141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0991 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0991  urease accessory protein UreD  100 
 
 		 289 aa  574  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271998  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0957  urease accessory protein UreD  72.7 
 
 		 293 aa  431  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0865404  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1865  Urease accessory protein UreD  60.54 
 
 		 295 aa  346  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.479381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2188  Urease accessory protein UreD  59.87 
 
 		 295 aa  342  5e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2036  urease accessory protein ureD  59.87 
 
 		 295 aa  338  4e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.133178  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1499  urease accessory protein UreD  53.6 
 
 		 321 aa  275  8e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2181  urease accessory protein UreD  53.6 
 
 		 291 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3132  UreD-family accessory protein  53.6 
 
 		 346 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0727  urease accessory protein UreD  53.6 
 
 		 291 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2560  urease accessory protein UreD  53.6 
 
 		 291 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3072  urease accessory protein UreD  53.6 
 
 		 291 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3108  urease accessory protein UreD  53.6 
 
 		 291 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2053  urease accessory protein UreD  53.6 
 
 		 291 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4009  urease accessory protein UreD  54.45 
 
 		 291 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1197  urease accessory protein UreD  47.14 
 
 		 301 aa  268  8.999999999999999e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.294974  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3688  putative urease accessory protein  51.09 
 
 		 293 aa  265  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139672 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0782  urease accessory protein UreD  51.7 
 
 		 291 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0793  urease accessory protein UreD  51.7 
 
 		 291 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2256  urease accessory protein UreD  51.09 
 
 		 293 aa  262  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2487  urease accessory protein UreD  52.67 
 
 		 291 aa  262  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0949  Urease accessory protein UreD  50 
 
 		 293 aa  255  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0873  urease accessory protein UreD  52.31 
 
 		 291 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1186  urease accessory protein UreD  50.87 
 
 		 305 aa  253  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0903  urease accessory protein UreD  51.6 
 
 		 291 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0424  urease accessory protein UreD  51.25 
 
 		 291 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  42.61 
 
 		 293 aa  212  4.9999999999999996e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  44.52 
 
 		 288 aa  212  7.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1238  urease accessory protein UreD  39.71 
 
 		 329 aa  189  5e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2883  urease accessory protein UreD  40.5 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1770  urease accessory protein UreD  40 
 
 		 285 aa  186  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2938  urease accessory protein UreD  36.73 
 
 		 277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3101  Urease accessory protein UreD  40.73 
 
 		 277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09910  Urease accessory protein UreD  40.35 
 
 		 279 aa  172  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930917  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2414  urease accessory protein UreD  35.27 
 
 		 277 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2444  urease accessory protein UreD  37.09 
 
 		 274 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792758  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0696  urease accessory protein UreD  38.11 
 
 		 278 aa  168  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0585  urease accessory protein UreD  37.85 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3936  Urease accessory protein UreD  36.97 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  37.59 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4431  urease accessory protein UreD  35.54 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2308  urease accessory protein UreD  38.6 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2842  urease accessory protein UreD  36 
 
 		 277 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2847  urease accessory protein UreD  36 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598121  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4890  urease accessory protein UreD  34.84 
 
 		 281 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1092  urease accessory protein UreD  38.13 
 
 		 278 aa  158  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0218  urease accessory protein D  34.71 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.842987 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3376  urease accessory protein UreD  37.01 
 
 		 276 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2996  urease accessory protein UreD  37.63 
 
 		 298 aa  155  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64335  urease accessory protein  36.65 
 
 		 280 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5585  urease accessory protein  36.65 
 
 		 280 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1004  urease accessory protein UreD  35.13 
 
 		 276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3971  Urease accessory protein UreD  35.69 
 
 		 276 aa  152  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0879  urease accessory protein UreD  34.62 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  34.18 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3463  urease accessory protein UreD  32.85 
 
 		 274 aa  149  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000478315  normal  0.195729 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0742  UreD-family accessory protein  38.52 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.16649 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0953  urease accessory protein UreD  32.17 
 
 		 312 aa  142  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1414  urease accessory protein UreD  39.7 
 
 		 276 aa  142  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421382 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1082  urease accessory protein UreD  37.72 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1390  urease accessory protein UreD  33.45 
 
 		 276 aa  132  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00886  putative urease accessory protein UreD  29.86 
 
 		 320 aa  132  9e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1024  urease accessory protein UreD  34.91 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2991  urease accessory protein UreD  27.84 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.866149 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4154  urease accessory protein UreD  37.82 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0989  urease accessory protein UreD  28.94 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1707  Urease accessory protein UreD  30.47 
 
 		 286 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2718  urease accessory protein UreD  30.34 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.274036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3209  Urease accessory protein UreD  33.82 
 
 		 266 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2062  Urease accessory protein UreD  29.04 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000769283  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2370  urease accessory protein  40.3 
 
 		 281 aa  90.5  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.512779 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1083  urease accessory protein UreD  28.21 
 
 		 321 aa  90.1  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1137  urease accessory protein UreD  28.21 
 
 		 321 aa  90.1  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0397  Urease accessory protein UreD  33.46 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585213  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2014  Urease accessory protein UreD  29.32 
 
 		 282 aa  85.5  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2680  urease accessory protein UreD  29 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0683  urease accessory protein UreD  23.69 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29781  urease accessory protein UreD  26.74 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3020  urease accessory protein UreD  32.74 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3486  urease accessory protein  29.52 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3245  Urease accessory protein UreD  33.56 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1052  urease accessory protein UreD  28.46 
 
 		 307 aa  82  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1463  Urease accessory protein UreD  28.07 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  34.02 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1301  urease accessory protein UreD  28.07 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5120  Urease accessory protein UreD  26.67 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_004310  BR1362  urease accessory protein UreD  27.5 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  33.56 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0396  Urease accessory protein UreD  27.72 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  33.56 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1318  urease accessory protein UreD  27.14 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19231  urease accessory protein UreD  27.11 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.480391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2389  urease accessory protein UreD  28.29 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.274527 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2254  urease accessory protein D  27.08 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1683  urease accessory protein UreD  28.29 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2469  urease accessory protein UreD  36.17 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7013  putative urease accessory protein UreD  32.89 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4047  urease accessory protein UreD  34.17 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2455  urease accessory protein UreD  27.3 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3057  Urease accessory protein UreD  29.52 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3308  urease accessory protein UreD  28.41 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0886683  normal  0.364033 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>