190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1740 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1740  phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 
159 aa  310  6.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2131  phosphohistidine phosphatase, SixA  89.31 
 
 
159 aa  283  5e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0168  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.36 
 
 
168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4293  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.51 
 
 
169 aa  101  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0542365  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0423  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  42.26 
 
 
168 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.762465 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1872  phosphohistidine phosphatase, SixA  43.71 
 
 
169 aa  98.2  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.322395  normal  0.942928 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2712  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.42 
 
 
164 aa  95.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.409858  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.04 
 
 
164 aa  92  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.95 
 
 
174 aa  91.7  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0305  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.51 
 
 
164 aa  90.1  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.81 
 
 
161 aa  88.6  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1244  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.88 
 
 
161 aa  87.8  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2645  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.26 
 
 
167 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0613  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.79 
 
 
162 aa  85.5  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.639252  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1034  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.15 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.691963 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1196  phosphohistidine phosphatase SixA  40.58 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1207  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.94 
 
 
162 aa  82  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2562  phosphohistidine phosphatase SixA  39.55 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3490  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.14 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1581  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.3 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.511675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2564  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.71 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000228315  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26931  phosphohistidine phosphatase SixA  40.71 
 
 
175 aa  79  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4088  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.82 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2758  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.55 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4278  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.36 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0216  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.8 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.68 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2108  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.76 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0878  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.29 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348757 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0590  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.91 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1407  phosphohistidine phosphatase, SixA  32 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1376  phosphohistidine phosphatase, SixA  32 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4928  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.71 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.85 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2231  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.64 
 
 
173 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.571995  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3154  phosphohistidine phosphatase SixA  26.85 
 
 
166 aa  67  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0131638  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09860  phosphohistidine phosphatase SixA  35 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.48313  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0942  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.27 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.574003  normal  0.218126 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1955  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.18 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.187267  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2314  phosphohistidine phosphatase SixA  34.18 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.889503  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2799  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.72 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545604  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1703  phosphohistidine phosphatase SixA  37.25 
 
 
218 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.412618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2441  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.52 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.681319 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1996  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.88 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03624e-17 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2629  phosphohistidine phosphatase  30.43 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000296858 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2576  phosphohistidine phosphatase  30.43 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  30.43 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2616  phosphohistidine phosphatase  30.43 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6448  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1502  phosphohistidine phosphatase SixA  37.25 
 
 
152 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1532  phosphohistidine phosphatase SixA  37.25 
 
 
152 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0198  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.4 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0796  phosphohistidine phosphatase SixA  36.6 
 
 
152 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1309  phosphohistidine phosphatase SixA  36.6 
 
 
152 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0591  phosphohistidine phosphatase SixA  36.6 
 
 
152 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0561  phosphohistidine phosphatase SixA  36.6 
 
 
153 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820244  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.65 
 
 
153 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0380  phosphohistidine phosphatase  31.68 
 
 
163 aa  60.8  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2758  phosphohistidine phosphatase SixA  36.6 
 
 
216 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0235368  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2018  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.03 
 
 
153 aa  60.5  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.13 
 
 
152 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2414  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.56 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2932  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.24 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1635  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.45 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2056  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.81 
 
 
166 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1534  phosphohistidine phosphatase SixA  30.28 
 
 
166 aa  58.9  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  29.81 
 
 
161 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1087  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.23 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.321142 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2247  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.43 
 
 
157 aa  58.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.3872  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02264  phosphohistidine phosphatase  28.93 
 
 
161 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1317  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.93 
 
 
161 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02225  hypothetical protein  28.93 
 
 
161 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2719  phosphohistidine phosphatase  28.93 
 
 
161 aa  57.4  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1313  phosphohistidine phosphatase  28.93 
 
 
161 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.144029  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2491  phosphohistidine phosphatase  28.93 
 
 
161 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2636  phosphohistidine phosphatase  28.93 
 
 
161 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.710371  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1402  phosphohistidine phosphatase  31.06 
 
 
163 aa  57.4  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.81 
 
 
162 aa  57.4  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2498  phosphohistidine phosphatase  28.93 
 
 
161 aa  57  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826923  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2623  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.84 
 
 
153 aa  57  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  0.742312 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3482  phosphohistidine phosphatase  28.93 
 
 
161 aa  57  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2880  phosphohistidine phosphatase  29.45 
 
 
161 aa  57  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00688568  normal  0.224606 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2007  phosphohistidine phosphatase SixA homolog  31.01 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2215  phosphohistidine phosphatase SixA  34.15 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0188  phosphohistidine phosphatase SixA  31.01 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2067  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.74 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002860  phosphohistidine phosphatase SixA  25.48 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2016  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.86 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.492708  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15010  phosphohistidine phosphatase SixA  31.13 
 
 
462 aa  56.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000021868  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0142  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.13 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.124831  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29020  phosphohistidine phosphatase SixA  34.96 
 
 
156 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1998  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.85 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4453  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.41 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243085  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1276  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.23 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1295  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.66 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1730  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.13 
 
 
172 aa  55.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0829  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.41 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1667  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.93 
 
 
157 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1310  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.41 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593656  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0099  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.53 
 
 
158 aa  55.1  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.239035  normal  0.0377722 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2465  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.29 
 
 
152 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101249  normal  0.921134 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>