More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2475 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2475  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
354 aa  728    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0798325  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0854  serine/threonine protein kinase  85.26 
 
 
353 aa  608  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362337  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2278  serine/threonine protein kinase  78.01 
 
 
341 aa  551  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.657438  normal  0.323559 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1958  serine/threonine protein kinase  77.78 
 
 
341 aa  551  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.023746  normal  0.247779 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2157  protein kinase  77.71 
 
 
323 aa  528  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000803751  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3581  serine/threonine protein kinase  58.76 
 
 
340 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0460595  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0860  serine/threonine protein kinase  57.73 
 
 
338 aa  365  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2030  serine/threonine protein kinase  57.53 
 
 
343 aa  363  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0925  serine/threonine protein kinase  57.39 
 
 
338 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2707  serine/threonine protein kinase  57.29 
 
 
322 aa  362  6e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1627  serine/threonine protein kinase  57.39 
 
 
335 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0178037  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1337  serine/threonine protein kinase  57.04 
 
 
335 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59169  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0813  protein kinase  55.59 
 
 
335 aa  351  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4158  protein kinase  55.67 
 
 
340 aa  351  1e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0475  Serine/threonine protein kinase  56.9 
 
 
314 aa  340  2e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4327  serine/threonine protein kinase  56.12 
 
 
335 aa  340  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3849  serine/threonine protein kinase  56.85 
 
 
314 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66894  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4022  transcriptional regulator, XRE family  55.44 
 
 
315 aa  325  8.000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0707  serine/threonine protein kinase  59.25 
 
 
292 aa  318  6e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.576216 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0045  serine/threonine protein kinase  52.84 
 
 
319 aa  301  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
1430 aa  190  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3014  serine/threonine protein kinase  35.99 
 
 
480 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0603  serine/threonine protein kinase  38.49 
 
 
628 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0624  protein kinase  38.49 
 
 
660 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  36.76 
 
 
715 aa  179  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4054  serine/threonine protein kinase  36.81 
 
 
645 aa  172  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.892911 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1493  putative protein kinase  34.33 
 
 
488 aa  172  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0215  serine/threonine protein kinase  35.15 
 
 
723 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3838  serine/threonine protein kinase  34.52 
 
 
687 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0145005  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1466  serine/threonine protein kinase  34.03 
 
 
661 aa  162  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0256  serine/threonine protein kinase  35.53 
 
 
877 aa  159  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400.1  serine/threonine protein kinase  35.4 
 
 
865 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760518  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1202  serine/threonine protein kinase  35.4 
 
 
883 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1781  serine/threonine protein kinase  35.4 
 
 
865 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2837  protein kinase  35.4 
 
 
861 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333958  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0451  serine/threonine protein kinase  35.4 
 
 
852 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148587  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2962  protein kinase  35.4 
 
 
865 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0080  serine/threonine protein kinase  36.05 
 
 
928 aa  154  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1421  serine/threonine protein kinase  37.2 
 
 
871 aa  154  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.27367 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2867  serine/threonine protein kinase  36.3 
 
 
615 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446  normal  0.384542 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1598  serine/threonine protein kinase  35.4 
 
 
862 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2448  serine/threonine protein kinase  33.93 
 
 
476 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.387808  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1698  serine/threonine protein kinase  38.52 
 
 
461 aa  150  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00790624  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1611  serine/threonine protein kinase  34.02 
 
 
1198 aa  149  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.174837  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4141  serine/threonine protein kinase  33.86 
 
 
446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1590  serine/threonine protein kinase  34.02 
 
 
769 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135919  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4059  serine/threonine protein kinase  35.99 
 
 
657 aa  146  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000205723 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1994  serine/threonine protein kinase  32.23 
 
 
349 aa  144  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0495985  normal  0.225513 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0519  serine/threonine protein kinase  34.13 
 
 
639 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1612  serine/threonine protein kinase  35.39 
 
 
708 aa  142  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.927771  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26690  Protein kinase  33.33 
 
 
592 aa  142  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00328654  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3060  serine/threonine protein kinase  33.97 
 
 
602 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799021  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3424  Serine/threonine protein phosphatase-like protein  31.73 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.305204  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  35.95 
 
 
623 aa  129  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  29.94 
 
 
617 aa  128  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3359  serine/threonine protein kinase  31.91 
 
 
664 aa  127  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.49747 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1546  serine/threonine protein kinase-like protein  30.51 
 
 
582 aa  126  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.6 
 
 
930 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3129  serine/threonine protein kinase  31.41 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.021779  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3866  protein kinase  31.09 
 
 
373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956512  normal 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0032  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.65 
 
 
707 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.438373  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0801  serine/threonine protein kinase  33.45 
 
 
471 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3337  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.1 
 
 
662 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 
705 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3360  serine/threonine protein kinase  29.58 
 
 
656 aa  112  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0976665 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.33 
 
 
551 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2290  serine/threonine protein kinase  36.15 
 
 
560 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.770072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0762  Serine/threonine protein kinase  31.99 
 
 
380 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.239085  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  32.07 
 
 
554 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 
639 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.36 
 
 
512 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 
639 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.89 
 
 
596 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4391  Serine/threonine protein kinase  32.19 
 
 
546 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000198345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  29.01 
 
 
616 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  30.51 
 
 
855 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.18 
 
 
521 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0927  serine/threonine protein kinase  32.37 
 
 
553 aa  100  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2990  Serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 
442 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000108087  normal  0.539453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  28.81 
 
 
861 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.19 
 
 
636 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  29.74 
 
 
710 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.77 
 
 
532 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.38 
 
 
707 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1213  serine/threonine protein kinase  31.65 
 
 
273 aa  97.1  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2278  serine/threonine protein kinase  28.92 
 
 
752 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0612166  hitchhiker  0.00000196574 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  31.66 
 
 
464 aa  96.3  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.27 
 
 
641 aa  96.3  7e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  28.87 
 
 
468 aa  96.3  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  30.38 
 
 
524 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.36 
 
 
1076 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  30.34 
 
 
638 aa  95.5  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  29.86 
 
 
418 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  31.22 
 
 
468 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.36 
 
 
1072 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6755  serine/threonine protein kinase  30.58 
 
 
597 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1642  serine/threonine protein kinase  28.38 
 
 
500 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  29.04 
 
 
678 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  31.56 
 
 
575 aa  94  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.36 
 
 
1072 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>