29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00347 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00347  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  312  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1333  hypothetical protein  37.25 
 
 		 164 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.419421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1990  hypothetical protein  41.55 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0471488  normal  0.098607 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2296  hypothetical protein  36.91 
 
 		 175 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3475  hypothetical protein  36.24 
 
 		 176 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.189272  normal  0.870698 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2580  hypothetical protein  37.16 
 
 		 270 aa  100  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2462  hypothetical protein  36.91 
 
 		 175 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.871251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1303  hypothetical protein  38.93 
 
 		 173 aa  98.2  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2411  hypothetical protein  42.02 
 
 		 192 aa  98.2  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02980  putative transmembrane protein  38.19 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29070  hypothetical protein  40.94 
 
 		 160 aa  94.4  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2471  hypothetical protein  36.18 
 
 		 175 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal  0.331692 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3887  hypothetical protein  39.84 
 
 		 264 aa  88.6  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1442  hypothetical protein  39.35 
 
 		 189 aa  87.4  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000142032  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2300  signal peptide protein  41.43 
 
 		 164 aa  84.7  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3219  hypothetical protein  35.81 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.289131 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1441  hypothetical protein  37.61 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0147619  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4703  hypothetical protein  38.1 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0493  hypothetical protein  30.43 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2622  hypothetical protein  32.43 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0128  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  32.03 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1448  hypothetical protein  27.63 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0595  hypothetical protein  30.82 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.5318399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2917  hypothetical protein  26.47 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.582849  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1415  hypothetical protein  26.39 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0753464  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  32.58 
 
 		 184 aa  47  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  28.23 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  29.77 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0553  hypothetical protein  24.84 
 
 		 191 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>