More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1592 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 346 aa  697    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  78.1 
 
 		 313 aa  492  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  75.33 
 
 		 332 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0866  glycosyl transferase family protein  62.38 
 
 		 327 aa  381  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0256  glycosyl transferase family protein  63.16 
 
 		 317 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.0678648 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2299  glycosyl transferase family protein  58.86 
 
 		 332 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2940  glycosyl transferase family protein  59.29 
 
 		 318 aa  352  5e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0173  glycosyl transferase family 2  57.05 
 
 		 325 aa  347  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  56.58 
 
 		 322 aa  346  4e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0549  glycosyl transferase family protein  61.06 
 
 		 321 aa  340  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000233931  normal  0.956589 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0021  glycosyl transferase family 2  55.15 
 
 		 330 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0585  glycosyl transferase family protein  59.34 
 
 		 310 aa  326  3e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3000  glycosyl transferase family 2  60.57 
 
 		 330 aa  325  5e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4209  glycosyl transferase family 2  54.28 
 
 		 346 aa  323  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.220629 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4281  glycosyl transferase family 2  52.86 
 
 		 335 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4546  glycosyl transferase family 2  52.7 
 
 		 335 aa  311  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947898  normal  0.992745 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0148  succinoglycan biosynthesis protein  52.81 
 
 		 334 aa  310  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4442  glycosyl transferase family 2  56.25 
 
 		 314 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4380  glycosyl transferase family 2  56.25 
 
 		 314 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  49.49 
 
 		 307 aa  301  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  49.51 
 
 		 314 aa  290  3e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  48.38 
 
 		 324 aa  281  9e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  46.39 
 
 		 310 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1737  glycosyl transferase family protein  45.7 
 
 		 312 aa  255  8e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1566  cell wall membrane glycosyltransferase  45.7 
 
 		 314 aa  247  2e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.901523  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1400  glycosyltransferase-like protein  44.94 
 
 		 317 aa  246  6e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5439  glycosyl transferase family protein  42.95 
 
 		 318 aa  239  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.431845 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1495  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.025805  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  32.76 
 
 		 303 aa  153  5e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  33.79 
 
 		 315 aa  152  8e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  36.73 
 
 		 305 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  37.86 
 
 		 310 aa  150  4e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1802  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.319238  normal  0.13058 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  31.06 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1662  glycosyl transferase family protein  33.45 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0916  glycosyl transferase family 2  31.85 
 
 		 336 aa  137  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  32.86 
 
 		 344 aa  137  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1537  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 308 aa  133  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0778  glycosyl transferase family protein  30.98 
 
 		 305 aa  126  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2780  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 394 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  32.57 
 
 		 221 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  31.88 
 
 		 410 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  31.58 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  32.01 
 
 		 287 aa  106  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  29.45 
 
 		 298 aa  106  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 		 355 aa  106  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  30.87 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 		 378 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  32.77 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.7 
 
 		 410 aa  103  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  30.55 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  32.48 
 
 		 272 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.01 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0447  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397578  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 448 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 		 414 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 		 226 aa  97.4  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 		 340 aa  97.8  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3852  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 		 271 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 		 287 aa  97.8  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  28.72 
 
 		 285 aa  97.1  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 		 299 aa  96.7  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 		 420 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 		 411 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 		 336 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 		 414 aa  94  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6738  glycosyl transferase family 2  30.97 
 
 		 257 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0240271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0478  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 		 371 aa  93.2  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1727  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 		 329 aa  92.4  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.350304  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 		 305 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3976  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 514 aa  90.9  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 		 374 aa  89.7  7e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  27.2 
 
 		 293 aa  89.7  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0341  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 		 302 aa  89.7  7e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 		 227 aa  89.4  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5602  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 		 412 aa  89.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.922712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  25 
 
 		 328 aa  89.4  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  31.8 
 
 		 253 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 		 527 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  35.04 
 
 		 480 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 		 531 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 		 527 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  30.2 
 
 		 406 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  26.26 
 
 		 304 aa  86.7  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 430 aa  86.3  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 		 291 aa  86.3  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  30.77 
 
 		 412 aa  85.9  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 		 266 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001053  glycosyltransferase  25 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  25.55 
 
 		 230 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  24.55 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1057  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  23.73 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>