52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1005 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1005  putative thioredoxin protein  100 
 
 		 134 aa  276  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1041  putative thioredoxin protein  81.2 
 
 		 141 aa  228  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2638  putative thioredoxin protein  69.85 
 
 		 140 aa  174  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.566673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3838  hypothetical protein  61.19 
 
 		 141 aa  167  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0645  hypothetical protein  66.07 
 
 		 146 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2467  putative thioredoxin protein  74.19 
 
 		 141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2873  putative thioredoxin protein  74.19 
 
 		 141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2498  putative thioredoxin protein  63.79 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3962  putative thioredoxin protein  62.71 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0668  hypothetical protein  65.18 
 
 		 146 aa  159  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1307  hypothetical protein  65.74 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0720  hypothetical protein  67.31 
 
 		 152 aa  151  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0267  hypothetical protein  65.38 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0751  hypothetical protein  65.38 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2634  hypothetical protein  64.42 
 
 		 139 aa  148  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3323  hypothetical protein  65.31 
 
 		 143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2207  hypothetical protein  65.31 
 
 		 143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3312  thioredoxin family protein  65.31 
 
 		 143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2327  hypothetical protein  65.31 
 
 		 143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3279  thioredoxin family protein  65.31 
 
 		 143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0785061  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1100  hypothetical protein  65.31 
 
 		 143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.343923  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0499  hypothetical protein  65.31 
 
 		 143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.820534  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  28.28 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3283  thioredoxin  31.52 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  26.67 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  27.06 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  30.77 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  29.21 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  32.32 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3383  Thioredoxin domain protein  30.93 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.346342  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  26.32 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  26.67 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  26.37 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0862  thioredoxin  31.71 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.48028  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2856  hypothetical protein  27.1 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  25.77 
 
 		 107 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  26.21 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3341  thioredoxin 2  31.31 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142551  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3463  thioredoxin 2  31.31 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.305081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  27.17 
 
 		 106 aa  41.2  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  29.27 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  31.31 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  30.77 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  30 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3491  thioredoxin 2  30.49 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  32.22 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  27.08 
 
 		 106 aa  40.4  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  25 
 
 		 241 aa  40.4  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  30.34 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2360  thioredoxin domain-containing protein  28.42 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.177499  hitchhiker  0.00135525 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  27.08 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  28.41 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>