23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5012 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5012  c-type cytochrome precursor  100 
 
 		 109 aa  211  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375656  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2079  hypothetical protein  90.36 
 
 		 129 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236411  normal  0.167695 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0076  hypothetical protein  53.33 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3271  hypothetical protein  52.81 
 
 		 110 aa  104  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2614  hypothetical protein  51.14 
 
 		 139 aa  99.4  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06730  putative c-type cytochrome precursor  51.02 
 
 		 119 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0618  putative c-type cytochrome precursor  51.02 
 
 		 119 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1443  hypothetical protein  54.32 
 
 		 109 aa  94.7  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4222  c-type cytochrome c55x  47.73 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2489  cytochrome c (c55X)  51.85 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1716  hypothetical protein  51.85 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1911  hypothetical protein  51.85 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.859056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3178  putative cytochrome c  46.6 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.733909  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3124  cytochrome c, mono- and diheme variants  38.14 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.412627  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  31.58 
 
 		 546 aa  55.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1583  cytochrome c class I  38.6 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.889837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1903  hypothetical protein  29.25 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172183  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  32.98 
 
 		 350 aa  43.9  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4229  heme-binding protein NirN  24.47 
 
 		 542 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3029  cytochrome d1 heme subunit  36.36 
 
 		 527 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1897  secretion protein HlyD  31.43 
 
 		 485 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00218638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02300  hypothetical protein  34.18 
 
 		 324 aa  40.4  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3323  cytochrome c, class I:cytochrome d1, heme region  29.79 
 
 		 576 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000018049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>