164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1923 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  100 
 
 		 127 aa  254  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  64.84 
 
 		 127 aa  155  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  58.59 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  44.88 
 
 		 415 aa  107  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  45.86 
 
 		 411 aa  104  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  41.32 
 
 		 135 aa  100  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  46.03 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  42.64 
 
 		 405 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  46.03 
 
 		 132 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  42.96 
 
 		 413 aa  98.6  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  41.41 
 
 		 406 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  41.09 
 
 		 406 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  41.41 
 
 		 142 aa  97.4  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  44.09 
 
 		 409 aa  97.1  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  41.73 
 
 		 410 aa  96.3  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  44 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  41.18 
 
 		 410 aa  96.7  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  47.54 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2297  OsmC-like protein  44.92 
 
 		 133 aa  93.6  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  40.77 
 
 		 406 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  40.31 
 
 		 407 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  39.26 
 
 		 407 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  48.74 
 
 		 412 aa  92.8  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  45.16 
 
 		 130 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  39.53 
 
 		 402 aa  91.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4937  OsmC family protein  43.1 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.659641 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5525  OsmC family protein  41.88 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  42.52 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3689  OsmC family protein  43.1 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.952273 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  45.16 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  35.56 
 
 		 405 aa  90.9  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  42.28 
 
 		 153 aa  90.9  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  45.16 
 
 		 130 aa  90.1  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  41.73 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  46.73 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  46.73 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  46.73 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  39.34 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  44.35 
 
 		 130 aa  88.2  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  45.05 
 
 		 136 aa  87.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0518  OsmC-like protein superfamily protein  39.23 
 
 		 153 aa  87  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  37.5 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  40.34 
 
 		 418 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0240  hypothetical protein  39.23 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  38.66 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1423  hypothetical protein  39.23 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2657  putative hydrolase  39.23 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2518  hypothetical protein  39.23 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0608844  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  45.69 
 
 		 405 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0949  hydrolase  39.23 
 
 		 133 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  38.84 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3725  OsmC family protein  39.66 
 
 		 133 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.196532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4564  OsmC-like protein  39.66 
 
 		 133 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3799  OsmC family protein  39.66 
 
 		 133 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.732158  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  40.52 
 
 		 423 aa  84  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1619  hypothetical protein  38.76 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0276  hypothetical protein  38.76 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  36.15 
 
 		 406 aa  83.6  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  37.5 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  40 
 
 		 410 aa  81.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2658  OsmC family protein  40.68 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.498397 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  33.85 
 
 		 408 aa  77.4  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  38.33 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  33.04 
 
 		 397 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  40.37 
 
 		 408 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  41.23 
 
 		 408 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  31.75 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  35.04 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1856  OsmC family protein  33.87 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0732  OsmC family protein  45 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  37 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  46.77 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  29.23 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  32.28 
 
 		 138 aa  60.1  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  34.58 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  32.03 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1832  OsmC-like protein  34.86 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5556  OsmC-like protein  33.33 
 
 		 130 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000078778  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  41.1 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  32.35 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  38.46 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  33.33 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1595  OsmC family protein  41.82 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2279  OsmC family protein  41.82 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0377998  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0335  OsmC family protein  32.84 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.252391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  31.17 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  34.92 
 
 		 179 aa  51.6  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0395  OsmC family protein  44.07 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17941  hypothetical protein  28.44 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.758447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1560  OsmC family protein  44.23 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0232  OsmC family protein  30.3 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0937  redox protein  29.36 
 
 		 122 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.393719  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0376  hypothetical protein  26.67 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0251  OsmC family protein  28.28 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  0.164531 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  27.41 
 
 		 185 aa  48.9  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  27.27 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  29.66 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1311  OsmC family protein  33.03 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.474766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  29.66 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  23.88 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>