More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0779 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  100 
 
 		 165 aa  322  2e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  56.21 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  56.94 
 
 		 162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  53.64 
 
 		 167 aa  163  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  57.86 
 
 		 147 aa  159  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  57.03 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  57.03 
 
 		 158 aa  157  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  57.04 
 
 		 163 aa  157  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  45.81 
 
 		 168 aa  157  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  57.03 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  52.6 
 
 		 163 aa  156  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  48.61 
 
 		 165 aa  150  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  60 
 
 		 166 aa  150  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  46.26 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  48.98 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  52.45 
 
 		 163 aa  148  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  46.36 
 
 		 168 aa  147  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  50 
 
 		 159 aa  147  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  46.58 
 
 		 164 aa  147  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  49.31 
 
 		 165 aa  147  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  49.31 
 
 		 165 aa  147  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  46.94 
 
 		 183 aa  147  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  46.58 
 
 		 165 aa  145  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  46.58 
 
 		 165 aa  145  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  44.97 
 
 		 167 aa  144  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  52.59 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  52 
 
 		 189 aa  140  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  45.51 
 
 		 165 aa  138  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  47.41 
 
 		 170 aa  138  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  49.65 
 
 		 518 aa  138  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  50.36 
 
 		 159 aa  137  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  51.97 
 
 		 164 aa  137  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  44.37 
 
 		 165 aa  137  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  44.44 
 
 		 218 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  46.71 
 
 		 173 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  43.45 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  45.45 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  43.66 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  45.77 
 
 		 167 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  47.76 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  45.77 
 
 		 167 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  47.76 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  45.77 
 
 		 167 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  45.77 
 
 		 167 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  45.77 
 
 		 167 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  44.22 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  41.22 
 
 		 164 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  47.01 
 
 		 165 aa  130  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  40.99 
 
 		 174 aa  130  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  42.28 
 
 		 174 aa  130  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  44.37 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  45.27 
 
 		 162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  44.37 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  44.37 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  44.37 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  44.37 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  44.37 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  45.16 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  44.37 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  44.37 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  44.37 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  46.27 
 
 		 165 aa  129  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  45.52 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  40.65 
 
 		 178 aa  128  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  40.38 
 
 		 178 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  49.32 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  48.72 
 
 		 169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  46.27 
 
 		 163 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  46.27 
 
 		 163 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  40.69 
 
 		 177 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  40.69 
 
 		 177 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  40.69 
 
 		 167 aa  127  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  40.69 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  43.26 
 
 		 175 aa  127  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  40.54 
 
 		 163 aa  127  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  39.74 
 
 		 164 aa  127  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  41.38 
 
 		 174 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  40.69 
 
 		 171 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  40.69 
 
 		 171 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  39.74 
 
 		 163 aa  127  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.82 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  40.69 
 
 		 171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  40.82 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  40.69 
 
 		 171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  41.67 
 
 		 164 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  40.82 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  40.82 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  40.82 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2218  chemotaxis protein CheW  46.05 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.4 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  41.38 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  41.38 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  41.38 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  41.38 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  40.4 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  39.22 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  41.38 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  40.4 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  42.03 
 
 		 174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  41.67 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>