More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1330 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
475 aa  966    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  57.76 
 
 
263 aa  257  4e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  49.61 
 
 
587 aa  219  7e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  51.28 
 
 
611 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  49.07 
 
 
279 aa  206  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  44.85 
 
 
293 aa  206  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  48.44 
 
 
276 aa  204  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  46.8 
 
 
267 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  51.05 
 
 
336 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  49.78 
 
 
446 aa  192  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  41.86 
 
 
287 aa  189  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  44.03 
 
 
768 aa  186  6e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  44.83 
 
 
298 aa  184  4.0000000000000006e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  42.92 
 
 
922 aa  179  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  41.38 
 
 
282 aa  176  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1263  protein of unknown function DUF323  40.55 
 
 
254 aa  166  9e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.211792  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  41.13 
 
 
952 aa  162  9e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  40 
 
 
358 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  43.5 
 
 
820 aa  160  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  35.22 
 
 
625 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  41.41 
 
 
715 aa  156  9e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2903  protein of unknown function DUF323  37.97 
 
 
327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  34.9 
 
 
620 aa  154  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  40.73 
 
 
636 aa  153  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2986  hypothetical protein  36.29 
 
 
294 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0027982  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  36.01 
 
 
882 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  32.87 
 
 
637 aa  151  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  40.51 
 
 
267 aa  150  6e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  39.32 
 
 
288 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  39.64 
 
 
538 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  36.7 
 
 
802 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  34.31 
 
 
621 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  42.32 
 
 
603 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  38.71 
 
 
287 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  40 
 
 
929 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  36.9 
 
 
618 aa  144  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  35.08 
 
 
348 aa  143  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  35.08 
 
 
348 aa  143  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  35.58 
 
 
1911 aa  143  8e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0831  hypothetical protein  37.66 
 
 
285 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0420887  unclonable  0.0000101596 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  39.68 
 
 
593 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  34.82 
 
 
586 aa  141  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  37.45 
 
 
617 aa  141  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  38.76 
 
 
416 aa  140  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  37.5 
 
 
262 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  35.14 
 
 
637 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  38.52 
 
 
740 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  36.26 
 
 
325 aa  139  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  42.13 
 
 
668 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  39.75 
 
 
781 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1675  hypothetical protein  37.5 
 
 
488 aa  139  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  37.4 
 
 
245 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  34.1 
 
 
390 aa  139  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2269  hypothetical protein  38.49 
 
 
329 aa  138  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.681202  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  35.82 
 
 
829 aa  137  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  35.17 
 
 
654 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  35.94 
 
 
346 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  35.98 
 
 
586 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  39.32 
 
 
398 aa  135  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  36.78 
 
 
620 aa  135  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  35.85 
 
 
616 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1251  serine/threonine protein kinase  35.79 
 
 
555 aa  134  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128059  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5254  hypothetical protein  36.08 
 
 
233 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410558  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  36.92 
 
 
351 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  37.01 
 
 
623 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3216  hypothetical protein  39.51 
 
 
296 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  35.93 
 
 
664 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  37.45 
 
 
527 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  37.21 
 
 
892 aa  131  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  37.99 
 
 
509 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  34.48 
 
 
359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  33.84 
 
 
925 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  40.26 
 
 
616 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  37.27 
 
 
877 aa  128  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3831  protein of unknown function DUF323  40.2 
 
 
223 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  37.45 
 
 
269 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4067  protein of unknown function DUF323  46.62 
 
 
336 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000050809  hitchhiker  0.0000128924 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  35.07 
 
 
862 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.29 
 
 
554 aa  128  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  37.93 
 
 
413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  39.18 
 
 
291 aa  127  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1489  protein of unknown function DUF323  33.74 
 
 
261 aa  127  6e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000202441  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  36.75 
 
 
657 aa  126  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  38.03 
 
 
654 aa  126  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  35.07 
 
 
433 aa  126  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1133  protein of unknown function DUF323  35.31 
 
 
321 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  38.53 
 
 
523 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1993  protein of unknown function DUF323  34.57 
 
 
292 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2020  protein of unknown function DUF323  34.57 
 
 
292 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  36.76 
 
 
826 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2311  hypothetical protein  39.32 
 
 
224 aa  124  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.254882  normal  0.0358095 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  38.14 
 
 
398 aa  124  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  30.82 
 
 
426 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  35.91 
 
 
1132 aa  123  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  37.4 
 
 
292 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  34.38 
 
 
1104 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  33.59 
 
 
517 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2805  putative cytoplasmic protein  31.45 
 
 
226 aa  121  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  34.78 
 
 
517 aa  121  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  36.97 
 
 
277 aa  121  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>