More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2180 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  100 
 
 		 423 aa  836    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  45.74 
 
 		 423 aa  344  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  44.07 
 
 		 417 aa  337  2.9999999999999997e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  47.28 
 
 		 420 aa  320  3e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  40.58 
 
 		 418 aa  311  1e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  42.13 
 
 		 413 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  41.87 
 
 		 418 aa  301  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  43.69 
 
 		 415 aa  301  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  44.42 
 
 		 432 aa  295  7e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  41.43 
 
 		 416 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  40 
 
 		 415 aa  293  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  36.52 
 
 		 415 aa  290  2e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  42.07 
 
 		 417 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  40.52 
 
 		 425 aa  290  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  37.77 
 
 		 417 aa  290  3e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  43.58 
 
 		 429 aa  290  4e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  40.95 
 
 		 416 aa  289  8e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  44.56 
 
 		 416 aa  288  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  40.63 
 
 		 411 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  42.11 
 
 		 416 aa  284  2.0000000000000002e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  41.79 
 
 		 413 aa  275  8e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  44.5 
 
 		 433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  41.79 
 
 		 421 aa  272  8.000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  45.24 
 
 		 432 aa  270  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  42 
 
 		 418 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  40.14 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  41.3 
 
 		 423 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  40.34 
 
 		 419 aa  266  4e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  43.45 
 
 		 420 aa  264  3e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  38.37 
 
 		 416 aa  263  3e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  44.47 
 
 		 438 aa  264  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  38.98 
 
 		 408 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  41.65 
 
 		 419 aa  263  6e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  36.45 
 
 		 415 aa  262  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  38.74 
 
 		 408 aa  260  4e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  37.71 
 
 		 412 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  38.96 
 
 		 411 aa  259  6e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  40.59 
 
 		 418 aa  258  1e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.8 
 
 		 431 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  37.71 
 
 		 420 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  38.1 
 
 		 411 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  37.08 
 
 		 415 aa  256  7e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  41.54 
 
 		 427 aa  255  8e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  37.47 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  39.04 
 
 		 413 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  37.98 
 
 		 413 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  41.83 
 
 		 413 aa  250  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  39.52 
 
 		 412 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  37.02 
 
 		 412 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  41.08 
 
 		 423 aa  248  1e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  39.52 
 
 		 412 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  44.34 
 
 		 414 aa  248  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  37.18 
 
 		 424 aa  247  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  36.81 
 
 		 424 aa  247  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  39.26 
 
 		 412 aa  246  6e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  40.28 
 
 		 413 aa  246  6e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1157  competence/damage-inducible protein CinA  39.56 
 
 		 443 aa  245  9e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059415 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  39.26 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  39.26 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  42.97 
 
 		 419 aa  244  3e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  37.11 
 
 		 420 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  41.53 
 
 		 416 aa  244  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  40.87 
 
 		 413 aa  241  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  38.73 
 
 		 412 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  38.19 
 
 		 424 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  38.99 
 
 		 412 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  38.99 
 
 		 412 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  37.35 
 
 		 414 aa  240  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  41.64 
 
 		 429 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  38.46 
 
 		 412 aa  239  5e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  37.44 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  36.06 
 
 		 408 aa  238  2e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  38.73 
 
 		 412 aa  237  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  33.66 
 
 		 430 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  41.29 
 
 		 414 aa  236  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  40.05 
 
 		 431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.41 
 
 		 430 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  39.29 
 
 		 414 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  36.47 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  39.31 
 
 		 420 aa  231  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  36.6 
 
 		 424 aa  228  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  35.97 
 
 		 425 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  38.52 
 
 		 417 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  35.97 
 
 		 424 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  35.73 
 
 		 424 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  35.73 
 
 		 425 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  35.73 
 
 		 425 aa  225  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  35.97 
 
 		 424 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  36.36 
 
 		 424 aa  224  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  34.22 
 
 		 400 aa  224  3e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  42.75 
 
 		 410 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  40.53 
 
 		 414 aa  223  7e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  35.73 
 
 		 424 aa  222  7e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  37.29 
 
 		 424 aa  222  8e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  39.42 
 
 		 425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  35.17 
 
 		 424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3616  competence/damage-inducible protein CinA  35.97 
 
 		 416 aa  219  7.999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  34.63 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  32.11 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  39.47 
 
 		 414 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>