30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2040 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2040  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  751    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1841  hypothetical protein  94.13 
 
 		 381 aa  697    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950642  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2223  hypothetical protein  53.99 
 
 		 382 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1059  hypothetical protein  50.94 
 
 		 377 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1014  hypothetical protein  45.28 
 
 		 380 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2009  hypothetical protein  40.6 
 
 		 376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  39.18 
 
 		 406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5180  hypothetical protein  36.93 
 
 		 391 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1660  hypothetical protein  37.83 
 
 		 486 aa  189  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3110  hypothetical protein  36.7 
 
 		 391 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0269  hypothetical protein  37.5 
 
 		 503 aa  186  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6297  hypothetical protein  37.09 
 
 		 406 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1332  hypothetical protein  39.53 
 
 		 556 aa  179  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.046842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3243  hypothetical protein  37.66 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.399185  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2266  conserved hypothetical proteinn  36.99 
 
 		 553 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.884358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2584  hypothetical protein  36.99 
 
 		 565 aa  171  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387529  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2309  hypothetical protein  36.68 
 
 		 565 aa  170  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  34.51 
 
 		 389 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2187  hypothetical protein  37.01 
 
 		 391 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00178939  normal  0.0794458 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  30.51 
 
 		 377 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  31 
 
 		 377 aa  119  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3571  hypothetical protein  28.67 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.751929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1843  hypothetical protein  28.1 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  31.9 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  31.2 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  25.75 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  26.24 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  33.09 
 
 		 365 aa  54.7  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  32.39 
 
 		 444 aa  50.1  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  30 
 
 		 363 aa  44.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>