31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5240 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5240  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  273  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1847  hypothetical protein  59.84 
 
 
141 aa  163  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107946  hitchhiker  0.000000216715 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3100  hypothetical protein  59.69 
 
 
131 aa  156  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3266  hypothetical protein  56.59 
 
 
133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3310  hypothetical protein  56.59 
 
 
133 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2316  hypothetical protein  55.73 
 
 
133 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2194  hypothetical protein  55.73 
 
 
133 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.449073  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1087  hypothetical protein  55.73 
 
 
133 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0512  hypothetical protein  55.73 
 
 
133 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.693618  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0656  hypothetical protein  56.92 
 
 
131 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1318  hypothetical protein  56.25 
 
 
130 aa  137  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381678  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2557  hypothetical protein  50 
 
 
125 aa  135  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2623  hypothetical protein  56.69 
 
 
131 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0681  hypothetical protein  56.15 
 
 
131 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3299  hypothetical protein  55.81 
 
 
133 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3849  hypothetical protein  56.35 
 
 
131 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.240023  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4598  hypothetical protein  40.65 
 
 
130 aa  99.4  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.947739  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4131  hypothetical protein  36.59 
 
 
136 aa  86.3  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10080  hypothetical protein  33.07 
 
 
125 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000466848  normal  0.805949 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2120  hypothetical protein  31.82 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0529263  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0931  hypothetical protein  33.62 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3881  nuclear transport factor 2  30.95 
 
 
157 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10050  hypothetical protein  30.25 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000195227  normal  0.8273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0928  hypothetical protein  30.25 
 
 
163 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6259  hypothetical protein  28.93 
 
 
160 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4723  hypothetical protein  30.95 
 
 
157 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3640  hypothetical protein  30.95 
 
 
157 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498973  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6230  hypothetical protein  30.77 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5954  hypothetical protein  29.91 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0660  hypothetical protein  29.66 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4113  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4192  hypothetical protein  26.27 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586568  hitchhiker  0.00703334 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>