More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00889 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00889  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 343 aa  690    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1375  alcohol dehydrogenase  69.23 
 
 		 342 aa  483  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6148  alcohol dehydrogenase  68.73 
 
 		 343 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6441  alcohol dehydrogenase  68.73 
 
 		 343 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5179  alcohol dehydrogenase  52.19 
 
 		 348 aa  333  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6430  alcohol dehydrogenase  51.78 
 
 		 338 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.400755 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5668  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.19 
 
 		 339 aa  316  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1066  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.49 
 
 		 339 aa  316  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743833  normal  0.0804762 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3044  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  48.05 
 
 		 338 aa  305  6e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3732  alcohol dehydrogenase  47.04 
 
 		 336 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.564534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2555  alcohol dehydrogenase  43.92 
 
 		 339 aa  275  9e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.726644  normal  0.319996 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0669  alcohol dehydrogenase  45.24 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0513  alcohol dehydrogenase  45.24 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.24 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0602082  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0491  alcohol dehydrogenase  45.24 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0372  alcohol dehydrogenase  42.65 
 
 		 342 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.92 
 
 		 335 aa  244  9.999999999999999e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0236  alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 		 337 aa  243  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 		 342 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  35.56 
 
 		 342 aa  190  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2398  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.01 
 
 		 333 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.947201 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1883  alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 		 350 aa  189  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.38 
 
 		 350 aa  189  8e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1817  alcohol dehydrogenase  34.49 
 
 		 350 aa  189  8e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  35.94 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 		 343 aa  186  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 		 344 aa  186  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  34.04 
 
 		 342 aa  185  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02580  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  33.95 
 
 		 333 aa  185  9e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.338069  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2080  alcohol dehydrogenase  32.85 
 
 		 348 aa  185  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.266825  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3275  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.82 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  33.92 
 
 		 347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2391  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4279  alcohol dehydrogenase  32.56 
 
 		 348 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371426  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2666  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.71 
 
 		 347 aa  182  6e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.435861  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.35 
 
 		 336 aa  182  9.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3956  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  33.83 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.762904 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2974  alcohol dehydrogenase  34.04 
 
 		 350 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1144  alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.257229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  35.78 
 
 		 340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2101  alcohol dehydrogenase  37.54 
 
 		 340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0255  alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 		 347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2975  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.72 
 
 		 339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.7 
 
 		 337 aa  180  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 		 342 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.97 
 
 		 342 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 		 342 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 		 350 aa  179  8e-44  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.4 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.13 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.74 
 
 		 341 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  34.24 
 
 		 344 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  34.49 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  34.49 
 
 		 342 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  34.26 
 
 		 336 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  34.36 
 
 		 342 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13061  NADP-dependent alcohol dehydrogenase adhC  32.57 
 
 		 346 aa  176  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0701661 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.05 
 
 		 341 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.05 
 
 		 341 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.05 
 
 		 341 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.05 
 
 		 341 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.05 
 
 		 341 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.05 
 
 		 357 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4359  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.24 
 
 		 343 aa  175  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1449  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.12 
 
 		 333 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1475  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.12 
 
 		 333 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  34.01 
 
 		 348 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 		 344 aa  173  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2121  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 		 359 aa  172  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0931  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.78 
 
 		 339 aa  172  9e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  32.93 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6150  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.13 
 
 		 351 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5967  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.01 
 
 		 349 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.283316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0400  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.39 
 
 		 352 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.654367 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.62 
 
 		 348 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.167935 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3293  alcohol dehydrogenase  31.89 
 
 		 352 aa  170  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.566343  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.94 
 
 		 344 aa  169  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.94 
 
 		 344 aa  169  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1541  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.62 
 
 		 409 aa  169  5e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5515  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.88 
 
 		 353 aa  169  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.174034 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2018  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.58 
 
 		 348 aa  169  9e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.94 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3605  alcohol dehydrogenase  31.58 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1719  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.42 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1400  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.84 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.31 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.706145 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  34.12 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0632  putative NADP-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  31.7 
 
 		 352 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0114  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.79 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  0.0906479 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19290  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  32.38 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8883  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.49 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.62 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0028  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.84 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0233433  decreased coverage  0.000000000133046 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  32.32 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3120  alcohol dehydrogenase  35.09 
 
 		 350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.895638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.09 
 
 		 350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3104  alcohol dehydrogenase  35.09 
 
 		 350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3048  alcohol dehydrogenase  32.82 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1694  alcohol dehydrogenase  32.22 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3042  alcohol dehydrogenase  35.09 
 
 		 350 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>