More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1475 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 
326 aa  658    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1434  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  96 
 
 
326 aa  631  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  89.97 
 
 
344 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1419  lipolytic protein  72.47 
 
 
383 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.252701  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1843  Alpha/beta hydrolase fold-3  71.11 
 
 
344 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0838402  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  56.05 
 
 
321 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  56.05 
 
 
321 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  56.05 
 
 
321 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  56.05 
 
 
352 aa  345  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  56.05 
 
 
319 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  56.05 
 
 
319 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2286  carboxylesterase Est2  56.05 
 
 
319 aa  345  6e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.124272  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  56.67 
 
 
319 aa  341  9e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  53.94 
 
 
319 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6181  Alpha/beta hydrolase fold-3  55.67 
 
 
338 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1898  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  55.67 
 
 
338 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  55.97 
 
 
329 aa  334  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2149  esterase  55.45 
 
 
327 aa  332  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  55.66 
 
 
320 aa  332  5e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  55.21 
 
 
319 aa  326  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  53.94 
 
 
325 aa  326  4.0000000000000003e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  57.23 
 
 
321 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2525  Alpha/beta hydrolase fold-3  52.35 
 
 
320 aa  320  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.253728  hitchhiker  0.0086518 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5198  esterase/lipase/thioesterase  56.19 
 
 
319 aa  318  7e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.379534 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2383  Alpha/beta hydrolase fold-3  50.78 
 
 
327 aa  317  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150129  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1921  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  56.19 
 
 
319 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.458098 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1807  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  55 
 
 
319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086728  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1835  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  55.33 
 
 
319 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3384  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  54.57 
 
 
334 aa  308  5.9999999999999995e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  52.86 
 
 
359 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  52.23 
 
 
321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2828  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  54.48 
 
 
306 aa  304  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1799  putative esterase/lipase  52.98 
 
 
320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.72 
 
 
321 aa  288  8e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1827  lipolytic protein  45.48 
 
 
323 aa  268  1e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1090  putative lipase/esterase  47.38 
 
 
328 aa  261  8.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.644515 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.26 
 
 
321 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268588  normal  0.0941301 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.74 
 
 
312 aa  242  6e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  43.03 
 
 
321 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.88 
 
 
321 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.46 
 
 
314 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.18 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4218  lipase/esterase family protein  38.56 
 
 
318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  41.96 
 
 
320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  40.2 
 
 
314 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  41.5 
 
 
311 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.27 
 
 
310 aa  210  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  40.87 
 
 
310 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.87 
 
 
310 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.13 
 
 
318 aa  209  4e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3787  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.08 
 
 
322 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.67 
 
 
314 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.3 
 
 
316 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.38 
 
 
311 aa  202  8e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.64 
 
 
307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.62 
 
 
317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  43.27 
 
 
312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  41.77 
 
 
312 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.68 
 
 
356 aa  195  8.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.56 
 
 
335 aa  195  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.23 
 
 
313 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.57 
 
 
320 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4256  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.12 
 
 
347 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0760103  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1999  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.26 
 
 
352 aa  190  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.027865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0613  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.87 
 
 
312 aa  190  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.44 
 
 
371 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.51 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.62 
 
 
309 aa  189  7e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.99 
 
 
339 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  40.5 
 
 
310 aa  188  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.2 
 
 
376 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.28 
 
 
339 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.85 
 
 
339 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.49 
 
 
308 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  46.58 
 
 
353 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.26 
 
 
301 aa  187  3e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1958  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.36 
 
 
339 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0704762  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.91 
 
 
310 aa  186  7e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.75 
 
 
375 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.41 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  37.62 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  39.59 
 
 
292 aa  183  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  42.59 
 
 
376 aa  182  6e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.88 
 
 
320 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0645  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.83 
 
 
349 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1969  esterase/lipase/thioesterase  37.01 
 
 
338 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574416  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7998  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.69 
 
 
316 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3098  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.05 
 
 
338 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.01 
 
 
317 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3543  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.89 
 
 
315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.560296  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.3 
 
 
340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  34.91 
 
 
339 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  38.05 
 
 
309 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.78 
 
 
338 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3269  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  40 
 
 
328 aa  179  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.62 
 
 
352 aa  178  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1537  lipolytic protein  41.02 
 
 
318 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000528451  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.53 
 
 
325 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.78 
 
 
317 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3992  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.04 
 
 
304 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292538  normal  0.502023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>