56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1676 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1676  chemotactic signal-response protein CheL  100 
 
 		 114 aa  235  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109399 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3795  chemotactic signal-response protein CheL  79.46 
 
 		 113 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4433  chemotactic signal-response protein CheL  71.56 
 
 		 111 aa  168  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1496  chemotactic signal-response protein CheL  71.03 
 
 		 115 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1343  chemotactic signal-response protein CheL  69.7 
 
 		 131 aa  150  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1110  chemotactic signal-response protein CheL  66.35 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.250313  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5521  chemotactic signal-response protein CheL  66.04 
 
 		 130 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.901812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4189  hypothetical protein  46.25 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4705  hypothetical protein  45.57 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00630861  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5549  hypothetical protein  47.37 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  41.38 
 
 		 109 aa  73.6  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3042  hypothetical protein  43.42 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3266  hypothetical protein  43.42 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2555  hypothetical protein  42.47 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818029 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3239  hypothetical protein  45.07 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0946  hypothetical protein  35.14 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000907933  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3690  chemotactic signal-response protein CheL  37.84 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1152  putative FlgJ-like flagellar protein  31.17 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4205  flagellar protein FlgJ, putative  36.11 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.346346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0112  rod binding protein-like protein  27.1 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121381  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1953  hypothetical protein  32.43 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3453  hypothetical protein  31.71 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2336  hypothetical protein  23.46 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0435  flagellar protein FlgJ-like protein  36 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3046  flagellar protein FlgJ-like protein  32.58 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50380  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.8 
 
 		 400 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0038351  hitchhiker  0.00140941 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4292  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.99 
 
 		 400 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3758  rod binding protein-like protein  34.78 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4102  rod binding protein-like protein  34.85 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106959  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0003  putative chemotactic signal-response protein CheL  33.33 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3842  rod binding protein-like protein  34.78 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348653 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1334  chemotactic signal-response protein CheL  33.33 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.406333  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0269  hypothetical protein  36.84 
 
 		 178 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0286  hypothetical protein  34.21 
 
 		 183 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.48956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1034  hypothetical protein  36.05 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1129  hypothetical protein  36.05 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3363  putative flagellar protein FlgJ  31.33 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1697  hypothetical protein  40 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.091579 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  26.32 
 
 		 605 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3706  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.9 
 
 		 361 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal  0.0583488 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1232  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.72 
 
 		 291 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1232  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.76 
 
 		 291 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4783  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.9 
 
 		 361 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.186683 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1157  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  42.4  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4183  hypothetical protein  36.05 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0348  hypothetical protein  30.26 
 
 		 187 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2405  hypothetical protein  27.5 
 
 		 197 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3277  flagellar protein FlgJ-like protein  34.62 
 
 		 128 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0667  hypothetical protein  36.36 
 
 		 156 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302556 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2976  flagellar protein FlgJ, putative  37.04 
 
 		 96 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0350  flagellar protein flgJ  34.15 
 
 		 361 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0592688  normal  0.0502498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0380  hypothetical protein  29.11 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2832  Rod binding protein-like protein  27.16 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3786  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.82 
 
 		 332 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1664  hypothetical protein  31.25 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.516137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  29.41 
 
 		 243 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>