258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3242 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3242  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 		 208 aa  431  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3404  DNA-3-methyladenine glycosylase I  80.29 
 
 		 208 aa  356  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0097  DNA-3-methyladenine glycosylase I  67.86 
 
 		 214 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235254  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  70.05 
 
 		 241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3540  DNA-3-methyladenine glycosylase I  67.86 
 
 		 224 aa  281  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1795  DNA-3-methyladenine glycosylase I  68.02 
 
 		 243 aa  275  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1724  DNA-3-methyladenine glycosylase I  67.51 
 
 		 241 aa  274  7e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4052  DNA-3-methyladenine glycosylase I  67.91 
 
 		 217 aa  271  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0359  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.94 
 
 		 212 aa  263  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0185  DNA-3-methyladenine glycosidase I  61.19 
 
 		 218 aa  256  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5808  3-methyladenine-DNA glycosylase  64.62 
 
 		 215 aa  256  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.05 
 
 		 215 aa  254  5e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1566  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.17 
 
 		 199 aa  254  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26816 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0502  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.44 
 
 		 209 aa  252  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0319202 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0147  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.11 
 
 		 197 aa  251  4.0000000000000004e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  decreased coverage  0.000000114522 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0775  DNA-3-methyladenine glycosylase I  65.52 
 
 		 235 aa  251  4.0000000000000004e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.54 
 
 		 209 aa  249  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0448  DNA-3-methyladenine glycosylase I  64.14 
 
 		 232 aa  248  7e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.231908  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.42 
 
 		 206 aa  247  8e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.635445  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  64.29 
 
 		 223 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484982  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1922  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.52 
 
 		 200 aa  240  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.98355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0399  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.59 
 
 		 211 aa  238  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.176376 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4098  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58 
 
 		 196 aa  230  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0662  3-methyladenine-DNA glycosylase  63.01 
 
 		 247 aa  215  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1033  putative DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.66 
 
 		 200 aa  214  8e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.374811  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3019  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.54 
 
 		 191 aa  209  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1178  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.7 
 
 		 198 aa  201  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.33 
 
 		 199 aa  201  6e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0699  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.87 
 
 		 193 aa  197  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.19 
 
 		 186 aa  194  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2351  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 		 194 aa  191  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0498  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.01 
 
 		 218 aa  191  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.539356  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4233  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.76 
 
 		 210 aa  191  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.358477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.4 
 
 		 186 aa  191  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.79 
 
 		 191 aa  190  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2148  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.01 
 
 		 199 aa  189  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177072  hitchhiker  0.0095029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0687  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.14 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.89 
 
 		 196 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4506  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.48 
 
 		 203 aa  186  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2189  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 		 202 aa  185  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.717911  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0652  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.87 
 
 		 189 aa  185  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.920187  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1991  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.93 
 
 		 220 aa  185  5e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0957402  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0495  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.07 
 
 		 195 aa  184  7e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8424  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.32 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.719422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  55 
 
 		 189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0108  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.63 
 
 		 197 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.81 
 
 		 194 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3007  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.45 
 
 		 196 aa  182  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288496  normal  0.0401678 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.57 
 
 		 187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  48.94 
 
 		 189 aa  182  4.0000000000000006e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50 
 
 		 187 aa  181  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11234  DNA-3-methyladenine glycosylase I tagA  52.11 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127053  normal  0.0780895 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4003  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.24 
 
 		 209 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0167  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4044  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3749  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4077  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.24 
 
 		 209 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0485352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.19 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054596  normal  0.395728 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.19 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.11 
 
 		 191 aa  179  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21800  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.75 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000054024  normal  0.248361 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0163  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.44 
 
 		 187 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0075  3-methyladenine DNA glycosylase  45.36 
 
 		 184 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000223645  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  49.44 
 
 		 187 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  49.44 
 
 		 187 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3977  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.44 
 
 		 187 aa  178  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0590  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.52 
 
 		 193 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.444252  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.44 
 
 		 187 aa  177  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4680  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.17 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.651754  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.67 
 
 		 208 aa  177  9e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5932  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.26 
 
 		 208 aa  176  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402448  decreased coverage  0.00154434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1102  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.05 
 
 		 192 aa  177  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.6 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1686  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.18 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00244866  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4228  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.68 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2862  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.67 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.67 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.67 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2725  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.34 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0175  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  48.62 
 
 		 193 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1101  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.04 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.11 
 
 		 198 aa  175  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2464  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.38 
 
 		 192 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.89 
 
 		 187 aa  175  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0050  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.03 
 
 		 190 aa  175  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.184428  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0493  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.64 
 
 		 204 aa  175  5e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000244091  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06360  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.89 
 
 		 193 aa  175  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.73 
 
 		 194 aa  174  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.66 
 
 		 186 aa  174  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.1 
 
 		 223 aa  174  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.801121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2005  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.11 
 
 		 192 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00955834  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2985  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.4 
 
 		 198 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233863 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4170  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.77 
 
 		 187 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3347  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.72 
 
 		 200 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.93 
 
 		 198 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4452  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.31 
 
 		 187 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.748727  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.89 
 
 		 192 aa  174  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0477  3-methyladenine DNA glycosylase  44 
 
 		 196 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0571733  normal  0.984687 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7198  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.48 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717856  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0021  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.03 
 
 		 190 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>