More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2742 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2957  methanol dehydrogenase, NAD-dependent  89.82 
 
 		 384 aa  710    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0476972  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2742  Iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 384 aa  787    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0794554  normal  0.0588178 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0678  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.16 
 
 		 389 aa  482  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2204  hypothetical protein  52.79 
 
 		 386 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2176  hypothetical protein  52.25 
 
 		 386 aa  420  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2792  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.4 
 
 		 392 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413135  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2530  alcohol dehydrogenase  48.56 
 
 		 388 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2103  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.91 
 
 		 388 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158602  normal  0.562089 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.31 
 
 		 383 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0681  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 		 381 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2128  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.18 
 
 		 381 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.705476  normal  0.429829 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.44 
 
 		 398 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.39 
 
 		 381 aa  353  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.50517  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2891  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.19 
 
 		 383 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2945  dehydrogenase  43.05 
 
 		 381 aa  340  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2317  Iron-containing alcohol dehydrogenase  41.58 
 
 		 381 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735115  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0991  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.58 
 
 		 381 aa  334  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4549  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.82 
 
 		 381 aa  334  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3883  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.3 
 
 		 390 aa  328  7e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5983  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0687  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.41 
 
 		 389 aa  324  2e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.377875  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0734  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.15 
 
 		 389 aa  322  5e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.434692  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1612  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.58 
 
 		 381 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2394  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.7 
 
 		 389 aa  287  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49580  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.7 
 
 		 393 aa  279  7e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.9 
 
 		 392 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.5015 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4700  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.18 
 
 		 377 aa  236  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.38 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.24 
 
 		 377 aa  232  9e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.69 
 
 		 394 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0109  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.86 
 
 		 378 aa  229  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.9 
 
 		 389 aa  229  8e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.73 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  34.73 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6101  dehydrogenase  36.87 
 
 		 370 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  35.42 
 
 		 381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  35.25 
 
 		 382 aa  220  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2864  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.67 
 
 		 378 aa  220  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1435  Alcohol dehydrogenase  35.17 
 
 		 382 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0578775 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2526  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.01 
 
 		 378 aa  219  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00912528 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3418  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.07 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 		 382 aa  217  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1476  Alcohol dehydrogenase  35.7 
 
 		 382 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3155  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.84 
 
 		 380 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6426  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.55 
 
 		 376 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.02 
 
 		 380 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1316  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  34.91 
 
 		 382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  35.4 
 
 		 382 aa  216  8e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2157  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.02 
 
 		 380 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 		 387 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.85 
 
 		 382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 		 387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2655  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  35.34 
 
 		 382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 		 382 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 		 382 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.63 
 
 		 382 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  32.99 
 
 		 385 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 		 387 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.37 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1646  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.71 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627044  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  32.99 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0445  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  35.71 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.37 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1435  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  35.71 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0905  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  35.71 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1823  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  35.71 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.34 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.92 
 
 		 388 aa  210  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0717  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  35.71 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1668  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.71 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.37 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.37 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.37 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.88 
 
 		 382 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.88 
 
 		 382 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.75 
 
 		 387 aa  209  7e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.63 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1418  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.92 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.909336  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 		 387 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  34.63 
 
 		 382 aa  207  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.1 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3383  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.48 
 
 		 378 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469103  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 		 388 aa  206  6e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0986  putative NAD-dependent 4-hyddoxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  34.82 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.76 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4502  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.47 
 
 		 378 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.49519  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.66 
 
 		 378 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0063  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.51 
 
 		 379 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 		 383 aa  204  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3465  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.04 
 
 		 377 aa  203  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.117346  normal  0.139258 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.59 
 
 		 384 aa  203  5e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1609  alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 		 382 aa  202  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  34.46 
 
 		 383 aa  202  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 		 383 aa  202  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 		 383 aa  202  8e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>