More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2549 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  100 
 
 		 182 aa  370  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  76.4 
 
 		 183 aa  257  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  45.98 
 
 		 178 aa  144  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  43.82 
 
 		 184 aa  140  8e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  47.02 
 
 		 174 aa  137  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  44.38 
 
 		 197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  46.06 
 
 		 176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  45.45 
 
 		 176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  38.42 
 
 		 190 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  39.08 
 
 		 184 aa  121  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  40.34 
 
 		 189 aa  121  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  40.23 
 
 		 183 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  40.23 
 
 		 183 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  40.83 
 
 		 186 aa  121  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  40.8 
 
 		 183 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  42.2 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  39.2 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  40.8 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  39.43 
 
 		 196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  36.96 
 
 		 192 aa  116  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  39.33 
 
 		 186 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  39.33 
 
 		 186 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  38.76 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  37.43 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  38.95 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  36.72 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  39.33 
 
 		 186 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  39.66 
 
 		 197 aa  114  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  38.76 
 
 		 186 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  38.89 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  36.72 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  36.72 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  36.72 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  36.72 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  36.72 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1269  hypothetical protein  38.42 
 
 		 190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  35.67 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2031  YceJ  37.85 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  38.07 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  36.72 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  36.72 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2215  hypothetical protein  37.85 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.511005 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  36.72 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  38.76 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  35.47 
 
 		 182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1254  hypothetical protein  38.42 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.73358 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  35.67 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  37.5 
 
 		 183 aa  111  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  38.07 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  37.43 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  36.87 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  34.91 
 
 		 193 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  36.93 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  38.38 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  35.26 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  37.58 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  36.26 
 
 		 196 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  40.46 
 
 		 186 aa  104  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  34.91 
 
 		 188 aa  104  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  36.09 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  33.71 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  35.71 
 
 		 222 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  38.07 
 
 		 185 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  40.24 
 
 		 206 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  34.64 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  34.92 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  34.44 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1029  cytochrome b561  42.35 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145738  normal  0.0105144 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1820  cytochrome b561 family protein  34.81 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593327  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  36.31 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1930  cytochrome B561  34.81 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  37.57 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03240  cytochrome b561  37.57 
 
 		 184 aa  101  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  36.69 
 
 		 181 aa  101  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2223  cytochrome b561 family protein  34.25 
 
 		 184 aa  101  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0039455  hitchhiker  0.00454282 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  41.38 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5072  cytochrome b561, putative  36.93 
 
 		 184 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  34.71 
 
 		 181 aa  98.6  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  40.66 
 
 		 188 aa  97.8  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  33.15 
 
 		 192 aa  97.1  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  34.12 
 
 		 178 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  34.81 
 
 		 186 aa  94.7  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0471  cytochrome B561  39.55 
 
 		 209 aa  94.4  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02672  cytochrome b561, putative  30.94 
 
 		 188 aa  93.6  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  36.81 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2822  cytochrome B561  38.01 
 
 		 184 aa  94  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79842  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  35.5 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  34.29 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  34.97 
 
 		 179 aa  93.2  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0973  cytochrome b561 family protein  30 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  34.32 
 
 		 180 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  35.88 
 
 		 183 aa  92.4  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  41.82 
 
 		 172 aa  92  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  33.33 
 
 		 180 aa  91.3  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  34.9 
 
 		 441 aa  91.7  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2791  cytochrome B561  34.1 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  33.14 
 
 		 177 aa  90.1  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  35.29 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1216  cytochrome b561  35.09 
 
 		 183 aa  89.4  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000559854  normal  0.299312 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  35.29 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>