34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0030 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0030  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  29.78 
 
 		 231 aa  92  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  28.31 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  29.86 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  28.57 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  28.57 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  28.57 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  28.7 
 
 		 233 aa  85.9  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  28 
 
 		 231 aa  85.5  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  28 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  29.52 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  29.41 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  27.8 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  27.8 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  27.35 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  27.88 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  27.8 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  26.94 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  30.48 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  28.57 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  27.85 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  28.07 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  29.17 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3584  RES domain-containing protein  28.17 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.287485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3064  RES domain protein  26.76 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  27.54 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  25.11 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2907  hypothetical protein  25.45 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26280  hypothetical protein  26.2 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4483  hypothetical protein  30.09 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2207  hypothetical protein  23.74 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00851405  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2891  hypothetical protein  26.67 
 
 		 233 aa  45.8  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3924  hypothetical protein  25.79 
 
 		 232 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0245  hypothetical protein  24.75 
 
 		 221 aa  42.4  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>