141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3140 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A3140  putative sulfite oxidase subunit YedZ  100 
 
 
225 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.591759  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3277  putative sulfite oxidase subunit YedZ  77.4 
 
 
224 aa  332  4e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3258  putative sulfite oxidase subunit YedZ  76.32 
 
 
218 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378481  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2911  putative sulfite oxidase subunit YedZ  73.98 
 
 
218 aa  301  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2980  putative sulfite oxidase subunit YedZ  72.5 
 
 
217 aa  300  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.726094  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2803  putative sulfite oxidase subunit YedZ  60.32 
 
 
237 aa  223  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10625  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0706  ferric reductase domain-containing protein  59.68 
 
 
192 aa  222  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0285  putative sulfite oxidase subunit YedZ  61.54 
 
 
233 aa  221  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0707437  normal  0.850327 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0363  putative sulfite oxidase subunit YedZ  57.28 
 
 
228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429028  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3607  putative sulfite oxidase subunit YedZ  53.21 
 
 
232 aa  215  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0127038  hitchhiker  0.000000030871 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0303  putative sulfite oxidase subunit YedZ  51.74 
 
 
233 aa  215  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2723  putative sulfite oxidase subunit YedZ  56.52 
 
 
228 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0384  putative sulfite oxidase subunit YedZ  56.52 
 
 
228 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3483  putative sulfite oxidase subunit YedZ  58.51 
 
 
229 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0312  putative sulfite oxidase subunit YedZ  52.21 
 
 
229 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0350  putative sulfite oxidase subunit YedZ  49.36 
 
 
244 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991818 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3710  putative sulfite oxidase subunit YedZ  54.02 
 
 
241 aa  205  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3453  putative sulfite oxidase subunit YedZ  54.02 
 
 
241 aa  205  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3768  putative sulfite oxidase subunit YedZ  54.02 
 
 
241 aa  205  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2757  putative sulfite oxidase subunit YedZ  55.05 
 
 
237 aa  204  9e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.931978  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3738  putative sulfite oxidase subunit YedZ  55.05 
 
 
237 aa  204  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.574894  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3195  putative sulfite oxidase subunit YedZ  55.05 
 
 
237 aa  204  9e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.339313  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1899  putative sulfite oxidase subunit YedZ  55.05 
 
 
237 aa  204  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207633  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1135  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  55.19 
 
 
222 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3032  putative sulfite oxidase subunit YedZ  58.2 
 
 
236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0668  ferric reductase domain-containing protein  52.88 
 
 
219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0776  ferric reductase-like transmembrane component-like  51.1 
 
 
216 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0437  hypothetical protein  54.17 
 
 
217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2915  ferric reductase-like transmembrane component-like  50.53 
 
 
213 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.250358  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1008  ferric reductase-like transmembrane subunit  47.37 
 
 
204 aa  178  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0221304  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1563  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  52.6 
 
 
227 aa  175  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.140464  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0694  Ferric reductase domain protein transmembrane component  50 
 
 
219 aa  168  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0620  hypothetical protein  48.47 
 
 
221 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.496074  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0714  ferric reductase domain-containing protein  50 
 
 
219 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0843  putative sulfite oxidase subunit YedZ  54.43 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.602495  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0537  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  54.14 
 
 
214 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0191676  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5585  ferric reductase domain-containing protein  51.45 
 
 
210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.553247  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0988  ferric reductase domain-containing protein  52.46 
 
 
206 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707095  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3876  putative sulfite oxidase subunit YedZ  46.2 
 
 
213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1504  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  52.17 
 
 
183 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2500  putative sulfite oxidase subunit YedZ  41.49 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1682  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  47.19 
 
 
215 aa  145  6e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.364132  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0594  putative sulfite oxidase subunit YedZ  48.65 
 
 
208 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0397  ferric reductase domain-containing protein  49.4 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0907023 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1457  putative sulfite oxidase subunit YedZ  41.8 
 
