232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1085 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2095  carbon starvation protein CstA  76.96 
 
 		 604 aa  919    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.497716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3948  carbon starvation protein CstA  76.2 
 
 		 603 aa  957    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3001  carbon starvation protein CstA  78.67 
 
 		 603 aa  957    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1085  carbon starvation protein CstA  100 
 
 		 605 aa  1214    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0268  carbon starvation protein CstA  76.2 
 
 		 603 aa  956    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3644  carbon starvation protein CstA  76.2 
 
 		 603 aa  957    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1963  carbon starvation protein CstA  51.42 
 
 		 606 aa  584  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.929114 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1227  carbon starvation protein CstA  49.59 
 
 		 603 aa  582  1e-164  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454995 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0897  carbon starvation protein CstA  52.38 
 
 		 589 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2696  carbon starvation protein CstA  48.33 
 
 		 615 aa  549  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2790  carbon starvation protein CstA  48.41 
 
 		 615 aa  551  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2387  carbon starvation protein CstA  46.5 
 
 		 647 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2158  carbon starvation protein CstA  47.31 
 
 		 614 aa  533  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00428964  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3580  carbon starvation protein CstA  48.41 
 
 		 615 aa  534  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.863613  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0575  carbon starvation protein A  46.11 
 
 		 642 aa  514  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2948  carbon starvation protein CstA  45.62 
 
 		 642 aa  511  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0669407 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3960  carbon starvation protein CstA  47.17 
 
 		 613 aa  504  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0153587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2163  carbon starvation protein CstA  48.48 
 
 		 613 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3619  carbon starvation protein CstA  44.62 
 
 		 681 aa  450  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186111  normal  0.595383 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0598  carbon starvation protein CstA  43.16 
 
 		 692 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1403  carbon starvation protein CstA  44.05 
 
 		 691 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1399  carbon starvation protein CstA  44.9 
 
 		 695 aa  444  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  43.59 
 
 		 692 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2607  carbon starvation protein CstA  44.76 
 
 		 691 aa  439  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0334  carbon starvation protein CstA  44.72 
 
 		 689 aa  436  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5210  carbon starvation protein CstA  43.97 
 
 		 691 aa  436  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0097  carbon starvation protein CstA  42.23 
 
 		 692 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  42.41 
 
 		 692 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1572  carbon starvation protein CstA  44.24 
 
 		 723 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487074  normal  0.864906 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2942  carbon starvation protein CstA  44.09 
 
 		 696 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1551  carbon starvation protein CstA  43.94 
 
 		 696 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  42.41 
 
 		 692 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4884  carbon starvation protein CstA  42.58 
 
 		 692 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393748  normal  0.287345 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  42.41 
 
 		 692 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5434  carbon starvation protein CstA  42.43 
 
 		 692 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1708  carbon starvation protein CstA  42.05 
 
 		 690 aa  424  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.727328  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1294  carbon starvation protein A  42.63 
 
 		 692 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.712641  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2252  carbon starvation protein A  42.45 
 
 		 692 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1741  carbon starvation protein CstA  40.78 
 
 		 688 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6471  carbon starvation protein CstA  42.41 
 
 		 692 aa  423  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333661 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3245  carbon starvation protein CstA  42.23 
 
 		 692 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255181  normal  0.357407 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3065  carbon starvation protein CstA  42.63 
 
 		 692 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2939  carbon starvation protein CstA  42.63 
 
 		 692 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3929  carbon starvation protein CstA  45.05 
 
 		 691 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7759  carbon starvation protein CstA  41.9 
 
 		 692 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2017  carbon starvation protein CstA  40.17 
 
 		 688 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121466  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1905  carbon starvation protein CstA  40.17 
 
 		 688 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599531  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2639  carbon starvation protein CstA  42.45 
 
 		 685 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455809 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2633  carbon starvation protein CstA  41.93 
 
 		 687 aa  418  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0897  carbon starvation protein A  43.1 
 
 		 703 aa  418  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000953526  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2361  carbon starvation protein CstA  41.27 
 
