More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1984 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1984  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
381 aa  753    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0694  histidinol-phosphate aminotransferase  98.91 
 
 
367 aa  714    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.843102  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3083  histidinol-phosphate aminotransferase  80.11 
 
 
367 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1981  histidinol-phosphate aminotransferase  68.85 
 
 
370 aa  486  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0652  histidinol-phosphate aminotransferase  66.12 
 
 
381 aa  454  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2088  histidinol-phosphate aminotransferase  68.96 
 
 
372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3473  histidinol-phosphate aminotransferase  64.37 
 
 
341 aa  417  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2648  histidinol-phosphate aminotransferase  56.01 
 
 
376 aa  398  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0635  histidinol-phosphate aminotransferase  56.01 
 
 
377 aa  383  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.532524  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0630  histidinol-phosphate aminotransferase  56.01 
 
 
404 aa  383  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.538864  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0933  histidinol-phosphate aminotransferase  60.33 
 
 
371 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  56.44 
 
 
370 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517108  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1120  histidinol-phosphate aminotransferase  54.52 
 
 
371 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.120881 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0665  histidinol-phosphate aminotransferase  55.15 
 
 
373 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1423  histidinol-phosphate aminotransferase  54.06 
 
 
357 aa  361  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  34.72 
 
 
386 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3157  aminotransferase  38.28 
 
 
369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  30.2 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  31.67 
 
 
362 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  34.3 
 
 
370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  33.23 
 
 
392 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  31.61 
 
 
386 aa  163  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  35.17 
 
 
374 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  30.23 
 
 
370 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  30.51 
 
 
370 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  34.03 
 
 
367 aa  161  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  30.79 
 
 
370 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  30.23 
 
 
370 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  30.23 
 
 
370 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  30.93 
 
 
372 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  30.23 
 
 
370 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  34.93 
 
 
371 aa  155  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  38.8 
 
 
364 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  33.63 
 
 
383 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  33.73 
 
 
362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  34.13 
 
 
370 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1408  histidinol-phosphate aminotransferase  33.42 
 
 
370 aa  153  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  30.94 
 
 
380 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  30.03 
 
 
370 aa  152  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  29.28 
 
 
370 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  32.5 
 
 
370 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  30.41 
 
 
380 aa  150  5e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  33.73 
 
 
370 aa  150  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  34.52 
 
 
369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  34.83 
 
 
374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 
353 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  32.57 
 
 
352 aa  148  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692015  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  34.04 
 
 
378 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  31.59 
 
 
353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2550  histidinol-phosphate aminotransferase  36.23 
 
 
368 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  35.52 
 
 
365 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1133  histidinol-phosphate aminotransferase  30.19 
 
 
353 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  34.88 
 
 
374 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1593  histidinol-phosphate aminotransferase  35.5 
 
 
372 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.0868494 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  31.03 
 
 
357 aa  145  9e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  31.37 
 
 
370 aa  145  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  31.56 
 
 
350 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  31.69 
 
 
355 aa  145  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1974  histidinol-phosphate aminotransferase  29.78 
 
 
369 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  32.57 
 
 
370 aa  144  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  28.7 
 
 
366 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  29.91 
 
 
370 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  28.61 
 
 
366 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  28.91 
 
 
373 aa  143  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  34.47 
 
 
385 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3830  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 
353 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  32.93 
 
 
370 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4034  histidinol-phosphate aminotransferase  34.27 
 
 
364 aa  142  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  31.56 
 
 
350 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  33.15 
 
 
371 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2345  histidinol-phosphate aminotransferase  32.87 
 
 
356 aa  142  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155092  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  27.53 
 
 
351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  34.89 
 
 
365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  29.77 
 
 
366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  29.47 
 
 
366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  31.33 
 
 
356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0764  histidinol-phosphate aminotransferase  29.07 
 
 
352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3771  histidinol-phosphate aminotransferase  30.23 
 
 
370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0747  histidinol-phosphate aminotransferase  29.07 
 
 
352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0166  histidinol-phosphate aminotransferase  32.82 
 
 
352 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  0.633959 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  34.23 
 
 
370 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  30.56 
 
 
370 aa  140  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1874  histidinol-phosphate aminotransferase  35.5 
 
 
372 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292128  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1979  histidinol-phosphate aminotransferase  29.49 
 
 
369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  35.28 
 
 
362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  30.7 
 
 
362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  30.12 
 
 
371 aa  139  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  28.08 
 
 
369 aa  139  7e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  30.33 
 
 
365 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1479  histidinol-phosphate aminotransferase  34.55 
 
 
362 aa  139  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  34.17 
 
 
357 aa  139  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  35.37 
 
 
374 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57770  histidinol-phosphate aminotransferase  31.84 
 
 
351 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  33.92 
 
 
365 aa  138  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1646  histidinol-phosphate aminotransferase  35.24 
 
 
372 aa  138  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  30.08 
 
 
350 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0591  histidinol-phosphate aminotransferase  28.33 
 
 
356 aa  138  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0082  aminotransferase class I and II  28.61 
 
 
390 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  34.17 
 
 
394 aa  137  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  28.7 
 
 
366 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>