167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3048 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3048  phosphatidylglycerophosphatase  100 
 
 		 190 aa  374  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2849  phosphatidylglycerophosphatase  85.55 
 
 		 188 aa  298  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2605  phosphatidylglycerophosphatase A  72.04 
 
 		 191 aa  268  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.280731  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3015  phosphatidylglycerophosphatase A  70.97 
 
 		 192 aa  265  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.702802 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2769  phosphatidyl-glycerophosphatase hydrolase transmembrane protein  74.57 
 
 		 174 aa  255  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135706  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4475  phosphatidylglycerophosphatase  62.73 
 
 		 181 aa  202  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0709  phosphatidylglycerophosphatase A  58.28 
 
 		 166 aa  187  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0146  phosphatidylglycerophosphatase A  58.28 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0629  phosphatidylglycerophosphatase A  58.28 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3711  phosphatidylglycerophosphatase  58.02 
 
 		 183 aa  181  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.741553  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0597  phosphatidylglycerophosphatase A  57.67 
 
 		 181 aa  181  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499318  normal  0.310706 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0398  phosphatidylglycerophosphatase A  51.04 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.132793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1258  putative phosphatidylglycerophosphatase A  51.04 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3441  phosphatidylglycerophosphatase A  51.04 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3478  phosphatidylglycerophosphatase A  51.04 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3307  phosphatidylglycerophosphatase A  51.04 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0555  phosphatidylglycerophosphatase  58.23 
 
 		 193 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1187  phosphatidylglycerophosphatase A  53.14 
 
 		 178 aa  177  9e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3401  phosphatidylglycerophosphatase A  53.04 
 
 		 193 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394477  normal  0.0499313 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0530  phosphatidylglycerophosphatase A  57.76 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0554  phosphatidylglycerophosphatase A  56.52 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2606  phosphatidylglycerophosphatase A  54.69 
 
 		 213 aa  170  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.044586 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3476  phosphatidylglycerophosphatase A  56.05 
 
 		 157 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.851848  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2756  phosphatidylglycerophosphatase A  55.21 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.617672  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0344  phosphatidylglycerophosphatase A  57.96 
 
 		 176 aa  167  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.182849  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0355  phosphatidylglycerophosphatase  57.96 
 
 		 176 aa  167  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0430  phosphatidylglycerophosphatase  53.5 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777688 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3666  phosphatidylglycerophosphatase A  50.84 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0582  phosphatidylglycerophosphatase A  49.14 
 
 		 175 aa  166  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2479  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  55.48 
 
 		 154 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118305  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0211  phosphatidylglycerophosphatase  49.43 
 
 		 184 aa  165  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.627507 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0077  phosphatidylglycerophosphatase A  47.8 
 
 		 193 aa  160  9e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0484  phosphatidylglycerophosphatase A  50.88 
 
 		 175 aa  158  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0222  phosphatidylglycerophosphatase A  44.89 
 
 		 190 aa  148  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0713  phosphatidylglycerophosphatase A  53.29 
 
 		 160 aa  147  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0014  phosphatidylglycerophosphatase A  44.74 
 
 		 210 aa  142  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0244  phosphatidylglycerophosphatase A  45.45 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3920  phosphatidylglycerophosphatase A  43.39 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3741  phosphatidylglycerophosphatase  48.15 
 
 		 161 aa  134  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.120862 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2194  phosphatidylglycerophosphatase  55.48 
 
 		 159 aa  121  6e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000299567  hitchhiker  0.00000439184 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0833  phosphatidylglycerophosphatase  40.37 
 
 		 161 aa  117  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000936686  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  39.13 
 
 		 157 aa  112  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00366  phosphatidylglycerophosphatase A  42.47 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.828756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3191  phosphatidylglycerophosphatase A  42.47 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00370  hypothetical protein  42.47 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.63417  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0339  phosphatidylglycerophosphatase A  42.47 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3215  phosphatidylglycerophosphatase A  42.47 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0454  phosphatidylglycerophosphatase A  42.47 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0500  phosphatidylglycerophosphatase A  42.47 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0489  phosphatidylglycerophosphatase A  42.47 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  42.47 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  39.33 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0522  phosphatidylglycerophosphatase A  43.84 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0459  phosphatidylglycerophosphatase A  43.84 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0480  phosphatidylglycerophosphatase A  43.15 
 
 		 168 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0572  phosphatidylglycerophosphatase  45.81 
 
 		 163 aa  108  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0467  phosphatidylglycerophosphatase A  43.84 
 
 		 168 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  41.25 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  43.15 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  40.26 
 
 		 162 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1168  phosphatidylglycerophosphatase  39.24 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  41.94 
 
 		 167 aa  105  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  42.76 
 
 		 161 aa  105  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  42.76 
 
 		 161 aa  105  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  42.76 
 
 		 161 aa  105  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  40.52 
 
 		 164 aa  105  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  38.12 
 
 		 164 aa  105  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2895  phosphatidylglycerophosphatase A  40.51 
 
 		 168 aa  104  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0848  phosphatidylglycerophosphatase  37.35 
 
 		 174 aa  104  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  42.11 
 
 		 164 aa  104  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  40.13 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  39.49 
 
 		 164 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004259  phosphatidylglycerophosphatase A  40.65 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.348305  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0390  phosphatidylglycerophosphatase  41.14 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1102  phosphatidylglycerophosphatase  39.24 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0161628  normal  0.229912 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  39.35 
 
 		 157 aa  102  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  38.1 
 
 		 160 aa  101  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0915  phosphatidylglycerophosphatase A  40.52 
 
 		 167 aa  101  6e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000968803  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  38.22 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3086  phosphatidylglycerophosphatase A  36.84 
 
 		 170 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1855  phosphatidylglycerophosphatase A  38.85 
 
 		 169 aa  99.4  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.020025  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  39.31 
 
 		 166 aa  99  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1150  phosphatidylglycerophosphatase  40.85 
 
 		 164 aa  98.6  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.313843  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1217  phosphatidylglycerophosphatase A  36.77 
 
 		 164 aa  98.2  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00160129  normal  0.251899 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0520  phosphatidylglycerophosphatase A  41.78 
 
 		 167 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  41.78 
 
 		 167 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2772  phosphatidylglycerophosphatase  38.16 
 
 		 166 aa  97.8  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0288335  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  41.78 
 
 		 167 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0928  phosphatidylglycerophosphatase A  39.26 
 
 		 167 aa  97.1  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3297  phosphatidylglycerophosphatase A  36.77 
 
 		 164 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162113  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3154  phosphatidylglycerophosphatase A  36.77 
 
 		 166 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000760341  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3152  phosphatidylglycerophosphatase A  36.77 
 
 		 164 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112475  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0573  phosphatidylglycerophosphatase A  40.41 
 
 		 167 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3452  phosphatidylglycerophosphatase  37.66 
 
 		 159 aa  95.5  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  40.41 
 
 		 167 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1022  phosphatidylglycerophosphatase  40.13 
 
 		 165 aa  94.4  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.438058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1565  phosphatidylglycerophosphatase A  37.89 
 
 		 164 aa  94  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1051  phosphatidylglycerophosphatase A  35.91 
 
 		 171 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  35.91 
 
 		 171 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1193  phosphatidylglycerophosphatase  36.54 
 
 		 164 aa  92.8  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>