40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1825 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1825  hypothetical protein  100 
 
 		 608 aa  1202    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949516  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3457  hypothetical protein  69.41 
 
 		 611 aa  465  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.801555  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1182  hypothetical protein  65.12 
 
 		 640 aa  432  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1427  hypothetical protein  68.49 
 
 		 476 aa  288  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4981  hypothetical protein  53.46 
 
 		 418 aa  209  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000575205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1691  hypothetical protein  47.58 
 
 		 360 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10741  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1417  hypothetical protein  47.14 
 
 		 360 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237583  normal  0.104082 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1413  hypothetical protein  47.42 
 
 		 360 aa  198  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.328656  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1994  hypothetical protein  48.83 
 
 		 544 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2598  hypothetical protein  49.55 
 
 		 554 aa  197  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2767  hypothetical protein  44.93 
 
 		 455 aa  193  9e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7311  hypothetical protein  49.75 
 
 		 555 aa  191  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6575  hypothetical protein  49.75 
 
 		 555 aa  191  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2013  hypothetical protein  49.75 
 
 		 555 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3078  hypothetical protein  45.13 
 
 		 358 aa  190  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.183188 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0512  hypothetical protein  42.13 
 
 		 278 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0509  hypothetical protein  42.13 
 
 		 278 aa  183  8.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3921  hypothetical protein  45.76 
 
 		 433 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4090  hypothetical protein  45.76 
 
 		 433 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4297  hypothetical protein  48.26 
 
 		 555 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3522  hypothetical protein  45 
 
 		 336 aa  168  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136391  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2123  hypothetical protein  47.52 
 
 		 455 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140853  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0587  hypothetical protein  53.44 
 
 		 1097 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3719  IS66 Orf2 family protein  53.64 
 
 		 423 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0269  hypothetical protein  44.25 
 
 		 117 aa  106  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0920  hypothetical protein  40.28 
 
 		 238 aa  104  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0791  hypothetical protein  45.28 
 
 		 232 aa  100  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3627  hypothetical protein  44.64 
 
 		 246 aa  94.4  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1989  hypothetical protein  43.2 
 
 		 150 aa  94.4  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.0000737355  normal  0.0314361 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1647  hypothetical protein  48.18 
 
 		 235 aa  90.5  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3172  hypothetical protein  52.68 
 
 		 233 aa  90.1  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2162  hypothetical protein  39.64 
 
 		 235 aa  89.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.683012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3059  hypothetical protein  38.21 
 
 		 307 aa  77  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1121  hypothetical protein  43.69 
 
 		 243 aa  75.9  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.666751  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2886  hypothetical protein  45.35 
 
 		 240 aa  69.3  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0470567  normal  0.128421 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3133  hypothetical protein  37.96 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0163555  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0745  hypothetical protein  24.77 
 
 		 118 aa  52  0.00004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0294492  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  33.33 
 
 		 525 aa  50.4  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0324  hypothetical protein  22.94 
 
 		 117 aa  47.8  0.0005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00000000426021  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1095  hypothetical protein  30.51 
 
 		 341 aa  45.4  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>