40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2694 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2694  periplasmic protein-like protein  100 
 
 		 576 aa  1181    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361508  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03125  hypothetical protein  32.62 
 
 		 537 aa  152  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.516059 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4146  hypothetical protein  32.89 
 
 		 537 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4034  putative transmembrane protein  32.89 
 
 		 537 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1432  hypothetical protein  36.97 
 
 		 416 aa  101  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441497 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4663  hypothetical protein  39.51 
 
 		 481 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3386  hypothetical protein  37.58 
 
 		 446 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3695  hypothetical protein  36.91 
 
 		 445 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.555947 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1892  hypothetical protein  31.65 
 
 		 285 aa  92  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.769847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3577  hypothetical protein  39.51 
 
 		 444 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  30.77 
 
 		 273 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  30.12 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  31.36 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  37.5 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  30.29 
 
 		 263 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  27.74 
 
 		 262 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0194  hypothetical protein  27.67 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.598443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0301  hypothetical protein  27.46 
 
 		 261 aa  53.9  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.937061  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  26.63 
 
 		 268 aa  54.3  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1742  hypothetical protein  27.46 
 
 		 261 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00150002  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3068  hypothetical protein  30.38 
 
 		 240 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3795  hypothetical protein  30.38 
 
 		 240 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1827  hypothetical protein  27.46 
 
 		 231 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580618  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1514  periplasmic protein-like protein  29.86 
 
 		 302 aa  51.6  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0326247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3898  hypothetical protein  29.7 
 
 		 245 aa  50.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1330  hypothetical protein  26.06 
 
 		 231 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0505573  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0266  hypothetical protein  26.06 
 
 		 231 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0373  hypothetical protein  26.06 
 
 		 231 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109844  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0994  hypothetical protein  26.06 
 
 		 226 aa  49.7  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0432719  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3411  periplasmic protein-like  25.44 
 
 		 258 aa  48.5  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1411  periplasmic protein-like protein  28.87 
 
 		 302 aa  47.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202803  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  35.16 
 
 		 351 aa  47.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1132  hypothetical protein  31.67 
 
 		 174 aa  47  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.092946  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5365  hypothetical protein  34.78 
 
 		 277 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0349179 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3023  hypothetical protein  30 
 
 		 226 aa  44.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3418  hypothetical protein  29.47 
 
 		 235 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1651  hypothetical protein  35.38 
 
 		 187 aa  44.3  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4155  hypothetical protein  30.17 
 
 		 240 aa  43.9  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126669 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.71 
 
 		 960 aa  43.5  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3995  hypothetical protein  29.58 
 
 		 257 aa  43.5  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00690793  normal  0.10342 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>