More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6623 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6623  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 129 aa  268  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808088  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5680  Endoribonuclease L-PSP  98.45 
 
 		 129 aa  266  8.999999999999999e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.979461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4650  endoribonuclease L-PSP  85.94 
 
 		 129 aa  236  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0994249  normal  0.0444369 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6248  translation initiation inhibitor  79.2 
 
 		 128 aa  217  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0971244  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4550  endoribonuclease L-PSP  77.95 
 
 		 127 aa  212  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3088  endoribonuclease L-PSP  71.88 
 
 		 129 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0969  endoribonuclease L-PSP  75.59 
 
 		 133 aa  193  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401025  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2507  endoribonuclease L-PSP  67.97 
 
 		 136 aa  192  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.022272  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2779  endoribonuclease L-PSP family protein  68.75 
 
 		 128 aa  191  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2765  endoribonuclease L-PSP  66.94 
 
 		 128 aa  185  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6067  endoribonuclease L-PSP  66.94 
 
 		 128 aa  186  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2656  endoribonuclease L-PSP  66.94 
 
 		 128 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2127  endoribonuclease L-PSP  66.94 
 
 		 128 aa  185  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2789  endoribonuclease L-PSP  66.94 
 
 		 128 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2739  endoribonuclease L-PSP  66.94 
 
 		 128 aa  185  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0675  putative endoribonuclease L-PSP  66.13 
 
 		 166 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0179  endoribonuclease L-PSP, putative  66.13 
 
 		 128 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0838  YjgF family protein  66.13 
 
 		 128 aa  184  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0547  endoribonuclease L-PSP, putative  66.13 
 
 		 128 aa  184  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0660  endoribonuclease L-PSP  66.13 
 
 		 128 aa  184  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.239315  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2390  putative endoribonuclease L-PSP  66.13 
 
 		 128 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2768  putative endoribonuclease L-PSP  66.13 
 
 		 128 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0560  endoribonuclease L-PSP  65.32 
 
 		 128 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4773  putative endoribonuclease L-PSP  68.5 
 
 		 130 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.091821  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0642  Endoribonuclease L-PSP  72.48 
 
 		 128 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297456 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4057  YjgF family translation inhibitor  72.48 
 
 		 128 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0367  endoribonuclease L-PSP  71.17 
 
 		 128 aa  180  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2310  putative endoribonuclease L-PSP  68.42 
 
 		 123 aa  179  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.650904  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4019  endoribonuclease L-PSP  68.5 
 
 		 130 aa  178  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.658483  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4194  Endoribonuclease L-PSP  69.72 
 
 		 128 aa  170  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.705998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4304  Endoribonuclease L-PSP  69.72 
 
 		 128 aa  170  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135988  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03132  hypothetical protein  64.86 
 
 		 128 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.433124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2754  endoribonuclease L-PSP  53.97 
 
 		 129 aa  144  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0552  endoribonuclease L-PSP  56.35 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.897554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0090  endoribonuclease L-PSP  53.17 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0741494  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4897  putative endoribonuclease L-PSP  53.17 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3111  Endoribonuclease L-PSP  53.17 
 
 		 130 aa  133  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  46.09 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  43.65 
 
 		 130 aa  110  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0935  YjgF-like protein  42.86 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04783  hypothetical protein  43.59 
 
 		 125 aa  103  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05655  hypothetical protein  43.59 
 
 		 125 aa  103  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0751  endoribonuclease L-PSP, putative  45.54 
 
 		 123 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0701  putative endoribonuclease L-PSP  45.54 
 
 		 123 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  43.41 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 133 aa  94  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  45.95 
 
 		 141 aa  90.5  6e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  40.54 
 
 		 130 aa  89.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  38.84 
 
 		 133 aa  88.6  2e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  39.25 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3322  endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 		 94 aa  88.2  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.939467  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 125 aa  87.4  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  35.54 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11062  L-PSP endoribonuclease family protein Brt1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03780)  38.84 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174347  normal  0.127035 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2247  endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137208  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  34.65 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1878  endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3491  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  35.54 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  35.54 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09080  L-PSP endoribonuclease family protein (Hmf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02340)  37.04 
 
 		 161 aa  85.1  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 140 aa  84.7  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  37.8 
 
 		 128 aa  84.3  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 125 aa  84.3  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  36.04 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  44.14 
 
 		 131 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 127 aa  83.6  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  41.44 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 126 aa  83.6  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  44.14 
 
 		 131 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  43.24 
 
 		 130 aa  83.6  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  40.54 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2009  endoribonuclease  38.89 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>