More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1339 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  79.24 
 
 		 434 aa  639    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 436 aa  868    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  50 
 
 		 407 aa  373  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 		 274 aa  157  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  28.54 
 
 		 404 aa  154  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  32.71 
 
 		 417 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 		 403 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  24.05 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  31.39 
 
 		 421 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 		 405 aa  144  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 		 402 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  30.07 
 
 		 402 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 		 418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 415 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  29.25 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  23.46 
 
 		 394 aa  137  5e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 		 415 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  28.54 
 
 		 413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 		 410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 		 415 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 		 416 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  28.71 
 
 		 405 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  28.04 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  28.67 
 
 		 409 aa  131  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  31.11 
 
 		 397 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  39.89 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 		 396 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  35.04 
 
 		 413 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 		 429 aa  127  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  26.41 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  35.27 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  30.98 
 
 		 399 aa  124  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  30.31 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  32.87 
 
 		 402 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 		 376 aa  119  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 402 aa  119  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  36.16 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  31.69 
 
 		 394 aa  117  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  35.6 
 
 		 405 aa  117  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  38.27 
 
 		 396 aa  116  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  29.65 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 		 399 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 		 399 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2329  glycosyl transferase, group 1  41.21 
 
 		 410 aa  113  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285822  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  39.15 
 
 		 429 aa  112  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 		 703 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 		 360 aa  107  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 456 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  23.54 
 
 		 404 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  24.77 
 
 		 417 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  24.77 
 
 		 417 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 		 409 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 		 408 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 		 406 aa  99.8  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 411 aa  98.2  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  28.65 
 
 		 1119 aa  97.4  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  32.07 
 
 		 1340 aa  97.1  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 		 535 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1800  glycosyltransferase  28.87 
 
 		 402 aa  97.1  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  31 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  30 
 
 		 402 aa  94.4  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 499 aa  90.1  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 		 412 aa  88.2  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0338  glycosyl transferase, group 1  22.58 
 
 		 392 aa  87.4  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100877  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 		 902 aa  87  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 		 994 aa  86.7  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 		 956 aa  84.7  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  25.81 
 
 		 442 aa  83.2  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  36.67 
 
 		 1106 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  22.27 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  26.89 
 
 		 860 aa  81.3  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 		 1156 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  32.47 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  27.06 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2866  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.614431  hitchhiker  0.0000195595 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0439  hypothetical protein  31.03 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2065  glycosyl transferase, group 1  33.95 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558513 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 		 435 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1794  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.164392  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2880  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760394 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1550  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  30.91 
 
 		 700 aa  71.6  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1770  putative glycosyltransferase  33.33 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2443  hypothetical protein  28.32 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000302372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2710  hypothetical protein  30.12 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0543542  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>