More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1562 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1562  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
258 aa  521  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1436  enoyl-CoA hydratase  81.57 
 
 
269 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185731  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2158  enoyl-CoA hydratase  69.08 
 
 
261 aa  338  5e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3755  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.8 
 
 
251 aa  254  9e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4618  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.53 
 
 
263 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2352  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.49 
 
 
253 aa  228  7e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0605839  normal  0.0748288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3627  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.45 
 
 
214 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.270403  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2803  enoyl-CoA hydratase  46.67 
 
 
248 aa  209  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72856  decreased coverage  0.00019128 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2604  enoyl-CoA hydratase  47.72 
 
 
271 aa  209  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.888828  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3826  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.44 
 
 
260 aa  208  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3981  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.15 
 
 
257 aa  204  8e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2065  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.23 
 
 
255 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.702116 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13583  enoyl-CoA hydratase  45.11 
 
 
247 aa  203  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5068  enoyl-CoA hydratase  44.64 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4683  enoyl-CoA hydratase  44.64 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4769  enoyl-CoA hydratase  44.64 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0532353  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5266  enoyl-CoA hydratase  44.21 
 
 
251 aa  198  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.167755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1381  enoyl-CoA hydratase  47.46 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1490  enoyl-CoA hydratase  44.64 
 
 
251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5876  enoyl-CoA hydratase  41.25 
 
 
268 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2743  enoyl-CoA hydratase  45.96 
 
 
259 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6159  enoyl-CoA hydratase  38.8 
 
 
258 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5498  enoyl-CoA hydratase  39.83 
 
 
253 aa  165  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.03 
 
 
257 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181739  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1532  enoyl-CoA hydratase  39.36 
 
 
254 aa  157  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.383816  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3752  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 
256 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.59 
 
 
260 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1562  enoyl-CoA hydratase  38.56 
 
 
254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.649225  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 
266 aa  145  5e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  34.66 
 
 
257 aa  145  9e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
257 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 
258 aa  142  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.51 
 
 
258 aa  142  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.69 
 
 
257 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
258 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  37.2 
 
 
258 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.2 
 
 
258 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.63 
 
 
259 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  36.51 
 
 
258 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
258 aa  135  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.73 
 
 
265 aa  135  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  38.15 
 
 
263 aa  135  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.1 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  32.54 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.21 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.1 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.1 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  37.34 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.2 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.07 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 
257 aa  133  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 
257 aa  133  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.34 
 
 
259 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 
257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.63 
 
 
259 aa  132  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  39.11 
 
 
260 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.01 
 
 
258 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.22 
 
 
260 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 
258 aa  131  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  32.14 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1663  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 
367 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.283423 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.09 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  32.14 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.41 
 
 
258 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.89 
 
 
258 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  36.48 
 
 
257 aa  129  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 
260 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 
258 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.83 
 
 
259 aa  129  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 
257 aa  129  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  32.14 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.48 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  32.14 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  32.14 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0829  enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  35.86 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  32.14 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.8 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  32.14 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  32.14 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  32.14 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3413  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 
266 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  31.35 
 
 
258 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.18 
 
 
256 aa  128  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.93 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.14 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.56 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  37.34 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.52 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  36.99 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.93 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  37.04 
 
 
262 aa  126  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>