 		 687 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.13571  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0924  carbon starvation protein A  42.98 
 
 		 703 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000573812  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0995  carbon starvation protein A  42.81 
 
 		 703 aa  415  1e-114  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0500  carbon starvation protein A  42.08 
 
 		 701 aa  413  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1348  carbon starvation protein A  41.95 
 
 		 701 aa  414  1e-114  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.401846  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0618  carbon starvation protein A  41.73 
 
 		 701 aa  412  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4228  carbon starvation protein CstA  41.41 
 
 		 687 aa  412  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1025  putative carbon starvation A transmembrane protein  41.92 
 
 		 688 aa  412  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2243  carbon starvation protein CstA  40 
 
 		 688 aa  414  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0770165 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3028  carbon starvation protein CstA  41.73 
 
 		 701 aa  412  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0683  carbon starvation protein A  41.73 
 
 		 701 aa  412  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.720109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3046  carbon starvation protein CstA  41.73 
 
 		 701 aa  412  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2451  carbon starvation protein CstA  41.09 
 
 		 686 aa  411  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.397179  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0649  carbon starvation protein A  41.73 
 
 		 701 aa  412  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0422  carbon starvation protein CstA  43.93 
 
 		 707 aa  410  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0618  carbon starvation protein A  41.73 
 
 		 701 aa  412  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0712  carbon starvation protein A  42.11 
 
 		 701 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0319605  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1938  carbon starvation protein CstA  41.99 
 
 		 738 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.121526 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0758  carbon starvation protein A  42.11 
 
 		 701 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.544793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0639  carbon starvation protein A  42.11 
 
 		 701 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1130  carbon starvation protein CstA  41.55 
 
 		 701 aa  410  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.899607 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0653  carbon starvation protein A  42.11 
 
 		 701 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0696  carbon starvation protein A  42.11 
 
 		 701 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0379562 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3378  carbon starvation protein CstA  44.67 
 
 		 745 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.360785  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0798  carbon starvation protein CstA  40.97 
 
 		 688 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3982  carbon starvation protein CstA  42.5 
 
 		 688 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5411  carbon starvation protein A  44.69 
 
 		 692 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3417  carbon starvation protein CstA  42.1 
 
 		 690 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5540  carbon starvation protein A  44.4 
 
 		 691 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.298925  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0582  carbon starvation protein CstA  39.51 
 
 		 726 aa  408  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0511  carbon starvation protein CstA  37.54 
 
 		 717 aa  407  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0401595 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2627  carbon starvation protein CstA  41.46 
 
 		 682 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.61212  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0022  carbon starvation A transmembrane protein  41.21 
 
 		 686 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0699392  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5545  carbon starvation protein A  44.51 
 
 		 691 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5269  carbon starvation protein A  44.32 
 
 		 691 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5096  carbon starvation protein A  44.32 
 
 		 691 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0266106  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5113  carbon starvation protein A  44.51 
 
 		 691 aa  402  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08610  carbon starvation protein, predicted membrane protein  41.29 
 
 		 753 aa  403  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2468  carbon starvation protein CstA  44 
 
 		 756 aa  404  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1979  carbon starvation protein CstA  41.45 
 
 		 685 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.55888 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1089  carbon starvation protein CstA  38.96 
 
 		 717 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4785  carbon starvation family protein  36.57 
 
 		 716 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.741257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4886  carbon starvation family protein  36.57 
 
 		 716 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4945  carbon starvation family protein  36.57 
 
 		 716 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.51042 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4859  carbon starvation family protein  36.57 
 
 		 716 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3712  carbon starvation protein CstA  36.42 
 
 		 716 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.356115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5511  carbon starvation protein A  44.32 
 
 		 691 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4894  carbon starvation family protein  36.42 
 
 		 704 aa  403  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3404  carbon starvation protein CstA  41.56 
 
 		 684 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4635  carbon starvation protein CstA  41 
 
 		 688 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151575  normal  0.995482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>