29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2619 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2619  hypothetical protein  100 
 
 		 767 aa  1590    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.373268 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1868  hypothetical protein  93.09 
 
 		 818 aa  1491    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141951  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2637  hypothetical protein  93.74 
 
 		 767 aa  1507    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.594259  normal  0.040177 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0471  hypothetical protein  41.84 
 
 		 771 aa  598  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1985  hypothetical protein  40.89 
 
 		 771 aa  591  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.229709  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5563  hypothetical protein  27.73 
 
 		 792 aa  282  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1874  hypothetical protein  27.54 
 
 		 753 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4229  hypothetical protein  25.24 
 
 		 722 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0264095  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1721  RloC protein, putative  25.98 
 
 		 776 aa  193  1e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0566  hypothetical protein  25.77 
 
 		 810 aa  189  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.913605  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3987  hypothetical protein  24.8 
 
 		 803 aa  183  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1503  hypothetical protein  24.36 
 
 		 792 aa  165  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.269689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3703  hypothetical protein  22.37 
 
 		 710 aa  95.9  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  22.62 
 
 		 770 aa  85.5  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0033  hypothetical protein  22.79 
 
 		 743 aa  84.7  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1151  hypothetical protein  23.38 
 
 		 743 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1533  hypothetical protein  27.34 
 
 		 757 aa  82.4  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1488  hypothetical protein  36.59 
 
 		 144 aa  74.3  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.016792  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  26.92 
 
 		 717 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2644  hypothetical protein  26.79 
 
 		 643 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0106  hypothetical protein  22.15 
 
 		 721 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4238  hypothetical protein  29.03 
 
 		 746 aa  54.3  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648959  hitchhiker  0.00399627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  31 
 
 		 895 aa  53.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6595  hypothetical protein  20.73 
 
 		 880 aa  51.2  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1085  DNA repair ATPase-like protein  29.76 
 
 		 741 aa  51.2  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0841172  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0698  hypothetical protein  32.74 
 
 		 156 aa  48.9  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  34.44 
 
 		 844 aa  48.5  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2348  hypothetical protein  27.54 
 
 		 162 aa  45.4  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7587  SMC domain-containing protein  22.84 
 
 		 873 aa  44.3  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328529  normal  0.0896714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>