More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3460 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3460  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  100 
 
 		 388 aa  768    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640133 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2722  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  90.39 
 
 		 389 aa  680    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.601213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0221  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  70.87 
 
 		 392 aa  508  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  56.1 
 
 		 393 aa  449  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1416  acetylornithine aminotransferase  55.84 
 
 		 415 aa  408  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0956406 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.56 
 
 		 391 aa  387  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0348  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.38 
 
 		 395 aa  364  1e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.276087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  46.89 
 
 		 403 aa  354  2e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  50.39 
 
 		 380 aa  342  8e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.06 
 
 		 385 aa  332  6e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.98 
 
 		 393 aa  330  2e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  43.19 
 
 		 394 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  42.89 
 
 		 390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  42.78 
 
 		 386 aa  317  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.32 
 
 		 397 aa  317  2e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  42.35 
 
 		 395 aa  315  6e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  42.09 
 
 		 395 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  41.1 
 
 		 385 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  43.43 
 
 		 386 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  40.84 
 
 		 385 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  40 
 
 		 394 aa  312  6.999999999999999e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  46.15 
 
 		 399 aa  311  9e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  44.01 
 
 		 398 aa  311  2e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  42.11 
 
 		 386 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  40.66 
 
 		 395 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.58 
 
 		 387 aa  305  7e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  44.47 
 
 		 396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1499  aminotransferase class-III  45.01 
 
 		 375 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.66 
 
 		 400 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4153  acetylornithine aminotransferase  43.43 
 
 		 386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  44.87 
 
 		 402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  40.31 
 
 		 394 aa  302  6.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  40.31 
 
 		 394 aa  302  6.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  44.39 
 
 		 398 aa  302  6.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  42.97 
 
 		 398 aa  300  2e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  39.49 
 
 		 396 aa  301  2e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4037  acetylornithine aminotransferase  42.63 
 
 		 386 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4352  acetylornithine aminotransferase  42.63 
 
 		 386 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.200619  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4239  acetylornithine aminotransferase  42.63 
 
 		 386 aa  299  5e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3876  acetylornithine aminotransferase  42.63 
 
 		 386 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3884  acetylornithine aminotransferase  42.9 
 
 		 386 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  45.64 
 
 		 399 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0997  acetylornithine aminotransferase  42.11 
 
 		 386 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1758  aminotransferase class-III  47.18 
 
 		 384 aa  296  3e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  43.48 
 
 		 396 aa  296  5e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  41.24 
 
 		 386 aa  296  5e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  43.67 
 
 		 386 aa  296  6e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  43.08 
 
 		 397 aa  294  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  40.71 
 
 		 400 aa  293  3e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0283  aminotransferase  44.78 
 
 		 392 aa  293  3e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  43.12 
 
 		 397 aa  293  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.53 
 
 		 395 aa  292  6e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2613  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.01 
 
 		 375 aa  292  7e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1167  aminotransferase class-III  44.78 
 
 		 381 aa  291  1e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000969494 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  42.05 
 
 		 386 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0767  aminotransferase class-III  40.43 
 
 		 380 aa  290  3e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000633967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  41.19 
 
 		 396 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  42.34 
 
 		 398 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2767  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.9 
 
 		 403 aa  289  6e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3630  ornithine--oxo-acid transaminase  40.1 
 
 		 399 aa  288  9e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  39.8 
 
 		 418 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1923  aminotransferase class-III  44.23 
 
 		 381 aa  288  1e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.779903  normal  0.0552026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  39.8 
 
 		 418 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  42.09 
 
 		 400 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  44.65 
 
 		 399 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1822  aminotransferase  38.12 
 
 		 402 aa  286  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1404  aminotransferase class-III  43.41 
 
 		 383 aa  286  5e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.443564  normal  0.505281 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0325  aminotransferase class-III  45.48 
 
 		 382 aa  286  5.999999999999999e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0068  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.26 
 
 		 375 aa  285  9e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.413029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.67 
 
 		 417 aa  285  9e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3466  ornithine--oxo-acid transaminase  41.21 
 
 		 415 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3918  ornithine--oxo-acid transaminase  40.1 
 
 		 399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.64 
 
 		 413 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  41.9 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0322  ornithine aminotransferase  39.79 
 
 		 403 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  39.21 
 
 		 388 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.42 
 
 		 427 aa  283  3.0000000000000004e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  44.68 
 
 		 395 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  44.24 
 
 		 390 aa  282  7.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.83 
 
 		 399 aa  282  8.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  43.98 
 
 		 414 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  42.49 
 
 		 397 aa  281  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  39.14 
 
 		 403 aa  280  3e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2138  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.04 
 
 		 383 aa  280  3e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.78 
 
 		 408 aa  280  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.08 
 
 		 398 aa  280  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.25 
 
 		 393 aa  280  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0686  ornithine--oxo-acid transaminase  37.24 
 
 		 398 aa  280  4e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000099191  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  43.7 
 
 		 444 aa  280  4e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  39.8 
 
 		 418 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3854  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.51 
 
 		 408 aa  279  6e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  38.54 
 
 		 426 aa  279  7e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  38.82 
 
 		 396 aa  278  9e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.34 
 
 		 399 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0169  N2-acetyl-L-lysine aminotransferase / acetylornithine aminotransferase  42.23 
 
 		 386 aa  278  1e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000199062  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0775  aminotransferase class-III  41.78 
 
 		 376 aa  278  2e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.97 
 
 		 401 aa  276  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3025  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.51 
 
 		 393 aa  276  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.048422  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2984  acetylornithine aminotransferase  45.09 
 
 		 402 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0590766 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.72 
 
 		 416 aa  276  4e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>