954367  normal  0.413684 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4017  metal-dependent hydrolase  54.51 
 
 		 301 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279425  normal  0.558393 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1268  hypothetical protein  55.75 
 
 		 298 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1473  hypothetical protein  54.86 
 
 		 304 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3692  metal-dependent hydrolase  54.17 
 
 		 301 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4676  metal-dependent hydrolase  54.17 
 
 		 301 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5624  metal-dependent hydrolase  54.17 
 
 		 301 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1143  metal-dependent hydrolase  53.47 
 
 		 301 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316817  normal  0.181741 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4528  metal-dependent hydrolase  53.82 
 
 		 301 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0169  hypothetical protein  52.48 
 
 		 296 aa  291  8e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1341  hypothetical protein  52.48 
 
 		 296 aa  291  8e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2739  hypothetical protein  52.48 
 
 		 296 aa  291  8e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.910549  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2596  hypothetical protein  52.48 
 
 		 296 aa  291  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0196  hypothetical protein  52.48 
 
 		 296 aa  291  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3737  metal-dependent hydrolase-like protein  51.86 
 
 		 307 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.356192 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1012  hypothetical protein  52.19 
 
 		 284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0555  hypothetical protein  50.66 
 
 		 302 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0628824  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4526  metal-dependent hydrolase-like  51.37 
 
 		 305 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3837  metal-dependent hydrolase-like protein  51.37 
 
 		 305 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0372117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3688  metal-dependent hydrolase-like protein  51.37 
 
 		 305 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.676526  normal  0.405297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2259  metal-dependent hydrolase-like  51.37 
 
 		 307 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0372522  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0463  hypothetical protein  51.77 
 
 		 301 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4904  metal-dependent hydrolase-like protein  53.11 
 
 		 303 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  hitchhiker  0.000304166 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5561  metal-dependent hydrolase-like protein  51.19 
 
 		 307 aa  279  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0906  hypothetical protein  51.79 
 
 		 302 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2610  hypothetical protein  51.79 
 
 		 302 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2472  hypothetical protein  51.79 
 
 		 302 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2446  hypothetical protein  46.62 
 
 		 294 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1177  hypothetical protein  46.62 
 
 		 306 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1250  metal-dependent hydrolase  46.26 
 
 		 306 aa  255  6e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1703  hypothetical protein  46.26 
 
 		 294 aa  255  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0723  hypothetical protein  46.26 
 
 		 306 aa  255  7e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0738  hypothetical protein  46.26 
 
 		 306 aa  255  7e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1556  hypothetical protein  46.26 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1930  metal-dependent hydrolase-like protein  40.45 
 
 		 293 aa  209  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242298 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0165  hypothetical protein  38.78 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3790  hypothetical protein  38.93 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44510  hypothetical protein  39.34 
 
 		 278 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.319734 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2960  hypothetical protein  38.17 
 
 		 291 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2618  metal-dependent hydrolase-like protein  39.58 
 
 		 278 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00276728  normal  0.902339 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2091  metal-dependent hydrolase  40.74 
 
 		 272 aa  176  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4103  FF domain-containing protein  40.31 
 
 		 285 aa  169  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.852892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0083  metal-dependent hydrolase-like protein  37.74 
 
 		 282 aa  162  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53530  hypothetical protein  37.02 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4691  hypothetical protein  37.02 
 
 		 277 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3199  metal-dependent hydrolase  38.24 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3261  metal-dependent hydrolase  38.24 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.604698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3208  metal-dependent hydrolase  38.24 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4593  metal-dependent hydrolase  37.86 
 
 		 289 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3653  metal-dependent hydrolase-like protein  35.71 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4629  metal-dependent hydrolase  35.96 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0314  metal-dependent hydrolase  36.86 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3654  metal-dependent hydrolase-like protein  34.38 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2822  hypothetical protein  36.15 
 
 		 267 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000149451  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4513  metal-dependent hydrolase  36.13 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0932  FF domain-containing protein  36.51 
 
 		 294 aa  139  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438166  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0738  metal-dependent hydrolase  36.44 
 
 		 297 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0667904 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2084  FF domain-containing protein  32.39 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1350  FF domain-containing protein  32.69 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.354335  normal  0.0894985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3135  hypothetical protein  29.97 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2354  hypothetical protein  41.51 
 
 		 278 aa  105  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19546  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5371  hypothetical protein  30.04 
 
 		 311 aa  98.2  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.971328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2251  putative metal-dependent hydrolase  26.79 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000117397  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4340  hypothetical protein  30.28 
 
 		 306 aa  88.2  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12790  hypothetical protein  30.6 
 
 		 356 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.89049  normal  0.675408 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1296  FF domain protein  28.32 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0684567  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3084  hypothetical protein  29.56 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.531586  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8730  hypothetical protein  27.91 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342187  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0453  hypothetical protein  29.63 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113345  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0464  hypothetical protein  29.63 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.416793  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0440  hypothetical protein  29.63 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1360  metal-dependent hydrolase  27.97 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3179  hypothetical protein  31.76 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.17273  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2173  hypothetical protein  28.47 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425702  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0912  hypothetical protein  28.47 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0391882  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0819  hypothetical protein  28.47 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1795  hypothetical protein  28.74 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1093  Uncharacterized conserved protein UCP07580  30.04 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3425  hypothetical protein  32.73 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1809  FF domain-containing protein  28.57 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3648  metal-dependent hydrolase  25.87 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0708  metal-dependent hydrolase  25.56 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4392  metal-dependent hydrolase  29.74 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.106904 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4911  metal-dependent hydrolase  25.47 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21040  hypothetical protein  29.57 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5316  metal-dependent hydrolase  26.22 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.14239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3397  metal-dependent hydrolase  26.22 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4970  metal-dependent hydrolase  29.07 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2874  hypothetical protein  32.1 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2918  hypothetical protein  32.1 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2904  hypothetical protein  32.1 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.486218 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>