79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2467 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2467  putative thioredoxin protein  100 
 
 		 141 aa  288  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2873  putative thioredoxin protein  91.49 
 
 		 141 aa  228  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1041  putative thioredoxin protein  72.79 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2638  putative thioredoxin protein  74.82 
 
 		 140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.566673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1005  putative thioredoxin protein  74.19 
 
 		 134 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3962  putative thioredoxin protein  69.42 
 
 		 148 aa  183  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0668  hypothetical protein  70.8 
 
 		 146 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0645  hypothetical protein  69.91 
 
 		 146 aa  169  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3838  hypothetical protein  66.67 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2498  putative thioredoxin protein  62.81 
 
 		 143 aa  169  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2634  hypothetical protein  69.23 
 
 		 139 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1307  hypothetical protein  69.44 
 
 		 143 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0720  hypothetical protein  70.19 
 
 		 152 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0267  hypothetical protein  68.27 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0751  hypothetical protein  68.27 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3279  thioredoxin family protein  69.39 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0785061  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1100  hypothetical protein  69.39 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.343923  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3312  thioredoxin family protein  69.39 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0499  hypothetical protein  69.39 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.820534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2207  hypothetical protein  69.39 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3323  hypothetical protein  69.39 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2327  hypothetical protein  69.39 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  30.39 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  28.71 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  30.93 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3283  thioredoxin  35.21 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  31.63 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  26.79 
 
 		 241 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  26.73 
 
 		 269 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  28.42 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  31.07 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4438  thioredoxin  29.41 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.102034  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2654  thioredoxin-related protein  33.75 
 
 		 370 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0534989  normal  0.540425 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  28.92 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  27.17 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  29.41 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1139  Thioredoxin domain protein  28.83 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  29.09 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1660  Thioredoxin domain protein  26.36 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  27.72 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  29.21 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  30.21 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1793  thioredoxin  29.41 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99578  decreased coverage  0.00274383 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  30 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1854  thioredoxin  31.76 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4209  thioredoxin  30.59 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558513 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  30.34 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  29.21 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  33.33 
 
 		 259 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  28.74 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  28.95 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  27.88 
 
 		 406 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3463  thioredoxin 2  27.17 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.305081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3341  thioredoxin 2  27.17 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142551  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  28.7 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  27.73 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  27.17 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  28.05 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  28.26 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  26.37 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  26.6 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1151  thioredoxin  29.58 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  26.25 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  27.18 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  26.76 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  29.29 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  28.12 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  28 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4889  Thioredoxin domain protein  22.22 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  28.16 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  25.81 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  28 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_56519  predicted protein  29.33 
 
 		 700 aa  40.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.532885  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  26 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0493  uroporphyrinogen-III synthase  25.81 
 
 		 212 aa  40.4  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  27.37 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  28.12 
 
 		 145 aa  40  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  25.84 
 
 		 107 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  30 
 
 		 107 aa  40  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>