240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3889 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3889  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  393  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3318  hypothetical protein  74.87 
 
 		 196 aa  274  6e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0278  hypothetical protein  30.87 
 
 		 164 aa  74.3  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1185  protein of unknown function DUF45  53.73 
 
 		 258 aa  71.2  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.149779 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2752  hypothetical protein  50 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7934  protein of unknown function DUF45  45.71 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2474  protein of unknown function DUF45  46.38 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000651268 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2891  protein of unknown function DUF45  46.38 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00416901  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4380  hypothetical protein  44.29 
 
 		 178 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2465  protein of unknown function DUF45  46.38 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0731519  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  46.48 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  40.51 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27520  predicted metal-dependent hydrolase  40 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1260  hypothetical protein  49.25 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.017504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8351  metal-dependent hydrolase-like protein  29.66 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  35.14 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  36.79 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  38.57 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  32.35 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  32.14 
 
 		 292 aa  62  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  28.57 
 
 		 286 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3736  protein of unknown function DUF45  42.65 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.282728  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4114  hypothetical protein  41.1 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26654  normal  0.0528961 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0533  metal-dependent hydrolase  29.52 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2959  hypothetical protein  29.66 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0212989  normal  0.321513 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  43.08 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  36.11 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  40.58 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19100  predicted metal-dependent hydrolase  31.58 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.155698  normal  0.193452 
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  34.65 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11430  predicted metal-dependent hydrolase  29.92 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715007  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0720  protein of unknown function DUF45  42.25 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  34.65 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3802  protein of unknown function DUF45  37.84 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0827379  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  30.84 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  24.06 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  39.66 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  37.88 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0790  protein of unknown function DUF45  46.48 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  42.42 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  42.42 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3733  hypothetical protein  39.19 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.586168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  41.94 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0131  hypothetical protein  31.09 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  39.13 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  34.25 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  39.13 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  39.13 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  39.13 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  37.84 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  26.26 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  37.84 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  31.13 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  38.03 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  45.31 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  37.84 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0937  protein of unknown function DUF45  28.14 
 
 		 175 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397876  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  39.13 
 
 		 285 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0228  hypothetical protein  38.81 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31038  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  39.13 
 
 		 303 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  37.84 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  32.67 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4225  protein of unknown function DUF45  41.79 
 
 		 173 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  37.84 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  37.84 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  37.84 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  40 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  47.46 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  26.06 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  39.13 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  26.06 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1523  hypothetical protein  37.84 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.767416  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  32.88 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  37.04 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl659  zinc metalloprotease  24.64 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  32.67 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  44.64 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  38.96 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0788  protein of unknown function DUF45  48.08 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  39.66 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  40 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  38.96 
 
 		 288 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0324  protein of unknown function DUF45  36.36 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00482569 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  31.88 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  42.42 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  36.71 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  36.71 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  38.81 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  40.3 
 
 		 251 aa  54.7  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2082  hypothetical protein  26 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  40 
 
 		 246 aa  53.9  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  34.85 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0430  hypothetical protein  44.93 
 
 		 241 aa  53.9  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  50 
 
 		 321 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  42.37 
 
 		 262 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  28.44 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1381  protein of unknown function DUF45  42.42 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.263783  normal  0.318048 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1766  hypothetical protein  37.14 
 
 		 241 aa  53.9  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  29.47 
 
 		 238 aa  53.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  40.85 
 
 		 241 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.237402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>