32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2632 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2632  exonuclease-like protein  100 
 
 
168 aa  333  9e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3041  exonuclease-like protein  80.95 
 
 
168 aa  280  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3223  exonuclease-like protein  64.52 
 
 
168 aa  206  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000951035  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2961  exonuclease-like protein  56.6 
 
 
182 aa  177  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0548295  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1709  hypothetical protein  50.96 
 
 
164 aa  147  8e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000629582  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1404  hypothetical protein  47.8 
 
 
165 aa  133  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000594645  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1213  exonuclease-like protein  46.54 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000173216  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1186  hypothetical protein  46.54 
 
 
165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107945  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1466  hypothetical protein  45.45 
 
 
253 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.330036  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3322  hypothetical protein  40.52 
 
 
250 aa  102  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1749  hypothetical protein  40.38 
 
 
249 aa  101  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.873614  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1783  hypothetical protein  39.19 
 
 
254 aa  98.2  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.184707 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1457  hypothetical protein  44.74 
 
 
251 aa  92.8  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0377  exonuclease-like protein  39.33 
 
 
277 aa  92.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0240819  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1716  hypothetical protein  41.83 
 
 
250 aa  92.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0916  hypothetical protein  42.67 
 
 
281 aa  89.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.58478  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1492  hypothetical protein  39.33 
 
 
277 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000942268  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4364  hypothetical protein  40.14 
 
 
301 aa  88.6  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.015731  normal  0.163667 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2938  hypothetical protein  39.33 
 
 
277 aa  87.4  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.131158 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4347  hypothetical protein  37.41 
 
 
267 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1998  hypothetical protein  39.02 
 
 
272 aa  86.3  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.343248  normal  0.497208 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4370  hypothetical protein  36.73 
 
 
267 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4215  hypothetical protein  36.73 
 
 
267 aa  84.7  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.105075  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1001  hypothetical protein  35.53 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1643  exonuclease  31.79 
 
 
287 aa  78.2  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0079  hypothetical protein  30.89 
 
 
340 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.418653 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2219  exonuclease-like protein  30.91 
 
 
386 aa  51.2  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03332  hypothetical protein  29.73 
 
 
606 aa  48.5  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3121  hypothetical protein  29.75 
 
 
414 aa  47.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1702  hypothetical protein  31.82 
 
 
290 aa  45.1  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2731  hypothetical protein  26.67 
 
 
361 aa  42  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14620  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.43 
 
 
406 aa  41.6  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00393571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>