61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1526 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1526  import inner membrane translocase, subunit Tim44  100 
 
 		 332 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.496585  normal  0.854494 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2567  import inner membrane translocase, subunit Tim44  66.47 
 
 		 312 aa  349  4e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2165  hypothetical protein  66.47 
 
 		 312 aa  344  2e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4404  import inner membrane translocase subunit Tim44  68.44 
 
 		 337 aa  342  4e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583271  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1701  import inner membrane translocase, subunit Tim44  69.35 
 
 		 331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3768  import inner membrane translocase, subunit Tim44  69.44 
 
 		 338 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5490  hypothetical protein  59.48 
 
 		 325 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2211  import inner membrane translocase subunit Tim44  52.01 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal  0.192893 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2529  import inner membrane translocase subunit Tim44  49.67 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5842  import inner membrane translocase subunit Tim44  49.3 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2254  import inner membrane translocase subunit Tim44  49.83 
 
 		 319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.349216  normal  0.0696359 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2207  import inner membrane translocase subunit Tim44  49.39 
 
 		 329 aa  181  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  42.01 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.137155 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6540  import inner membrane translocase subunit Tim44  38.17 
 
 		 332 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398166  normal  0.199544 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6128  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.88 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.280335 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1921  import inner membrane translocase subunit Tim44  38.28 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.464054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5103  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.65 
 
 		 316 aa  162  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0551  import inner membrane translocase subunit Tim44  49.15 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031829 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3268  import inner membrane translocase subunit Tim44  40.06 
 
 		 325 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3590  hypothetical protein  40.45 
 
 		 270 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1269  hypothetical protein  36.63 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0311  import inner membrane translocase subunit Tim44  50 
 
 		 320 aa  138  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1858  import inner membrane translocase subunit Tim44  39.39 
 
 		 333 aa  132  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767036  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  31.27 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1788  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.91 
 
 		 341 aa  82.8  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000825798  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0901  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.15 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000201824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.78 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.99 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.73 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3566  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.3 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000205074  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.87 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0375  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.77 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2938  import inner membrane translocase subunit Tim44  32.2 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000555932  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0544  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.51 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3295  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.89 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081668  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1898  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.62 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.859506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2731  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.99 
 
 		 343 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767216  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2758  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.99 
 
 		 343 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2119  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.99 
 
 		 343 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434025  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0568  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.8 
 
 		 340 aa  53.1  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0554  Tim44-like domain-contain protein  27.11 
 
 		 340 aa  52.8  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2649  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.46 
 
 		 344 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.331938  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2096  hypothetical protein  27.06 
 
 		 318 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0739383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.85 
 
 		 344 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1110  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.35 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.354142  normal  0.0303721 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6058  putative transporter  27.38 
 
 		 344 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0650  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.11 
 
 		 330 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.983868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4117  import inner membrane translocase subunit Tim44  21.86 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4001  import inner membrane translocase subunit Tim44  22.16 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0214  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.14 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.525387  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3925  import inner membrane translocase subunit Tim44  22.46 
 
 		 287 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2399  hypothetical protein  27.55 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0845  transmembrane protein  26.73 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0187  hypothetical protein  27.55 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2319  hypothetical protein  27.55 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2759  hypothetical protein  27.55 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0684  Tim44-like domain-containing protein  27.03 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0668  Tim44-like domain-containing protein  26.63 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4024  import inner membrane translocase subunit Tim44  21.86 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.149443  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4049  hypothetical protein  28.4 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631655 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2065  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.17 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0100272 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>