More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4488 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2125  major facilitator superfamily MFS_1  73.38 
 
 		 537 aa  794    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4488  major facilitator transporter  100 
 
 		 541 aa  1073    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5000  major facilitator transporter  74.69 
 
 		 535 aa  763    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159102 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1697  major facilitator superfamily MFS_1  77.39 
 
 		 499 aa  780    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4577  major facilitator transporter  54.97 
 
 		 513 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1271  major facilitator transporter  54.36 
 
 		 513 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0142  major facilitator transporter  57.84 
 
 		 511 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0872  major facilitator transporter  54.45 
 
 		 513 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2320  major facilitator transporter  51.58 
 
 		 544 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0793665  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27430  putative multidrug efflux MFS transporter  52.54 
 
 		 530 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.700486 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4454  major facilitator transporter  54.07 
 
 		 513 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.544324  normal  0.740147 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3380  major facilitator superfamily MFS_1  52.44 
 
 		 509 aa  489  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.188058 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1705  major facilitator superfamily MFS_1  49.9 
 
 		 553 aa  455  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46380  major facilitator superfamily protein  49.32 
 
 		 518 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2303  major facilitator superfamily MFS_1  42.83 
 
 		 545 aa  436  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292812  normal  0.0663224 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2500  major facilitator transporter  43.52 
 
 		 577 aa  424  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.706515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1333  major facilitator transporter  45.42 
 
 		 535 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1156  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  40.61 
 
 		 524 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6435  major facilitator superfamily MFS_1  41.78 
 
 		 509 aa  334  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2527  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 522 aa  326  8.000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00900  inner membrane multidrug resistance transmembrane protein  40.28 
 
 		 498 aa  319  7e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1820  putative transporter protein  38.67 
 
 		 457 aa  307  3e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.398976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1814  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 522 aa  212  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0912576 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3991  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.69 
 
 		 527 aa  204  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.48 
 
 		 529 aa  198  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.3 
 
 		 539 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 		 540 aa  190  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.72 
 
 		 536 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.14 
 
 		 516 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1623  putative transport protein (permease)  29.13 
 
 		 545 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.39 
 
 		 516 aa  183  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  25.95 
 
 		 519 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  25.95 
 
 		 499 aa  181  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.94 
 
 		 542 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.94 
 
 		 542 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.39 
 
 		 516 aa  180  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.94 
 
 		 542 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.39 
 
 		 516 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.94 
 
 		 542 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.62 
 
 		 517 aa  178  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.23 
 
 		 535 aa  178  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.67 
 
 		 535 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.4 
 
 		 527 aa  178  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.47 
 
 		 539 aa  176  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.47 
 
 		 535 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.1 
 
 		 526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  27.49 
 
 		 539 aa  172  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.75 
 
 		 543 aa  172  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.02 
 
 		 538 aa  170  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.53 
 
 		 526 aa  170  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.67 
 
 		 535 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6362  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 526 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1466  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 526 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127999  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  24.17 
 
 		 534 aa  167  5.9999999999999996e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7029  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 526 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.97831  normal  0.626046 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  26.98 
 
 		 529 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.25 
 
 		 523 aa  163  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2067  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.99 
 
 		 527 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.04 
 
 		 514 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3676  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.96 
 
 		 504 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  27.33 
 
 		 528 aa  154  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.54 
 
 		 519 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.86 
 
 		 516 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0208  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 527 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.639267 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  23.91 
 
 		 524 aa  150  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4968  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 529 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0130308 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.54 
 
 		 515 aa  144  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48300  putative MFS transporter  27.09 
 
 		 503 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.966541  normal  0.132172 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.78 
 
 		 577 aa  144  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440847  normal  0.0484708 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5530  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.42 
 
 		 543 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214437  normal  0.30089 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1129  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.72 
 
 		 525 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.943729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.59 
 
 		 532 aa  140  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.54 
 
 		 517 aa  139  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3584  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  25.8 
 
 		 531 aa  139  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00201825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4010  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.53 
 
 		 519 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.16 
 
 		 537 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.87 
 
 		 511 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4472  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.33 
 
 		 519 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238318  normal  0.949404 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.87 
 
 		 511 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6206  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.09 
 
 		 520 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1261  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.86 
 
 		 519 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2226  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.66 
 
 		 511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2079  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.98 
 
 		 511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25 
 
 		 515 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4313  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  27.36 
 
 		 519 aa  135  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.43 
 
 		 532 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.88 
 
 		 527 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.88 
 
 		 527 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.88 
 
 		 527 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7509  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.59 
 
 		 517 aa  133  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5722  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.31 
 
 		 519 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102537  normal  0.245407 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.31 
 
 		 519 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.196393  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4583  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.31 
 
 		 519 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2415  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.2 
 
 		 517 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.15 
 
 		 521 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010623  Bphy_4020  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.91 
 
 		 518 aa  130  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490791  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.42 
 
 		 517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
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NC_012880  Dd703_2467  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.48 
 
 		 508 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.6 
 
 		 533 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4686  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.57 
 
 		 520 aa  128  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000722288  normal  0.323338 
 
 
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