 
222 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1367  putative sulfite oxidase subunit YedZ  43.46 
 
 
220 aa  135  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4119  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  46.58 
 
 
262 aa  134  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0229721  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0991  putative sulfite oxidase subunit YedZ  43.46 
 
 
220 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0933  putative sulfite oxidase subunit YedZ  43.46 
 
 
220 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  37.77 
 
 
585 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1359  putative sulfite oxidase subunit YedZ  41.27 
 
 
218 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0423483  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3976  hypothetical protein  42.13 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.193582  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0383  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  41.34 
 
 
207 aa  128  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.246088  normal  0.99107 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1012  putative sulfite oxidase subunit YedZ  45.03 
 
 
217 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2135  ferric reductase domain-containing protein  41.14 
 
 
214 aa  126  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1982  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.25 
 
 
209 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  0.690265 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2239  ferric reductase domain-containing protein  37.44 
 
 
642 aa  123  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0544393  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2818  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.78 
 
 
201 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.216317  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3632  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.88 
 
 
209 aa  122  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54686  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0887  ferric reductase domain-containing protein  38.17 
 
 
206 aa  122  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000512451  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2412  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.42 
 
 
217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00136958  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2102  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.75 
 
 
207 aa  115  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0694492  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0878  putative sulfite oxidase subunit YedZ  51.72 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2618  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.16 
 
 
213 aa  113  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0914643  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2484  ferric reductase domain-containing protein  48.89 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0757906  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0172  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  39.38 
 
 
294 aa  112  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0624  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40 
 
 
202 aa  112  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.85566 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0134  putative sulfite oxidase subunit YedZ  42.76 
 
 
199 aa  112  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0171637  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1411  putative sulfite oxidase subunit YedZ  43.29 
 
 
201 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0078  putative sulfite oxidase subunit YedZ  43.29 
 
 
201 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.883139  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1463  ferric reductase domain-containing protein  40.82 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00178479  normal  0.0312857 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2056  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.57 
 
 
222 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000305808  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2282  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.57 
 
 
222 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00247521  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1258  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  38.22 
 
 
293 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3979  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.41 
 
 
200 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4556  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.04 
 
 
222 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2270  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.04 
 
 
222 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00342161  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1636  ferric reductase domain-containing protein  39.75 
 
 
295 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3512  ferric reductase domain-containing protein  40.46 
 
 
288 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0143111  normal  0.239118 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2412  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.16 
 
 
209 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2103  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.04 
 
 
222 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0228743  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2856  ferric reductase domain-containing protein  36.56 
 
 
199 aa  106  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.375369  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1679  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  39.64 
 
 
211 aa  105  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000019316  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01887  hypothetical protein  39.64 
 
 
211 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000861435  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01877  hypothetical protein  39.64 
 
 
211 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000576969  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2013  ferric reductase-like transmembrane component-like  35.26 
 
 
215 aa  105  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.289046  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2751  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.05 
 
 
211 aa  105  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.191385 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2073  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.64 
 
 
211 aa  105  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.68925e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2203  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.64 
 
 
211 aa  105  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00810237  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0911  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.64 
 
 
211 aa  105  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000937496  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1673  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.64 
 
 
211 aa  105  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00398621  normal  0.198757 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1213  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.64 
 
 
211 aa  105  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0027785  normal  0.48109 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0759  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.32 
 
 
204 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000000056762  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4673  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.52 
 
 
203 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140051  hitchhiker  0.000000915612 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0577  ferric reductase domain-containing protein  34.25 
 
 
206 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4675  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.32 
 
 
197 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0326305  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1892  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.22 
 
 
208 aa  101  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.770034  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2050  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  41.06 
 
 
200 aa  101  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106334  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2043  putative sulfite oxidase subunit YedZ  32.81 
 
 
215 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2108  putative sulfite oxidase subunit YedZ  33.33 
 
 
215 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.181471  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>