More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0687 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  78.14 
 
 		 461 aa  731    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  69.48 
 
 		 460 aa  659    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  86.36 
 
 		 462 aa  797    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  76.89 
 
 		 462 aa  691    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  100 
 
 		 462 aa  926    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  57.57 
 
 		 459 aa  457  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  57.57 
 
 		 459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  55.78 
 
 		 452 aa  433  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  53.35 
 
 		 478 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  47.78 
 
 		 457 aa  371  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0823  cytochrome P450  44.8 
 
 		 450 aa  336  5e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4522  cytochrome P450  44.42 
 
 		 455 aa  299  8e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  39.59 
 
 		 465 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  38.84 
 
 		 462 aa  268  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  39.25 
 
 		 470 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  39.1 
 
 		 480 aa  267  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  38.43 
 
 		 467 aa  261  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  37.72 
 
 		 464 aa  260  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  38.72 
 
 		 466 aa  257  4e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  38.72 
 
 		 466 aa  256  5e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  35.97 
 
 		 464 aa  250  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  35.19 
 
 		 466 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3268  cytochrome P450  35.84 
 
 		 466 aa  239  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  34.76 
 
 		 470 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  35.02 
 
 		 462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  36.83 
 
 		 453 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  32.34 
 
 		 484 aa  229  6e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  33.84 
 
 		 452 aa  225  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  36.13 
 
 		 463 aa  222  8e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  30.72 
 
 		 468 aa  222  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  33.33 
 
 		 454 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  35.73 
 
 		 471 aa  216  9e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  35.73 
 
 		 471 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  32.61 
 
 		 462 aa  212  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  35.09 
 
 		 463 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  35.61 
 
 		 473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  31 
 
 		 448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2396  cytochrome P450  34.78 
 
 		 449 aa  200  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0570158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  32.54 
 
 		 463 aa  200  3.9999999999999996e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  32.52 
 
 		 466 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  30.73 
 
 		 448 aa  197  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  32.21 
 
 		 482 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  32.89 
 
 		 455 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  29.67 
 
 		 453 aa  197  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  29.67 
 
 		 453 aa  196  7e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  29.67 
 
 		 453 aa  196  8.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  32.89 
 
 		 458 aa  196  9e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.338094 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  30.84 
 
 		 1365 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  31.6 
 
 		 459 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  31.07 
 
 		 447 aa  193  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  33.42 
 
 		 437 aa  192  7e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  31.38 
 
 		 1380 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  33.24 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  32.94 
 
 		 454 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  35.82 
 
 		 470 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  31.15 
 
 		 1373 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  31.15 
 
 		 1373 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  31.15 
 
 		 1373 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  31.15 
 
 		 1373 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  31.15 
 
 		 1373 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  31.15 
 
 		 1373 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  30.93 
 
 		 1373 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  28.81 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  30.63 
 
 		 452 aa  187  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4559  cytochrome P450  31.21 
 
 		 463 aa  187  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539028 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  29.24 
 
 		 446 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  32.83 
 
 		 452 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  30.91 
 
 		 458 aa  183  7e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  33.59 
 
 		 429 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  30.63 
 
 		 459 aa  180  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  31.41 
 
 		 445 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  31.94 
 
 		 453 aa  178  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  31.22 
 
 		 445 aa  176  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  29.63 
 
 		 432 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  31.66 
 
 		 431 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  29.98 
 
 		 460 aa  172  9e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  29.41 
 
 		 445 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  30.45 
 
 		 469 aa  171  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  30.79 
 
 		 452 aa  168  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3985  cytochrome P450  32.41 
 
 		 449 aa  168  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0434  cytochrome P450-related protein  29.79 
 
 		 430 aa  167  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  31.68 
 
 		 489 aa  166  9e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  32.23 
 
 		 455 aa  166  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  33.07 
 
 		 474 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  33.07 
 
 		 474 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  33.07 
 
 		 453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  29.44 
 
 		 457 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  29.31 
 
 		 444 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4026  cytochrome P450  32.85 
 
 		 468 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210048 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  30.5 
 
 		 439 aa  160  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  31.57 
 
 		 453 aa  159  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3258  cytochrome P450  30.08 
 
 		 452 aa  159  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  0.462712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  34.89 
 
 		 452 aa  159  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3643  cytochrome P450  28.44 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.347687  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3868  putative cytochrome P450  27.64 
 
 		 473 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2191  cytochrome P450  29.46 
 
 		 454 aa  156  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2143  cytochrome P450  29.79 
 
 		 454 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0858  cytochrome P450  32.8 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495713 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  29.57 
 
 		 446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1139  cytochrome P450  29.72 
 
 		 473 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>