293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0477 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0477  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.981594  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  69.43 
 
 		 263 aa  353  1e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  70.72 
 
 		 262 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  70.61 
 
 		 259 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  71.1 
 
 		 260 aa  330  2e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0597  hypothetical protein  70.23 
 
 		 259 aa  325  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0054  hypothetical protein  69.38 
 
 		 253 aa  324  8.000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  58.05 
 
 		 201 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  56.57 
 
 		 238 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1050  hypothetical protein  56.45 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  56.38 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  48.66 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2298  protein of unknown function DUF150  58.96 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.022015 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  57.87 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4070  hypothetical protein  47.42 
 
 		 201 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3438  hypothetical protein  51.93 
 
 		 205 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3927  hypothetical protein  52.84 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4390  hypothetical protein  47.12 
 
 		 201 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  56.11 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  56.11 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0164  hypothetical protein  49.12 
 
 		 204 aa  182  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2162  hypothetical protein  47.03 
 
 		 219 aa  178  9e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2074  hypothetical protein  47.03 
 
 		 219 aa  178  9e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1251  hypothetical protein  44.71 
 
 		 209 aa  178  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0750  hypothetical protein  47.43 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251451  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  46.33 
 
 		 206 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  45.61 
 
 		 204 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  45.61 
 
 		 204 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  45.66 
 
 		 203 aa  151  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  44.51 
 
 		 194 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  45.03 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  50.92 
 
 		 207 aa  146  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3625  hypothetical protein  43.48 
 
 		 207 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443103 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  44.05 
 
 		 196 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  47.77 
 
 		 199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3778  hypothetical protein  43.95 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0222  hypothetical protein  46.88 
 
 		 201 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  44.51 
 
 		 178 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3820  hypothetical protein  44.3 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646345  normal  0.0215546 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0609  hypothetical protein  40.57 
 
 		 181 aa  110  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2493  hypothetical protein  40.24 
 
 		 186 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0301958  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  41.06 
 
 		 176 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  39.72 
 
 		 151 aa  99.8  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  34.72 
 
 		 140 aa  96.3  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  36.36 
 
 		 158 aa  93.6  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  34.03 
 
 		 150 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  36 
 
 		 153 aa  92.8  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  34.03 
 
 		 150 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  34.03 
 
 		 150 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  34.03 
 
 		 154 aa  92  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  34.03 
 
 		 154 aa  92  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  34 
 
 		 152 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  34 
 
 		 152 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  33.33 
 
 		 154 aa  90.5  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  32.82 
 
 		 152 aa  90.9  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  32.14 
 
 		 151 aa  90.9  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  32.86 
 
 		 154 aa  90.9  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  34.03 
 
 		 150 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  34.03 
 
 		 150 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  34.03 
 
 		 150 aa  90.1  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  34.03 
 
 		 150 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  34.03 
 
 		 150 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  34.03 
 
 		 150 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  33.82 
 
 		 151 aa  89.7  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  36.42 
 
 		 151 aa  89.7  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  32.67 
 
 		 159 aa  89.4  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  35.14 
 
 		 152 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  34.51 
 
 		 153 aa  89.4  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  34.03 
 
 		 140 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  34.03 
 
 		 154 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  34.03 
 
 		 154 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  31.43 
 
 		 151 aa  89.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  35.14 
 
 		 169 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  33.09 
 
 		 150 aa  89  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  37.91 
 
 		 161 aa  88.2  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  34.46 
 
 		 169 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  32.37 
 
 		 150 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  34.46 
 
 		 169 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  36.6 
 
 		 159 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  32.64 
 
 		 150 aa  87  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  32.64 
 
 		 150 aa  87  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  32.64 
 
 		 150 aa  87  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  35.1 
 
 		 154 aa  87  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  33.33 
 
 		 140 aa  87  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  34.97 
 
 		 150 aa  86.7  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  35.4 
 
 		 171 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  86.3  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1944  hypothetical protein  33.55 
 
 		 154 aa  85.9  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1662  hypothetical protein  32.89 
 
 		 154 aa  85.5  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  34.78 
 
 		 171 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  37.58 
 
 		 159 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  36.72 
 
 		 152 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  28.76 
 
 		 153 aa  84.3  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  33.33 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1227  protein of unknown function DUF150  36.49 
 
 		 171 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0389  lipoprotein, putative  38.41 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.281265  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  33.11 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  38.41 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  33.77 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>