57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0314 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0314  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  530  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0302  hypothetical protein  94.36 
 
 		 267 aa  471  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6097  hypothetical protein  76.52 
 
 		 271 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.592335 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2767  hypothetical protein  76.25 
 
 		 272 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2153  hypothetical protein  76.25 
 
 		 272 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0426  hypothetical protein  75.19 
 
 		 273 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.812935  normal  0.569744 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2819  hypothetical protein  75.48 
 
 		 272 aa  341  7e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2686  hypothetical protein  75.86 
 
 		 272 aa  341  9e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.209191 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4186  hypothetical protein  58.69 
 
 		 267 aa  278  5e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3926  hypothetical protein  55.56 
 
 		 275 aa  275  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0938  hypothetical protein  51.31 
 
 		 271 aa  256  4e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.867884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0795  hypothetical protein  51.31 
 
 		 271 aa  256  4e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.985574  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3305  hypothetical protein  57.78 
 
 		 277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3993  hypothetical protein  50 
 
 		 266 aa  248  7e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1370  hypothetical protein  51.71 
 
 		 278 aa  241  7.999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2754  hypothetical protein  58.37 
 
 		 269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3985  hypothetical protein  46.18 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.927066  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0925  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  50.95 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1325  hypothetical protein  48.26 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0146355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2240  hypothetical protein  39.55 
 
 		 294 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0474  hypothetical protein  43.21 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.985859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0261  hypothetical protein  44.4 
 
 		 282 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02882  hypothetical protein  40.15 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1216  hypothetical protein  37.7 
 
 		 259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1246  hypothetical protein  36.84 
 
 		 259 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3886  hypothetical protein  30.19 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.707997  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0441  hypothetical protein  33.12 
 
 		 241 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0888  hypothetical protein  32.93 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0439  hypothetical protein  31.36 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.855778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3674  hypothetical protein  29.09 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0654839  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5091  hypothetical protein  31.82 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0352  hypothetical protein  26.7 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0327  hypothetical protein  28.12 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3509  hypothetical protein  28.21 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.243823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4594  hypothetical protein  25.39 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000322165 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4366  hypothetical protein  27.52 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0346  hypothetical protein  27.52 
 
 		 244 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00594188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4376  hypothetical protein  29.87 
 
 		 286 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.464948 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004062  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  26.38 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0448  hypothetical protein  25.78 
 
 		 247 aa  53.9  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198058  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0344  hypothetical protein  26.59 
 
 		 244 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.299986  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0354  hypothetical protein  25.32 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0349  hypothetical protein  26.01 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.849457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0352  hypothetical protein  26.44 
 
 		 244 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000422268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0342  hypothetical protein  26.44 
 
 		 244 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3925  hypothetical protein  29.34 
 
 		 247 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3884  hypothetical protein  32.81 
 
 		 240 aa  47.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3873  hypothetical protein  25.97 
 
 		 238 aa  46.2  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.451161 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4797  beta-ketoacyl synthase domain protein  31.45 
 
 		 240 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3377  hypothetical protein  26.17 
 
 		 227 aa  45.8  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3683  hypothetical protein  30.99 
 
 		 200 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4760  hypothetical protein  30.99 
 
 		 200 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00298673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0109  hypothetical protein  27.16 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4567  hypothetical protein  31.25 
 
 		 242 aa  43.5  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1160  hypothetical protein  32.63 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000752472  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00799  hypothetical protein  32.43 
 
 		 195 aa  42.7  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2748  hypothetical protein  30.99 
 
 		 237 aa  42.4  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>