59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0918 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0918  YceI family protein  100 
 
 		 275 aa  538  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3479  YceI family protein  81.59 
 
 		 269 aa  435  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482205 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0502  YceI family protein  43.64 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000406201  decreased coverage  0.00000051699 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0535  YceI family protein  45.02 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0504  YceI family protein  33.71 
 
 		 267 aa  92.4  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0863373  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0400  hypothetical protein  31.36 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00289936  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3521  YceI family protein  31.89 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.761218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28440  hypothetical protein  32.67 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.533417 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2969  YceI family protein  29.89 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3289  YceI family protein  32.67 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0734  YceI family protein  27.98 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  36.27 
 
 		 178 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1178  hypothetical protein  28.77 
 
 		 191 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000879388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  27.17 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  27.17 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  27.17 
 
 		 191 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  27.17 
 
 		 191 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  27.17 
 
 		 191 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  27.17 
 
 		 191 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  30.56 
 
 		 177 aa  52.8  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  25.52 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  25.34 
 
 		 177 aa  50.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  29.77 
 
 		 184 aa  50.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  27.4 
 
 		 191 aa  48.9  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  27.32 
 
 		 196 aa  49.3  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  30.47 
 
 		 195 aa  48.9  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  23.49 
 
 		 191 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  27.03 
 
 		 191 aa  47  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  25.95 
 
 		 189 aa  46.6  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  26.45 
 
 		 208 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  37.04 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  36.26 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  26.62 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  27.94 
 
 		 179 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  31.03 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  27.46 
 
 		 204 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2124  YceI family protein  27.04 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.97033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  30.15 
 
 		 182 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  28.98 
 
 		 201 aa  43.5  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  25.33 
 
 		 191 aa  43.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3701  YceI  28.67 
 
 		 187 aa  43.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  25.33 
 
 		 191 aa  43.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  36 
 
 		 181 aa  42.7  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  27.03 
 
 		 191 aa  42.7  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  28.03 
 
 		 201 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  24.63 
 
 		 188 aa  42.7  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  27.13 
 
 		 176 aa  42.4  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3370  hypothetical protein  27.4 
 
 		 191 aa  42.7  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  25.16 
 
 		 214 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1264  YceI family protein  25.56 
 
 		 173 aa  42.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2265  YceI  41.18 
 
 		 219 aa  42.4  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  25.33 
 
 		 191 aa  42.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  25.33 
 
 		 191 aa  42.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  25.33 
 
 		 191 aa  42.4  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  25.33 
 
 		 191 aa  42.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  25.33 
 
 		 191 aa  42.4  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  25.33 
 
 		 191 aa  42.4  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  27.39 
 
 		 183 aa  42  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  28 
 
 		 201 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>