120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0352 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0352  thiopurine S-methyltransferase  100 
 
 		 209 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.675368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0337  thiopurine S-methyltransferase  92.34 
 
 		 209 aa  387  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0462  hypothetical protein  80.86 
 
 		 209 aa  340  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0435  thiopurine S-methyltransferase  61.46 
 
 		 207 aa  235  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0378  thiopurine S-methyltransferase  58.82 
 
 		 213 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0571  thiopurine S-methyltransferase  59.7 
 
 		 208 aa  215  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.372489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2755  thiopurine S-methyltransferase  59.2 
 
 		 208 aa  214  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0701437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0557  thiopurine S-methyltransferase family protein  60 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4046  hypothetical protein  59.02 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.877488 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2116  thiopurine S-methyltransferase  59.2 
 
 		 208 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2728  thiopurine S-methyltransferase  59.2 
 
 		 208 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236769  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0653  thiopurine S-methyltransferase  57.84 
 
 		 207 aa  210  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.696799  normal  0.788964 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3675  thiopurine S-methyltransferase  57.51 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2779  thiopurine S-methyltransferase  58.71 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0190  thiopurine S-methyltransferase family protein  59.39 
 
 		 261 aa  208  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2403  thiopurine S-methyltransferase family protein  59.39 
 
 		 261 aa  208  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2755  thiopurine S-methyltransferase family protein  59.39 
 
 		 256 aa  207  7e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.712624  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2323  thiopurine S-methyltransferase family protein  59.39 
 
 		 256 aa  207  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6055  thiopurine S-methyltransferase  57.21 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0849  thiopurine S-methyltransferase family protein  58.71 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0988064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0688  putative thiopurine S-methyltransferase  58.71 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0672  putative thiopurine S-methyltransferase  58.21 
 
 		 267 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2646  thiopurine S-methyltransferase  58.71 
 
 		 208 aa  192  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.178903 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000397  SAM-dependent methyltransferase  40.21 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00890  hypothetical protein  29.23 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.267163  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1799  hypothetical protein  31.58 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.378794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1383  thiopurine S-methyltransferase  33.33 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875719  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3410  hypothetical protein  35.33 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.134016 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4948  thiopurine S-methyltransferase  33.33 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527262  normal  0.560333 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1421  thiopurine S-methyltransferase  31.93 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1044  thiopurine S-methyltransferase  31.71 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05270  conserved hypothetical protein  30.94 
 
 		 216 aa  72  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2081  thiopurine S-methyltransferase  32.64 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.858928  normal  0.891479 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1335  thiopurine S-methyltransferase  32.75 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.357714  normal  0.249903 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30453  predicted protein  31.58 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.11187 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2332  thiopurine S-methyltransferase  27.33 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.742383  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2525  thiopurine S-methyltransferase  25.68 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186445  normal  0.445106 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15380  Thiopurine S-methyltransferase  26.42 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417119  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0974  Methyltransferase type 11  23.96 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0589694  normal  0.0919169 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0947  Methyltransferase type 11  23.96 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  28.49 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0580  thiopurine S-methyltransferase  24.27 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.947193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0849  thiopurine S-methyltransferase  25.28 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000750886  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3784  thiopurine S-methyltransferase  22.7 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3727  thiopurine S-methyltransferase  22.7 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0794  thiopurine S-methyltransferase  27.42 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000172804  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1758  thiopurine S-methyltransferase  24.23 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0541  thiopurine S-methyltransferase  26.34 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0581  thiopurine S-methyltransferase  23.78 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.904773 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3055  thiopurine S-methyltransferase  22.04 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0541  thiopurine S-methyltransferase  23.24 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1445  thiopurine S-methyltransferase  25 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0413435  normal  0.359474 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2747  thiopurine S-methyltransferase  22.56 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3617  thiopurine S-methyltransferase  24.18 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4557  thiopurine S-methyltransferase  28.33 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3449  thiopurine S-methyltransferase  23.78 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0515  thiopurine S-methyltransferase  27.97 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766215 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  35.35 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3910  thiopurine S-methyltransferase  23.78 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1814  thiopurine S-methyltransferase  24.84 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0216423  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2892  thiopurine S-methyltransferase  22.99 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3985  thiopurine S-methyltransferase  25.7 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.971447 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1870  thiopurine S-methyltransferase  25.57 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.629149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02114  thiopurine S-methyltransferase  25.48 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  41.43 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003701  thiopurine S-methyltransferase  25.48 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.994639  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3243  methyltransferase type 12  35.21 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0787423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3845  thiopurine S-methyltransferase  25 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0510882  normal  0.488659 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0124  thiol methyltransferase 1-like  26.29 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1365  thiopurine S-methyltransferase  23.28 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10570  benzoquinone methyltransferase  29.13 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175539  normal  0.480356 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  26.95 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1479  thiopurine S-methyltransferase  23.3 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.193618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  34.06 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2087  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.261869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  30.83 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4010  thiopurine S-methyltransferase  22.89 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000530597  unclonable  0.000000000128309 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0588  thiopurine S-methyltransferase  23.91 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00909445  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  42.25 
 
 		 410 aa  48.9  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2244  thiopurine S-methyltransferase  22.92 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.245818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3261  thiopurine S-methyltransferase  23.91 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154958  hitchhiker  0.00386199 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0582  thiopurine S-methyltransferase  24.32 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  29.01 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5269  Methyltransferase type 12  33.81 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  30.5 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2259  thiopurine S-methyltransferase  25 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.498891  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5314  Methyltransferase type 11  25.55 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  40.54 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3498  thiopurine S-methyltransferase  21.08 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 243 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1566  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.131267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  34.59 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  28.95 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5849  Methyltransferase type 12  25.15 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13763 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  35.71 
 
 		 211 aa  45.1  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1777  thiopurine s-methyltransferase  23.03 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4153  thiopurine S-methyltransferase  23.28 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0453346  normal  0.132491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  36.25 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>