40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2690 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2690  DoxX  100 
 
 		 152 aa  301  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.360255  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  51.26 
 
 		 154 aa  111  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3395  DoxD family protein  51.22 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2361  DoxX family protein  51.67 
 
 		 160 aa  107  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0941  DoxX family protein  45 
 
 		 145 aa  98.6  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  43.55 
 
 		 151 aa  97.8  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2957  hypothetical protein  53.45 
 
 		 155 aa  97.4  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002082  membrane protein  45 
 
 		 151 aa  97.1  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02374  hypothetical protein  46 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.861023  normal  0.0466865 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4399  DoxX family protein  45.27 
 
 		 156 aa  93.6  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4289  DoxX family protein  45.27 
 
 		 156 aa  93.6  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  43.8 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  43.8 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  34 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  39.42 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0755  DoxX family protein  34.96 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  36.29 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4682  thiosulphate:quinone oxidoreductase (TQO) small subunit(DoxD domain)  36.79 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  38.68 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  33.33 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  35.16 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2030  DoxX family protein  35.71 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6307  DoxX family protein  38.93 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188963  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1002  hypothetical protein  34.58 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  33.82 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0727  hypothetical protein  29.85 
 
 		 738 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0707  hypothetical protein  29.1 
 
 		 738 aa  50.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1432  DoxX family protein  32.43 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4649  DoxX  32.43 
 
 		 174 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  35.09 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0584  hypothetical protein  34.55 
 
 		 165 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399737  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  33.08 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  32.14 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  30.88 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2188  DoxX family protein  37.21 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62019  normal  0.793728 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  33.88 
 
 		 139 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  31.78 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0990  DoxX family protein  37.01 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  32.31 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1027  DoxX family protein  41.24 
 
 		 155 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.692978 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>