More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0853 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0853  protein serine/threonine phosphatases  100 
 
 		 304 aa  626  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0260925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2476  protein phosphatase 2C-like  87.5 
 
 		 304 aa  555  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209161  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2158  hypothetical protein  78.62 
 
 		 304 aa  503  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2279  protein serine/threonine phosphatase  77.96 
 
 		 304 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1959  protein serine/threonine phosphatase  77.96 
 
 		 304 aa  500  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0968187  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2706  hypothetical protein  48.84 
 
 		 306 aa  292  5e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0706  protein serine/threonine phosphatase  48.18 
 
 		 304 aa  291  8e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.546937 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0924  protein phosphatase 2C domain-containing protein  47.37 
 
 		 300 aa  286  4e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141764 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0859  protein serine/threonine phosphatase  47.04 
 
 		 300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2031  protein serine/threonine phosphatase  49.34 
 
 		 301 aa  283  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1338  protein serine/threonine phosphatases  48.84 
 
 		 300 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3850  protein phosphatase 2C-like  45.03 
 
 		 306 aa  275  6e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.632608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3580  protein serine/threonine phosphatase  47.54 
 
 		 304 aa  273  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568966  normal  0.133337 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1628  protein serine/threonine phosphatases  47.35 
 
 		 305 aa  272  6e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0588752  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0814  protein phosphatase 2C domain-containing protein  47.71 
 
 		 299 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.556106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4157  protein phosphatase 2C domain-containing protein  47.02 
 
 		 299 aa  263  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4326  protein serine/threonine phosphatase  46.75 
 
 		 304 aa  258  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4023  protein serine/threonine phosphatase  44.88 
 
 		 307 aa  256  4e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0476  protein serine/threonine phosphatase  43.38 
 
 		 302 aa  255  7e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0044  protein serine/threonine phosphatases  42.43 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3311  protein phosphatase 2C-like  33.85 
 
 		 265 aa  129  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175137 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1640  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 259 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4487  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.26 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2317  protein serine/threonine phosphatases  32.77 
 
 		 253 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3243  protein serine/threonine phosphatase  32.68 
 
 		 267 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  31.86 
 
 		 538 aa  113  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1827  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.19 
 
 		 267 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179821  normal  0.768093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1901  protein serine/threonine phosphatase  33.19 
 
 		 267 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0073  protein serine/threonine phosphatase  37.93 
 
 		 276 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.736868 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2619  protein serine/threonine phosphatases  32.77 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0996271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  34.67 
 
 		 236 aa  109  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0207  protein serine/threonine phosphatase  34.77 
 
 		 269 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3498  protein serine/threonine phosphatase  29.39 
 
 		 256 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  33.49 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  31.43 
 
 		 238 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  36.96 
 
 		 564 aa  106  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0136  protein serine/threonine phosphatase  33.9 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  32.3 
 
 		 425 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2176  protein serine/threonine phosphatase  31.58 
 
 		 255 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.36 
 
 		 611 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  31.95 
 
 		 254 aa  102  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.27 
 
 		 237 aa  102  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  34.43 
 
 		 554 aa  102  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2879  protein serine/threonine phosphatase  33.2 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395798 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 256 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  33.94 
 
 		 264 aa  99  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  32.17 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2087  Phosphoprotein phosphatase  32.26 
 
 		 445 aa  98.2  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  31.3 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  27.95 
 
 		 241 aa  98.6  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  33.48 
 
 		 540 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1861  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.87 
 
 		 252 aa  97.8  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  31.56 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  30.52 
 
 		 245 aa  97.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3425  hypothetical protein  34.1 
 
 		 375 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.466464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 597 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  31.86 
 
 		 548 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  30.83 
 
 		 256 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  31.58 
 
 		 264 aa  97.1  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  30.84 
 
 		 252 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2007  hypothetical protein  31.8 
 
 		 255 aa  95.5  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.9 
 
 		 247 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  35.04 
 
 		 466 aa  95.5  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2397  Phosphoprotein phosphatase  29.03 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  31.45 
 
 		 256 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  32.2 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  32.05 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.31 
 
 		 438 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  31.45 
 
 		 256 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  33.61 
 
 		 463 aa  94  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  32.7 
 
 		 256 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3731  protein serine/threonine phosphatase  34.08 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  30 
 
 		 256 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26780  Protein phosphatase 2C-like protein  30.04 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0744222  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0545  protein serine/threonine phosphatase  35.08 
 
 		 279 aa  94  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  29.2 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  29.24 
 
 		 249 aa  92.8  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  33.95 
 
 		 467 aa  92.8  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  31.8 
 
 		 469 aa  92.8  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3865  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.1 
 
 		 375 aa  92.4  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.461574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3007  protein serine/threonine phosphatase  30.45 
 
 		 257 aa  92  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  29.82 
 
 		 252 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  29.23 
 
 		 250 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3145  protein serine/threonine phosphatases  30.61 
 
 		 271 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  31.4 
 
 		 500 aa  90.5  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1333  protein serine/threonine phosphatase  29.51 
 
 		 270 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  28.11 
 
 		 250 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  30.13 
 
 		 259 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0438  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30 
 
 		 287 aa  90.1  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.285486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  31.92 
 
 		 394 aa  90.1  5e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  30.13 
 
 		 259 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  27.31 
 
 		 250 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  33.2 
 
 		 255 aa  89.4  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1303  protein phosphatase 2C-like protein  29.17 
 
 		 247 aa  89  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.244984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  29.23 
 
 		 250 aa  89  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1278  protein phosphatase 2C-like protein  29.17 
 
 		 247 aa  89  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0785  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.63 
 
 		 247 aa  88.6  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2163  protein serine/threonine phosphatase  33.93 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269356 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  33.81 
 
 		 507 aa  89  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.51 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0256176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>