151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4971 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4971  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  100 
 
 		 119 aa  228  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4410  anti-sigma-factor antagonist  76.99 
 
 		 124 aa  168  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2971  anti-sigma-factor antagonist  74.36 
 
 		 124 aa  165  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2794  anti-sigma-factor antagonist  70.54 
 
 		 125 aa  157  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3743  anti-sigma-factor antagonist  69.03 
 
 		 125 aa  157  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0800  anti-sigma-factor antagonist  69.91 
 
 		 123 aa  156  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0977014  hitchhiker  0.00820415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2268  anti-sigma-factor antagonist  66.67 
 
 		 126 aa  156  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0511  anti-sigma-factor antagonist  68.14 
 
 		 133 aa  153  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3340  anti-sigma-factor antagonist  68.14 
 
 		 133 aa  153  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5230  anti-sigma-factor antagonist  68.14 
 
 		 133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2415  anti-sigma-factor antagonist  69.03 
 
 		 142 aa  150  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3134  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  66.37 
 
 		 120 aa  146  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1672  negative regulator of sigma-B  64.6 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0130  anti-sigma-factor antagonist  62.71 
 
 		 118 aa  144  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5778  anti-sigma-factor antagonist  60.18 
 
 		 125 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2487  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  60.18 
 
 		 123 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1218  negative regulator of sigma-B  61.06 
 
 		 140 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3136  anti-sigma-factor antagonist  60.18 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0981532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2117  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  59.29 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3767  anti-sigma-factor antagonist  57.52 
 
 		 128 aa  133  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0691716 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1493  anti-sigma-factor antagonist  57.98 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.423658  normal  0.0757983 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0475  anti-sigma-factor antagonist  57.26 
 
 		 120 aa  130  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32010  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  51.3 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0737154  normal  0.110426 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0163  anti-sigma-factor antagonist  48.65 
 
 		 127 aa  112  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.438455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0676  anti-sigma-factor antagonist  48.65 
 
 		 127 aa  112  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.483964  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0736  anti-sigma-factor antagonist  50.45 
 
 		 134 aa  110  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2683  anti-sigma-factor antagonist  44.44 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1474  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  44.83 
 
 		 123 aa  103  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000611379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3438  anti-sigma-factor antagonist  45.05 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0775335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1811  anti-sigma-factor antagonist  40.37 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3858  anti-sigma-factor antagonist  49.07 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0693  anti-sigma-factor antagonist  38.32 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6566  anti-sigma-factor antagonist  40.37 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778948  normal  0.044329 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0140  anti-sigma-factor antagonist  43.36 
 
 		 118 aa  83.6  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00670241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0196  anti-sigma-factor antagonist  36.61 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0995683  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4191  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 		 372 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  41.25 
 
 		 388 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  41.33 
 
 		 362 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  38.54 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  34.86 
 
 		 361 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  35.04 
 
 		 549 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4192  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 380 aa  61.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  37.38 
 
 		 275 aa  60.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  39.77 
 
 		 556 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2660  anti-sigma-factor antagonist  39.39 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  38.82 
 
 		 372 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0116  anti-sigma-factor antagonist  42.11 
 
 		 357 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00357246  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1810  anti-sigma-factor antagonist  34.51 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  36.78 
 
 		 323 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5196  anti-sigma-factor antagonist  34.26 
 
 		 365 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 361 aa  57.4  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3609  anti-sigma-factor antagonist  32.11 
 
 		 411 aa  57  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.196503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  32.11 
 
 		 421 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  38.96 
 
 		 430 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2322  anti-sigma-factor antagonist  34.17 
 
 		 521 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32020  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  39.02 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16584  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3859  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  40.91 
 
 		 428 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  38.27 
 
 		 523 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  31.76 
 
 		 357 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0141  anti-sigma-factor antagonist  32.48 
 
 		 298 aa  53.9  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0116373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3137  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 283 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225193  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  34.74 
 
 		 371 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0799  anti-sigma-factor antagonist  35.53 
 
 		 286 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224753  hitchhiker  0.00639287 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  32.71 
 
 		 312 aa  52.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  42.62 
 
 		 377 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0221  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 366 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2118  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  32.1 
 
 		 285 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.333632 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1856  anti-sigma-factor antagonist  38.96 
 
 		 365 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.616563 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  32.46 
 
 		 357 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  43.94 
 
 		 667 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4970  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  29.29 
 
 		 284 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0903  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 		 376 aa  51.2  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000110303  hitchhiker  0.00000527056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2937  anti-sigma-factor antagonist  31.78 
 
 		 271 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000434706  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.14 
 
 		 272 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3133  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  35.53 
 
 		 283 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2206  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 		 367 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  32.94 
 
 		 562 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3768  anti-sigma-factor antagonist  34.72 
 
 		 284 aa  50.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 445 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4325  anti-sigma-factor antagonist  32.43 
 
 		 359 aa  50.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0978917  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  30.7 
 
 		 388 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3473  anti-sigma-factor antagonist  42.67 
 
 		 422 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.551903  normal  0.0822697 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1492  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 282 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 286 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1894  anti-sigma-factor antagonist  32.65 
 
 		 344 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  33.82 
 
 		 281 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4420  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 271 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  29.63 
 
 		 694 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 		 509 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2416  anti-sigma-factor antagonist  34.72 
 
 		 288 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1219  positive regulator of sigma-B  34.72 
 
 		 286 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  29.82 
 
 		 439 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1921  putative PAS/PAC sensor protein  32.73 
 
 		 295 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  hitchhiker  0.0000024656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2296  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 342 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0948081  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2970  anti-sigma-factor antagonist  36.11 
 
 		 285 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528649 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4421  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 271 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0129  anti-sigma-factor antagonist  36.11 
 
 		 287 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2424  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 317 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>