More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1762 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1762  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
340 aa  702    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66245  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6060  extracellular solute-binding protein family 1  76.76 
 
 
340 aa  542  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3281  extracellular solute-binding protein  51.8 
 
 
343 aa  350  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1363  extracellular solute-binding protein  51.45 
 
 
340 aa  334  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.634696  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  49.52 
 
 
342 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0720  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  49.2 
 
 
341 aa  323  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.631762  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0676  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  49.2 
 
 
341 aa  323  2e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3115  extracellular solute-binding protein  49.26 
 
 
342 aa  322  4e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1097  extracellular solute-binding protein family 1  46.29 
 
 
337 aa  318  6e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4317  extracellular solute-binding protein  52.06 
 
 
343 aa  318  7e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.362014 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6061  extracellular solute-binding protein family 1  45.86 
 
 
342 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1761  extracellular solute-binding protein family 1  47.27 
 
 
341 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.0475771 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1991  extracellular solute-binding protein family 1  47.76 
 
 
342 aa  303  2.0000000000000002e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000248153  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1772  extracellular solute-binding protein family 1  42.69 
 
 
344 aa  290  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.320595  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1366  extracellular solute-binding protein family 1  42.11 
 
 
344 aa  285  5e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4977  extracellular solute-binding protein family 1  41.69 
 
 
347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  44.27 
 
 
344 aa  280  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0833  extracellular solute-binding protein  42.22 
 
 
343 aa  275  7e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0435  extracellular solute-binding protein, family 1  42.39 
 
 
343 aa  275  9e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2485  extracellular solute-binding protein family 1  42.36 
 
 
343 aa  269  4e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.390798  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0643  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  40.54 
 
 
346 aa  262  4.999999999999999e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121089  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0641  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  37.38 
 
 
343 aa  242  7e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147653  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0283  extracellular solute-binding protein family 1  36.84 
 
 
342 aa  225  8e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2993  extracellular solute-binding protein family 1  37.2 
 
 
350 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4649  extracellular solute-binding protein  36.51 
 
 
335 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4877  extracellular solute-binding protein  35.07 
 
 
340 aa  175  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.38801 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0009  extracellular solute-binding protein family 1  32.32 
 
 
379 aa  171  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.892782  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4607  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  37.68 
 
 
341 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.980284  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4473  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  37.68 
 
 
341 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144148 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1638  iron ABC transporter substrate-binding protein  34.78 
 
 
266 aa  158  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5008  extracellular solute-binding protein  38.78 
 
 
341 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5188  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  34.35 
 
 
341 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491174  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5135  ABC transporter, periplasmic binding protein  38.11 
 
 
341 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.659918  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0330  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  38.98 
 
 
341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.631264 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5525  extracellular solute-binding protein  37.09 
 
 
340 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.655164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3970  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.41 
 
 
358 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1235  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  29.41 
 
 
358 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1212  iron ABC transporter solute-binding protein  29.41 
 
 
358 aa  149  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1214  iron ABC transporter solute-binding protein  29.41 
 
 
358 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1476  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.41 
 
 
358 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1337  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  29.41 
 
 
358 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1411  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.41 
 
 
358 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2899  extracellular solute-binding protein  34.29 
 
 
345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00994055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5367  extracellular solute-binding protein  36.08 
 
 
341 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1374  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.13 
 
 
358 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1436  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  29.91 
 
 
346 aa  146  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1237  extracellular metal-binding protein  29.41 
 
 
358 aa  146  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1282  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  32.42 
 
 
347 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2746  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  34.19 
 
 
335 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.553799  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000766  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.47 
 
 
336 aa  143  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04877  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  34.85 
 
 
336 aa  143  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 
343 aa  142  6e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0811  extracellular solute-binding protein  33.01 
 
 
351 aa  142  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1048  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 
356 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 
350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1545  extracellular solute-binding protein family 1  34.43 
 
 
339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.061269  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2917  extracellular solute-binding protein family 1  36.07 
 
 
339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0545  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.01 
 
 
339 aa  139  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.001131  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5874  extracellular solute-binding protein  32.57 
 
 
341 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0333  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.853179  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0970  extracellular solute-binding protein  31.88 
 
 
340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000273849  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  31.25 
 
 
378 aa  133  5e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3159  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  33.99 
 
 
351 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.451295  normal  0.0280644 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3135  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  33.6 
 
 
351 aa  126  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4694  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 
349 aa  126  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6494  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  33.2 
 
 
351 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000128013  normal  0.750448 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2479  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.41 
 
 
347 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.79 
 
 
338 aa  123  4e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2476  ABC-type iron(III)-binding periplasmic protein precursor  28.57 
 
 
364 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000339151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5871  extracellular solute-binding protein family 1  28.88 
 
 
342 aa  119  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04090  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  29.23 
 
 
367 aa  119  9e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.510256 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5376  putative lipoprotein  33.62 
 
 
344 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4941  ABC transporter substrate-binding protein  31.91 
 
 
344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4956  ABC transporter substrate-binding protein  32.75 
 
 
344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5430  putative lipoprotein  32.31 
 
 
344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5110  putative lipoprotein  32.31 
 
 
344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5501  putative lipoprotein  32.31 
 
 
344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5350  putative lipoprotein  32.31 
 
 
344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5052  putative lipoprotein  32.77 
 
 
344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1588  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 
368 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5572  putative lipoprotein  31.88 
 
 
344 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5382  putative lipoprotein  31.88 
 
 
344 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3791  ABC transporter, substrate-binding protein  30.6 
 
 
344 aa  106  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2025  extracellular solute-binding protein family 1  28.32 
 
 
296 aa  105  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.727103  hitchhiker  0.0000000026678 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1201  extracellular solute-binding protein family 1  28.18 
 
 
320 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.523727 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  28.81 
 
 
333 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0223  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.23 
 
 
339 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1945  iron ABC transporter, iron-binding protein  24.76 
 
 
345 aa  99.4  9e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0223  hypothetical protein  26.64 
 
 
339 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.52 
 
 
341 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2031  ABC-type transporter, periplasmic component  28.92 
 
 
331 aa  94.7  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.702659  hitchhiker  0.000664756 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.19 
 
 
341 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1485  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 
470 aa  94.4  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0472403  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4046  putative periplasmic solute-binding protein  28.07 
 
 
335 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0699034  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0311  ABC transporter periplasmic-binding protein  29.29 
 
 
325 aa  93.2  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568515  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  27.52 
 
 
341 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.52 
 
 
341 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
341 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  27.52 
 
 
341 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1418  extracellular solute-binding protein family 1  30.59 
 
 
343 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.58033  normal  0.12139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>