More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3425 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3425  hypothetical protein  100 
 
 
375 aa  728    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.466464  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3865  protein phosphatase 2C domain-containing protein  91.18 
 
 
375 aa  569  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.461574  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1606  protein serine/threonine phosphatases  36.73 
 
 
507 aa  162  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198398  normal  0.820351 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4143  protein serine/threonine phosphatases  38.68 
 
 
295 aa  149  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0616  protein serine/threonine phosphatase  34.68 
 
 
259 aa  132  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.257518  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  36.61 
 
 
425 aa  122  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  37.45 
 
 
574 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  33.47 
 
 
245 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  37.21 
 
 
441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.66 
 
 
237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  29.83 
 
 
241 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  33.75 
 
 
395 aa  114  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  36.45 
 
 
463 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  33.03 
 
 
323 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  36.13 
 
 
325 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  31.25 
 
 
394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  34.55 
 
 
452 aa  112  8.000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  42.31 
 
 
478 aa  112  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  36.44 
 
 
597 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  36.11 
 
 
238 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  36.49 
 
 
462 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3145  protein serine/threonine phosphatases  33.07 
 
 
271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  35.38 
 
 
426 aa  109  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.41 
 
 
611 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  39.53 
 
 
319 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  35.65 
 
 
421 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  37.17 
 
 
477 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  29.84 
 
 
250 aa  108  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  33.62 
 
 
519 aa  108  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5189  protein serine/threonine phosphatase  35.92 
 
 
266 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  39.27 
 
 
236 aa  107  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  38.76 
 
 
507 aa  106  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  34.68 
 
 
258 aa  106  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  35.48 
 
 
540 aa  106  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3905  protein phosphatase 2C, family protein  30.84 
 
 
250 aa  105  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3911  protein phosphatase 2C, family protein  30.84 
 
 
250 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00759047  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3714  protein phosphatase 2C, family protein  31.72 
 
 
250 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3604  protein phosphatase 2C  31.72 
 
 
250 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  32.54 
 
 
548 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4001  protein phosphatase 2C, family protein  31.72 
 
 
250 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3877  protein phosphatase 2C, family protein  31.72 
 
 
250 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.65196e-21 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  33.17 
 
 
252 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  37.44 
 
 
505 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  34.05 
 
 
254 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0898  protein serine/threonine phosphatase  33.92 
 
 
443 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.979685  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  30.4 
 
 
250 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  32.71 
 
 
449 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  34.5 
 
 
250 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  29.65 
 
 
250 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  37.67 
 
 
236 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  34.91 
 
 
267 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  36.84 
 
 
253 aa  104  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.55 
 
 
247 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2279  protein serine/threonine phosphatase  34.51 
 
 
304 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.43 
 
 
517 aa  103  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.93 
 
 
238 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  35.29 
 
 
564 aa  102  9e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3389  protein serine/threonine phosphatase  34.57 
 
 
271 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.830216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
250 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0797  protein serine/threonine phosphatase  34.29 
 
 
261 aa  102  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0597706  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.89 
 
 
516 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0002  protein serine/threonine phosphatase  31.87 
 
 
617 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.818409  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  32.13 
 
 
261 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  32.79 
 
 
249 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.09 
 
 
271 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1959  protein serine/threonine phosphatase  34.07 
 
 
304 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0968187  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  28.94 
 
 
538 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  38.42 
 
 
500 aa  101  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  37.68 
 
 
256 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  29.52 
 
 
250 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  41.24 
 
 
514 aa  101  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2158  hypothetical protein  33.63 
 
 
304 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545474  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  38.29 
 
 
474 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  36.28 
 
 
416 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  40.22 
 
 
491 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  36.68 
 
 
256 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.22 
 
 
491 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308307  hitchhiker  0.00998453 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  36.68 
 
 
256 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.22 
 
 
491 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.95 
 
 
261 aa  100  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0025  protein serine/threonine phosphatase  37.31 
 
 
474 aa  99.8  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0922005  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  33.03 
 
 
241 aa  99.8  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  36.68 
 
 
256 aa  99.4  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  34.51 
 
 
472 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0318  serine/threonine phosphatase, putative  31.71 
 
 
245 aa  99.4  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2476  protein phosphatase 2C-like  37.22 
 
 
304 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209161  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40 
 
 
470 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  40.23 
 
 
449 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  40.45 
 
 
320 aa  99  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  34.34 
 
 
364 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0022  protein serine/threonine phosphatase  35.16 
 
 
511 aa  97.4  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0785  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.04 
 
 
247 aa  97.4  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0024  protein serine/threonine phosphatases  37.05 
 
 
381 aa  97.4  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  34.76 
 
 
554 aa  96.7  5e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2765  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.71 
 
 
419 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3377  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.91 
 
 
269 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.427696  decreased coverage  0.000190806 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  39.91 
 
 
422 aa  96.7  6e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  33.8 
 
 
466 aa  96.7  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0853  protein serine/threonine phosphatases  32.99 
 
 
304 aa  96.3  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0260925  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  29 
 
 
245 aa  96.3  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>